6CM4_refined

PROTEIN CLASS

Class A (Rhodopsin)

RECEPTOR

SPECIES

Homo sapiens

STATE

Inactive (Δ distance (Å): -1.8 docs)

MAIN TEMPLATE

D2 receptor (sequence similarity: 100%) PDB: 6CM4

TEMPLATES

Main template (%) Additional templates (%) No template - freely modelled (%)
Backbone 85.7 7.8 6.5
Side-chains 73.4 14.3 12.3

Number of backbone templates: 4
Number of rotamer templates: 18

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4AMJ
6CM4
3PBL
3SN6
None

PDB file contains GPCRdb generic numbers in the B-factor field of CA atoms

Segment Seq.num. GPCRdb# Backbone Xtal Rotamer Xtal
N-term 26 - - - -
N-term 27 - - - -
N-term 28 - - - -
N-term 29 - - - -
N-term 30 - - - -
TM1 31 1x29 β1-adrenoceptor 4AMJ - -
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TM1 58 1x56 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM1 59 1x57 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM1 60 1x58 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM1 61 1x59 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
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ICL2 147 34x58 - - - -
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TM4 159 4x49 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM4 160 4x50 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM4 161 4x51 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
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TM4 163 4x53 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
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ECL2 179 D2 receptor 6CM4 - -
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ECL2 185 - - - -
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TM5 226 5x75 β2-adrenoceptor 3SN6 - -
ICL3 227 - - - -
ICL3 228 - - - -
ICL3 229 - - - -
ICL3 230 - - - -
ICL3 231 - - - -
ICL3 357 - - - -
ICL3 358 - - - -
ICL3 359 - - - -
ICL3 360 - - - -
ICL3 361 - - - -
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TM7 418 7x45 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM7 419 7x46 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
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C-term 443 - - - -