par1_human

NAME

3VW7

ORGANISM

Human (Homo sapiens)

PROTEIN NAME

par1_human

SOURCE

SWISSPROT

SEQUENCE

Perspective: Wild-type Construct

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
N-term        
M
G
P
R
R
L
L
L
V
A
10
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
A
C
F
S
L
C
G
P
L
L
20
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
S
A
R
T
R
A
R
R
P
E
30
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
S
K
A
T
N
A
T
L
D
P
40
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
R
S
F
L
L
R
N
P
N
D
50
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
K
Y
E
P
F
W
E
D
E
E
60
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
K
N
E
S
G
L
T
E
Y
R
70
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
L
V
S
I
N
K
S
S
P
L
80
 
 
 
 
 
          
                   
Q
K
Q
L
P
A
F
I
S
E
90
                   
                   
D
A
S
G
Y
L
T
S
S
W
100
                   
TM1              
L
T
L
F
V
P
S
V
Y
T
110
                   
                   
G
V
F
V
V
S
L
P
L
N
120
                   
                   
I
M
A
I
V
V
F
I
L
K
130
                   
ICL1 TM2      
M
K
V
K
K
P
A
V
V
Y
140
                   
                   
M
L
H
L
A
T
A
D
V
L
150
                   
                   
F
V
S
V
L
P
F
K
I
S
160
                   
        ECL1    
Y
Y
F
S
G
S
D
W
Q
F
170
                   
TM3              
G
S
E
L
C
R
F
V
T
A
180
                   
                   
A
F
Y
C
N
M
Y
A
S
I
190
                   
                   
L
L
M
T
V
I
S
I
D
R
200
                   
            ICL2
F
L
A
V
V
Y
P
M
Q
S
210
                   
        TM4      
L
S
W
R
T
L
G
R
A
S
220
                   
                   
F
T
C
L
A
I
W
A
L
A
230
                   
                   
I
A
G
V
V
P
L
L
L
K
240
                 
 
ECL2            
E
Q
T
I
Q
V
P
G
L
N
250
               
 
  
                   
I
T
T
C
H
D
V
L
N
E
260
                   
      TM5        
T
L
L
E
G
Y
Y
A
Y
Y
270
                   
                   
F
S
A
F
S
A
V
F
F
F
280
                   
                   
V
P
L
I
I
S
T
V
C
Y
290
                   
                   
V
S
I
I
R
C
L
S
S
S
300
 
 
 
              
ICL3 TM6      
A
V
A
N
R
S
K
K
S
R
310
                   
                   
A
L
F
L
S
A
A
V
F
C
320
                   
                   
I
F
I
I
C
F
G
P
T
N
330
                   
                   
V
L
L
I
A
H
Y
S
F
L
340
                   
ECL3   TM7    
S
H
T
S
T
T
E
A
A
Y
350
                   
                   
F
A
Y
L
L
C
V
C
V
S
360
                   
                   
S
I
S
C
C
I
D
P
L
I
370
                   
        H8        
Y
Y
Y
A
S
S
E
C
Q
R
380
                   
                   
Y
V
Y
S
I
L
C
C
K
E
390
         
 
 
 
 
 
C-term        
S
S
D
P
S
S
Y
N
S
S
400
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
G
Q
L
M
A
S
K
M
D
T
410
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
                   
C
S
S
N
L
N
N
S
I
Y
420
 
 
 
 
 
         
K
K
L
L
T
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
hemagglutin
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
FLAG            
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
TEV proteas
 
                  
  N-term      
 
A
F
I
S
E
D
A
S
G
94
                   
        TM1      
Y
L
T
S
S
W
L
T
L
F
104
                   
                   
V
P
S
V
Y
T
G
V
F
V
114
                   
                   
V
S
L
P
L
N
I
M
A
I
124
                   
            ICL1
V
V
F
I
L
K
M
K
V
K
134
                   
TM2              
K
P
A
V
V
Y
M
L
H
L
144
                   
                   
A
T
A
D
V
L
F
V
S
V
154
                   
                   
L
P
F
K
I
S
Y
Y
F
S
164
                   
ECL1     TM3  
G
S
D
W
Q
F
G
S
E
L
174
                   
                   
C
R
F
V
T
A
A
F
Y
C
184
                   
                   
N
M
Y
A
S
I
L
L
M
T
194
                   
                   
V
I
S
I
D
R
F
L
A
V
204
                   
    ICL2        
V
Y
P
M
Q
S
L
S
W
R
214
                   
TM4              
T
L
G
R
A
S
F
T
C
L
224
                   
                   
A
I
W
A
L
A
I
A
G
V
234
                   
            ECL2
V
P
L
L
L
K
E
Q
T
I
244
         
 
        
                   
Q
V
P
G
L
G
I
T
T
C
254
       
 
          
