oprx_human

NAME

5DHG

ORGANISM

Human (Homo sapiens)

PROTEIN NAME

oprx_human

SOURCE

SWISSPROT

SEQUENCE

Perspective: Wild-type Construct

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
N-term        
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PreScission
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
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SCHEMATIC

Perspective: Wild-type Construct

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
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PreSci
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
His(10


DIAGRAMS

ICL1 T K M K ICL1ECL1 F W P F ECL1ICL2 P I R A L D V R ICL2ECL2 S A Q V E D E E I E C L V E I P T ECL2ICL3 R L L S G ICL3ECL3 V Q P S ECL3N-term M E P L F P A P F W E V I Y G S H L Q G N L S L L S P N H S L L P P H L L L N A S H G A F L P N-termC-term A S A L R R D V Q V S D R V R S I A K D V A L A C K T S E T V P R P A C-term L G L K V T I V G L Y L A V C V G G L L G N C L V M Y V I L R H T A T N I Y I F N L A L A D T L V L L T L P F Q G T D I L L G G N A L C K T V I A I D Y Y N M F T S T F T L T A M S V D R Y V A I C H T S S K A Q A V N V A I W A L A S V V G V P V A I M G P Q D Y W G P V F A I C I F L F S F I V P V L V I S V C Y S L M I R R L R G V S R E K D R N L R R I T R L V L V V V A V F V G C W T P V Q V F V L A Q G L G S E T A V A I L R F C T A L G Y V N S C L N P I L Y A F L D E N F R K F K A C F C C

MUTATIONS

Position Wild-type Mutated

DELETIONS

  • from 1 to 42
  • from 340 to 370

  • MODIFICATIONS


    AUXILIARY PROTEINS

    Protein_type: signal

    Name: hemagglutinin
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: N-term_0 None:None
    Presence in Crystal:NO
    Remarks: None

    Protein_type: tag

    Name: FLAG
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: N-term_1 None:None
    Presence in Crystal:YES
    Remarks: None

    Protein_type: fusion

    Name: BRIL (b562RIL)
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: N-term_2 None:None
    Presence in Crystal:YES
    Remarks: None

    Protein_type: prot_cleavage

    Name: PreScission site
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: C-term_3 None:None
    Presence in Crystal:YES
    Remarks: None

    Protein_type: tag

    Name: His(10)
    Sequence: None
    Deletions:
    Positions: C-term_4 None:None
    Presence in Crystal:YES
    Remarks: None

    EXPRESSION

    Expression method Host cell type Host cell Remarks
    Baculovirus Sf9 Insect Bac-to-Bac system

    SOLUBILIZATION

    Solvent type Item Concentration
    additive CHS 0.1 %w/v
    detergent DDM 0.5 %w/v

    Remarks:

    PURIFICATION

    Purification type Description
    Alkylation by Iodoacetamide None

    Remarks:None

    CRYSTALLIZATION

    METHOD: in meso/LCP
    TYPE: lipidic cubic phase (LCP) (monoolein (9.9 MAG))
    PROTEIN CONCENTRATION: 40 mg/ml
    Temperature: 20°C
    ph : 6.4-6.4

    Remarks:

    Chemical lists

    Type Item Concentration
    Additional
    unknown PEG 400 25-35 % v/v
    unknown potassium sodium tartrate tetrahydrate 130-200 mM
    unknown Bis-Tris propane (pH 6.4) 100 mM
    Detergent
    unknown DDM 0.025 %w/v
    Lipid
    unknown CHS 0.005 %w/v