Short-wave-sensitive opsin 1 (opsb_rat)

FAMILY

Class A (Rhodopsin) Sensory receptors Opsins Short-wave-sensitive opsin 1

GENE

Opn1sw (Bcp)

ORGANISM

Rat (Rattus norvegicus)

ALT. NAMES

Short-wave-sensitive opsin 1, S opsin, Blue cone photoreceptor pigment, Blue-sensitive opsin, BOP, Short wavelength-sensitive cone opsin

SOURCE

SWISSPROT

SEQUENCE

N-term        
M
S
G
E
D
E
F
Y
L
F
10
                   
Q
N
I
S
S
V
G
P
W
D
20
              TM1
G
P
Q
Y
H
I
A
P
V
W
30
                   
A
F
H
L
Q
A
A
F
M
G
40
                   
F
V
F
F
A
G
T
P
L
N
50
                   
A
T
V
L
V
A
T
L
H
Y
60
ICL1 TM2      
K
K
L
R
Q
P
L
N
Y
I
70
                   
L
V
N
V
S
L
G
G
F
L
80
                   
F
C
I
F
S
V
F
T
V
F
90
          ECL1  
I
A
S
C
H
G
Y
F
L
F
100
TM3              
G
R
H
V
C
A
L
E
A
F
110
                   
L
G
S
V
A
G
L
V
T
G
120
                   
W
S
L
A
F
L
A
F
E
R
130
            ICL2
Y
L
V
I
C
K
P
F
G
N
140
      TM4        
I
R
F
N
S
K
H
A
L
T
150
                   
V
V
L
I
T
W
T
I
G
I
160
                   
G
V
S
I
P
P
F
F
G
W
170
ECL2            
S
R
F
I
P
E
G
L
Q
C
180
                   
S
C
G
P
D
W
Y
T
V
G
190
      TM5        
T
K
Y
R
S
E
H
Y
T
W
200
                   
F
L
F
I
F
C
F
I
I
P
210
                   
L
S
L
I
C
F
S
Y
F
Q
220
                   
L
L
R
T
L
R
A
V
A
A
230
    ICL3 TM6  
Q
Q
Q
E
S
A
T
T
Q
K
240
                   
A
E
R
E
V
S
H
M
V
V
250
                   
V
M
V
G
S
F
C
L
C
Y
260
                   
V
P
Y
A
A
L
A
M
Y
M
270
      ECL3      
V
N
N
R
N
H
G
L
Y
L
280
TM7              
R
L
V
T
I
P
A
F
F
S
290
                   
K
S
S
C
V
Y
N
P
I
I
300
        H8        
Y
C
F
M
N
K
Q
F
R
A
310
                   
C
I
L
E
M
V
C
R
K
P
320
C-term        
M
T
D
E
S
D
M
S
G
S
330
                   
Q
K
T
E
V
S
T
V
S
S
340
           
S
K
V
G
P
H

LINKS

DIAGRAMS

A N L P T G A F F V F G M F A A Q L H F 1 V N V S L G G F L F C I F S V F T V F I 2 F A L S W G T V L G A V S G L F A E L A 3 A L T V V L I T W T I G I G V S I P P F 4 Y S F C I L S L P I I F C F I F L F W T Y 5 V V M V G S F C L C Y V P Y A A L A M Y 6 I P N Y V C S S K S F F A P I T V L R 7
Pick color:
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 




Invitro Mutant Data: Increased binding/potency: >5-fold, >10-fold; Reduced binding/potency: >5-fold, >10-fold; No/low effect (<5-fold); and N/A

ICL1 K K L R ICL1ECL1 G Y F L F ECL1ICL2 P F G N I R F ICL2ECL2 G W S R F I P E G L Q C S C G P D W Y T V G T K Y ECL2ICL3 Q E ICL3ECL3 R N H G L ECL3N-term M S G E D E F Y L F Q N I S S V G P W D G P Q Y H I A N-termC-term R K P M T D E S D M S G S Q K T E V S T V S S S K V G P H C-term P V W A F H L Q A A F M G F V F F A G T P L N A T V L V A T L H Y Q P L N Y I L V N V S L G G F L F C I F S V F T V F I A S C H G R H V C A L E A F L G S V A G L V T G W S L A F L A F E R Y L V I C K N S K H A L T V V L I T W T I G I G V S I P P F F R S E H Y T W F L F I F C F I I P L S L I C F S Y F Q L L R T L R A V A A Q Q S A T T Q K A E R E V S H M V V V M V G S F C L C Y V P Y A A L A M Y M V N N Y L R L V T I P A F F S K S S C V Y N P I I Y C F M N K Q I L E F R A C M V C
Pick color:
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 




Invitro Mutant Data: Increased binding/potency: >5-fold, >10-fold; Reduced binding/potency: >5-fold, >10-fold; No/low effect (<5-fold); and N/A

MUTATIONS

ENDOGENOUS LIGANDS

No endogenous ligands available

HOMOLOGY MODELS

No homology models available. Check the Archive on Structure models for earlier releases.

STRUCTURES

No structures available