                   
H
D
V
L
S
E
T
L
L
E
264
                   
TM5              
G
Y
Y
A
Y
Y
F
S
A
F
274
                   
                   
S
A
V
F
F
F
V
P
L
I
284
                   
                   
I
S
T
V
C
Y
V
S
I
I
294
           
          ICL3
R
C
L
S
S
S
300
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
            
      TM6      
A
 
A
N
R
S
K
K
S
309
                   
                   
R
A
L
F
L
S
A
A
V
F
319
                   
                   
C
I
F
I
I
C
F
G
P
T
329
                   
                   
N
V
L
L
I
A
H
Y
S
F
339
                   
  ECL3   TM7  
L
S
H
T
S
T
T
E
A
A
349
                   
                   
Y
F
A
Y
L
L
C
V
C
V
359
                   
                   
S
S
I
S
C
C
I
D
P
L
369
                   
          H8      
I
Y
Y
Y
A
S
S
E
C
Q
379
                   
                   
R
Y
V
Y
S
I
L
C
C
K
389
           
 
C-term
E
S
S
D
P
S
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
His(10)      

SCHEMATIC

Perspective: Wild-type Construct

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
N-term
 
TM1
 
ICL1
 
TM2
 
ECL1
 
TM3
 
ICL2
 
TM4
 
 
 
 
 
ECL2
 
TM5
 
 
 
 
ICL3
 
TM6
 
ECL3
 
TM7
 
H8
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
C-term

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
hemagg
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
FLAG
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
TEV pr
 
 
 N-term
 
TM1
 
ICL1
 
TM2
 
ECL1
 
TM3
 
ICL2
 
TM4
 
 
 
 
 
ECL2
 
TM5
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
T4 Lys
 
 
 
 
 
ICL3
 
TM6
 
ECL3
 
TM7
 
H8
 
 
C-term 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
His(10


DIAGRAMS

ICL1 M K V K ICL1ECL1 G S D W Q F ECL1ICL2 P M Q S L S W R ICL2ECL2 E Q T I Q V P G L N I T T C H D V L N E T L L ECL2ICL3 S A V A ICL3ECL3 S H T S T ECL3N-term M G P R R L L L V A A C F S L C G P L L S A R T R A R R P E S K A T N A T L D P R S F L L R N P N D K Y E P F W E D E E K N E S G L T E Y R L V S I N K S S P L Q K Q L P A F I S E D A S G Y L T S N-termC-term E S S D P S S Y N S S G Q L M A S K M D T C S S N L N N S I Y K K L L T C-term S W L T L F V P S V Y T G V F V V S L P L N I M A I V V F I L K K P A V V Y M L H L A T A D V L F V S V L P F K I S Y Y F S G S E L C R F V T A A F Y C N M Y A S I L L M T V I S I D R F L A V V Y T L G R A S F T C L A I W A L A I A G V V P L L L K E G Y Y A Y Y F S A F S A V F F F V P L I I S T V C Y V S I I R C L S S N R S K K S R A L F L S A A V F C I F I I C F G P T N V L L I A H Y S F L T E A A Y F A Y L L C V C V S S I S C C I D P L I Y Y Y A S S E V Y S K C Q R Y I L C C

MUTATIONS

Position Wild-type Mutated
250 |  N G
259 |  N S

DELETIONS

  • from 1 to 85
  • from 302 to 302
  • from 396 to 425

    • MODIFICATIONS


    AUXILIARY PROTEINS

    Protein_type: signal

    Name: hemagglutinin
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: N-term_0 None:None
    Presence in Crystal:YES
    Remarks: None

    Protein_type: tag

    Name: FLAG
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: N-term_1 None:None
    Presence in Crystal:YES
    Remarks: None

    Protein_type: prot_cleavage

    Name: TEV protease
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: N-term_2 85:85
    Presence in Crystal:YES
    Remarks: None

    Protein_type: fusion

    Name: T4 Lysozyme (T4L)
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: Within Receptor_3 301:303
    Presence in Crystal:YES
    Remarks: None

    Protein_type: tag

    Name: His(10)
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: C-term_4 None:None
    Presence in Crystal:YES
    Remarks: None

    EXPRESSION

    Expression method Host cell type Host cell Remarks
    Baculovirus Sf9 Insect pFastBac1

    SOLUBILIZATION

    Solvent type Item Concentration
    detergent DDM 1.0 %w/v
    additive CHS 0.03 %w/v
    additive sodium cholate 0.2 %w/v

    Remarks:

    PURIFICATION

    Purification type Description
    Alkylation by Iodoacetamide None
    Proteolysis by TEV protease None

    Remarks:None

    CRYSTALLIZATION

    METHOD: in meso/LCP
    TYPE: lipidic cubic phase (LCP) (monoolein (9.9 MAG))
    PROTEIN CONCENTRATION: 40-50 mg/ml
    Temperature: 20°C
    ph : 6.0-6.5

    Remarks: The protein was mixed with monoolein and cholesterol (10:1 by mass) using the two syringe mixing method by weight of 1:1.5 (protein:lipid).

    Chemical lists

    Type Item Concentration
    Additional
    unknown Sodium Chloride 0.1-0.2 M
    unknown Sodium Phosphate pH 6.0-6.5 100 mM
    unknown PEG 300 25-35 %
    Detergent
    detergent DDM 0.1 % w/v
    Lipid
    lipid CHS 0.02 %w/v