Rhodopsin (opsd_astfa)

FAMILY

Class A (Rhodopsin) Sensory receptors Opsins Rhodopsin

GENE

rho

ORGANISM

Blind cave fish (Astyanax fasciatus)

ALT. NAMES

Rhodopsin

SOURCE

SWISSPROT

SEQUENCE

N-term        
M
N
G
T
E
G
P
Y
F
Y
10
                   
V
P
M
S
N
A
T
G
V
V
20
                   
R
S
P
Y
E
Y
P
Q
Y
Y
30
    TM1          
L
A
P
P
W
A
Y
A
C
L
40
                   
A
A
Y
M
F
F
L
I
L
V
50
                   
G
F
P
V
N
F
L
T
L
Y
60
          ICL1  
V
T
I
E
H
K
K
L
R
T
70
TM2              
P
L
N
Y
I
L
L
N
L
A
80
                   
V
A
D
L
F
M
V
F
G
G
90
                   
F
T
T
T
M
Y
T
S
L
N
100
ECL1   TM3    
G
Y
F
V
F
G
R
L
G
C
110
                   
N
L
E
G
F
F
A
T
F
G
120
                   
G
I
N
S
L
W
C
L
V
V
130
                   
L
S
I
E
R
W
V
V
V
C
140
  ICL2          
K
P
M
S
N
F
R
F
G
E
150
TM4              
N
H
A
I
M
G
V
A
F
T
160
                   
W
F
M
A
L
A
C
T
V
P
170
      ECL2      
P
L
V
G
W
S
R
Y
I
P
180
                   
E
G
M
Q
C
S
C
G
I
D
190
                   
Y
Y
T
R
A
E
G
F
N
N
200
TM5              
E
S
F
V
I
Y
M
F
V
V
210
                   
H
F
L
T
P
L
F
V
I
T
220
                   
F
C
Y
G
R
L
V
C
T
V
230
                   
K
E
A
A
A
Q
Q
Q
E
S
240
TM6              
E
T
T
Q
R
A
E
R
E
V
250
                   
T
R
M
V
I
L
M
F
I
A
260
                   
Y
L
V
C
W
L
P
Y
A
S
270
                   
V
S
W
W
I
F
T
N
Q
G
280
ECL3 TM7      
S
E
F
G
P
I
F
M
T
V
290
                   
P
A
F
F
A
K
S
S
S
I
300
                   
Y
N
P
V
I
Y
I
C
L
N
310
H8                
K
Q
F
R
H
C
M
I
T
T
320
    C-term    
L
C
C
G
K
N
P
F
E
E
330
                   
E
E
G
A
S
T
T
A
S
K
340
                   
T
E
A
S
S
V
S
S
V
S
350
   
P
A

LINKS

DIAGRAMS

F N V P F G V L I L F F M Y A A L C A Y 1 L N L A V A D L F M V G F G F T T T M Y T 2 V V L C W L S N I G G F T A F F G E L N 3 A I M G V A F T W F M A L A C T V P P L 4 Y C F T I V F L P T L F H V V F M Y I V F 5 I L M F I A Y L V C W L P Y A S V S W W 6 V P N Y I S S S K A F F A P V T M F I 7
Pick color:
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 




Invitro Mutant Data: Increased binding/potency: >5-fold, >10-fold; Reduced binding/potency: >5-fold, >10-fold; No/low effect (<5-fold); and N/A

ICL1 K K L R ICL1ECL1 G Y F V F ECL1ICL2 P M S N F R F ICL2ECL2 G W S R Y I P E G M Q C S C G I D Y Y T R A E G F ECL2ICL3 Q E ICL3ECL3 Q G S E F ECL3N-term M N G T E G P Y F Y V P M S N A T G V V R S P Y E Y P Q Y Y L A N-termC-term C G K N P F E E E E G A S T T A S K T E A S S V S S V S P A C-term P P W A Y A C L A A Y M F F L I L V G F P V N F L T L Y V T I E H T P L N Y I L L N L A V A D L F M V F G G F T T T M Y T S L N G R L G C N L E G F F A T F G G I N S L W C L V V L S I E R W V V V C K G E N H A I M G V A F T W F M A L A C T V P P L V N N E S F V I Y M F V V H F L T P L F V I T F C Y G R L V C T V K E A A A Q Q S E T T Q R A E R E V T R M V I L M F I A Y L V C W L P Y A S V S W W I F T N G P I F M T V P A F F A K S S S I Y N P V I Y I C L N K Q M I T F R H C T L C
Pick color:
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 




Invitro Mutant Data: Increased binding/potency: >5-fold, >10-fold; Reduced binding/potency: >5-fold, >10-fold; No/low effect (<5-fold); and N/A

MUTATIONS

ENDOGENOUS LIGANDS

Retinal

HOMOLOGY MODELS

No homology models available. Check the Archive on Structure models for earlier releases.

STRUCTURES

No structures available