Rhodopsin (opsd_scyca)
FAMILY
Class A (Rhodopsin) Sensory receptors Opsins Rhodopsin
GENE
rho
ORGANISM
Small-spotted catshark (Scyliorhinus canicula)
ALT. NAMES
Rhodopsin
SOURCE
SWISSPROT
SEQUENCE
| N-term | |||||||||
|
M
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N
|
G
|
T
|
E
|
G
|
E
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N
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F
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Y
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| 10 | |||||||||
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I
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P
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M
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S
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N
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K
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T
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G
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V
|
V
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| 20 | |||||||||
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R
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S
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P
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F
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D
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Y
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P
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Q
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Y
|
Y
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| 30 | |||||||||
| TM1 | |||||||||
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L
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A
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E
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K
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F
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S
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V
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L
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| 40 | |||||||||
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A
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A
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Y
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M
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F
|
F
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L
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I
|
I
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A
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| 50 | |||||||||
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G
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F
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P
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V
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N
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F
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L
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T
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L
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Y
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| 60 | |||||||||
| ICL1 | |||||||||
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V
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T
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I
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Q
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H
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K
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K
|
L
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R
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Q
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| 70 | |||||||||
| TM2 | |||||||||
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P
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L
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N
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Y
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I
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L
|
L
|
N
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L
|
A
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| 80 | |||||||||
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V
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A
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D
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L
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F
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M
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I
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F
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G
|
G
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| 90 | |||||||||
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F
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P
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S
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T
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M
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I
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T
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S
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M
|
N
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| 100 | |||||||||
| ECL1 | TM3 | ||||||||
|
G
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Y
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F
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V
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F
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G
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P
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S
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G
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C
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| 110 | |||||||||
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N
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F
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E
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G
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F
|
F
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A
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T
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L
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G
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| 120 | |||||||||
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G
|
E
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I
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G
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L
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W
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S
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L
|
V
|
V
|
| 130 | |||||||||
|
L
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A
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I
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E
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R
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Y
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V
|
V
|
V
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C
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| 140 | |||||||||
| ICL2 | |||||||||
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K
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P
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M
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S
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N
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F
|
R
|
F
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G
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S
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| 150 | |||||||||
| TM4 | |||||||||
|
Q
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H
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A
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F
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M
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G
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V
|
G
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L
|
T
|
| 160 | |||||||||
|
W
|
I
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M
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A
|
M
|
A
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C
|
A
|
F
|
P
|
| 170 | |||||||||
| ECL2 | |||||||||
|
P
|
L
|
V
|
G
|
W
|
S
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R
|
Y
|
I
|
P
|
| 180 | |||||||||
|
E
|
G
|
M
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Q
|
C
|
S
|
C
|
G
|
I
|
D
|
| 190 | |||||||||
|
Y
|
Y
|
T
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L
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K
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P
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E
|
V
|
N
|
N
|
| 200 | |||||||||
| TM5 | |||||||||
|
E
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S
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F
|
V
|
I
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Y
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M
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F
|
V
|
V
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| 210 | |||||||||
|
H
|
F
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S
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I
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P
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L
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T
|
I
|
I
|
F
|
| 220 | |||||||||
|
F
|
C
|
Y
|
G
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R
|
L
|
V
|
C
|
T
|
V
|
| 230 | |||||||||
|
K
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E
|
A
|
A
|
A
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Q
|
Q
|
Q
|
E
|
S
|
| 240 | |||||||||
| TM6 | |||||||||
|
E
|
T
|
T
|
Q
|
R
|
A
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E
|
R
|
E
|
V
|
| 250 | |||||||||
|
T
|
R
|
M
|
V
|
I
|
I
|
M
|
V
|
I
|
A
|
| 260 | |||||||||
|
F
|
L
|
I
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C
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W
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L
|
P
|
Y
|
A
|
S
|
| 270 | |||||||||
|
V
|
A
|
F
|
F
|
I
|
F
|
C
|
N
|
Q
|
G
|
| 280 | |||||||||
| ECL3 | TM7 | ||||||||
|
S
|
E
|
F
|
G
|
P
|
I
|
F
|
M
|
T
|
I
|
| 290 | |||||||||
|
P
|
A
|
F
|
F
|
A
|
K
|
A
|
A
|
S
|
L
|
| 300 | |||||||||
|
Y
|
N
|
P
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L
|
I
|
Y
|
I
|
L
|
M
|
N
|
| 310 | |||||||||
| H8 | |||||||||
|
K
|
Q
|
F
|
R
|
N
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C
|
M
|
I
|
T
|
T
|
| 320 | |||||||||
| C-term | |||||||||
|
I
|
C
|
C
|
G
|
K
|
N
|
P
|
F
|
E
|
E
|
| 330 | |||||||||
|
E
|
E
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S
|
T
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S
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A
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S
|
A
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S
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K
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| 340 | |||||||||
|
T
|
E
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A
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S
|
S
|
V
|
S
|
S
|
S
|
Q
|
| 350 | |||||||||
|
V
|
A
|
P
|
A
|
LINKS
DIAGRAMS
Pick color:
Invitro Mutant Data: Increased binding/potency: >5-fold, >10-fold; Reduced binding/potency: >5-fold, >10-fold; No/low effect (<5-fold); and N/A
, 'snake_opsd_scyca.png',
{scale: 3});){kind=link}
, 'snake_opsd_scyca.jpg',
{scale: 3});){kind=link}
Pick color:
Invitro Mutant Data: Increased binding/potency: >5-fold, >10-fold; Reduced binding/potency: >5-fold, >10-fold; No/low effect (<5-fold); and N/A
, 'helixbox_opsd_scyca.png',
{scale: 3});){kind=link}
, 'helixbox_opsd_scyca.jpg',
{scale: 3});){kind=link}
MUTATIONS
ENDOGENOUS LIGANDS
No endogenous ligands available
STRUCTURE MODELS
No structure models available. Check the Archive on Structure models for earlier releases.
STRUCTURES
No structures available