Rhodopsin (opsd_cotin)

FAMILY

Class A (Rhodopsin) Sensory receptors Opsins Rhodopsin

GENE

rho

ORGANISM

Longfin Baikal sculpin (Cottocomephorus inermis)

ALT. NAMES

Rhodopsin

SOURCE

SWISSPROT

SEQUENCE

N-term TM1  
Y
L
V
N
P
A
A
Y
A
A
10
                   
L
G
A
Y
M
F
L
L
I
L
20
                   
I
G
F
P
V
N
F
L
T
L
30
            ICL1
Y
V
T
I
E
H
K
K
L
R
40
TM2              
T
P
L
N
Y
I
L
L
N
L
50
                   
A
V
A
N
L
F
M
V
L
G
60
                   
G
F
T
T
T
M
Y
T
S
M
70
    ECL1 TM3  
H
G
Y
F
V
L
G
R
L
G
80
                   
C
N
L
E
G
F
F
A
T
M
90
                   
G
G
E
I
A
L
W
S
L
V
100
                   
V
L
A
I
E
R
W
I
V
V
110
    ICL2        
C
K
P
I
S
N
F
R
F
T
120
TM4              
E
D
H
A
I
M
G
L
A
F
130
                   
T
W
V
M
A
L
S
C
A
V
140
          ECL2  
P
P
L
V
G
W
S
R
Y
I
150
                   
P
E
G
M
Q
C
S
C
G
V
160
                   
D
Y
Y
T
R
A
E
G
F
N
170
TM5              
N
E
S
F
V
I
Y
M
F
I
180
                   
V
H
F
L
T
P
L
I
I
I
190
                   
S
F
C
Y
G
R
L
L
C
A
200
                   
V
K
E
A
A
A
A
Q
Q
E
210
ICL3 TM6      
S
E
T
T
Q
R
A
E
R
E
220
                   
V
S
R
M
V
V
M
M
V
I
230
                   
S
F
L
M
C
W
L
P
Y
A
240
                   
S
V
A
W
Y
I
F
C
N
Q
250
ECL3 TM7      
G
S
E
F
G
P
I
F
M
T
260
                   
L
P
A
F
F
A
K
S
S
A
270
                   
I
Y
N
P
L
I
Y
I
C
M
280
H8              
N
K
Q
F
R
H
C
M
I

LINKS

UniProt

DIAGRAMS

ICL1 K K L R ICL1ECL1 Y F V L ECL1ICL2 P I S N F R F ICL2ECL2 W S R Y I P E G M Q C S C G V D Y Y T R A E G F ECL2ICL3 Q E S ICL3ECL3 Q G S E F ECL3N-term Y L V N-term N P A A Y A A L G A Y M F L L I L I G F P V N F L T L Y V T I E H T P L N Y I L L N L A V A N L F M V L G G F T T T M Y T S M H G G R L G C N L E G F F A T M G G E I A L W S L V V L A I E R W I V V C K T E D H A I M G L A F T W V M A L S C A V P P L V G N N E S F V I Y M F I V H F L T P L I I I S F C Y G R L L C A V K E A A A A Q E T T Q R A E R E V S R M V V M M V I S F L M C W L P Y A S V A W Y I F C N G P I F M T L P A F F A K S S A I Y N P L I Y I C M N K Q M I F R H C
Pick color:
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 




Invitro Mutant Data: Increased binding/potency: >5-fold, >10-fold; Reduced binding/potency: >5-fold, >10-fold; No/low effect (<5-fold); and N/A

F N V P F G I L I L L F M Y A G L A A Y 1 L N L A V A N L F M V G L G F T T T M Y T 2 V V L S W L A I E G G M T A F F G E L N 3 A I M G L A F T W V M A L S C A V P P L 4 Y C F S I I I L P T L F H V I F M Y I V F 5 V M M V I S F L M C W L P Y A S V A W Y 6 L P N Y I A S S K A F F A P L T M F I 7
Pick color:
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 




Invitro Mutant Data: Increased binding/potency: >5-fold, >10-fold; Reduced binding/potency: >5-fold, >10-fold; No/low effect (<5-fold); and N/A

MUTATIONS

0 mutation data points available.

ENDOGENOUS LIGANDS

No endogenous ligands available

STRUCTURE MODELS

No structure models available. Check the Archive on Structure models for earlier releases.

STRUCTURES

No structures available