Rhodopsin (opsd_lolfo)

FAMILY

Class A (Rhodopsin) Sensory receptors Opsins Rhodopsin

GENE

RHO

ORGANISM

Veined squid (Loligo forbesii)

ALT. NAMES

Rhodopsin

SOURCE

SWISSPROT

SEQUENCE

N-term        
M
G
R
D
I
P
D
N
E
T
10
                   
W
W
Y
N
P
Y
M
D
I
H
20
                   
P
H
W
K
Q
F
D
Q
V
P
30
TM1              
A
A
V
Y
Y
S
L
G
I
F
40
                   
I
A
I
C
G
I
I
G
C
V
50
                   
G
N
G
V
V
I
Y
L
F
T
60
    ICL1 TM2  
K
T
K
S
L
Q
T
P
A
N
70
                   
M
F
I
I
N
L
A
F
S
D
80
                   
F
T
F
S
L
V
N
G
F
P
90
                   
L
M
T
I
S
C
F
M
K
Y
100
ECL1 TM3      
W
V
F
G
N
A
A
C
K
V
110
                   
Y
G
L
I
G
G
I
F
G
L
120
                   
M
S
I
M
T
M
T
M
I
S
130
                   
I
D
R
Y
N
V
I
G
R
P
140
ICL2       TM4
M
S
A
S
K
K
M
S
H
R
150
                   
K
A
F
I
M
I
I
F
V
W
160
                   
I
W
S
T
I
W
A
I
G
P
170
      ECL2      
I
F
G
W
G
A
Y
T
L
E
180
                   
G
V
L
C
N
C
S
F
D
Y
190
          TM5    
I
T
R
D
T
T
T
R
S
N
200
                   
I
L
C
M
Y
I
F
A
F
M
210
                   
C
P
I
V
V
I
F
F
C
Y
220
                   
F
N
I
V
M
S
V
S
N
H
230
        ICL3    
E
K
E
M
A
A
M
A
K
R
240
                   
L
N
A
K
E
L
R
K
A
Q
250
TM6              
A
G
A
N
A
E
M
K
L
A
260
                   
K
I
S
I
V
I
V
T
Q
F
270
                   
L
L
S
W
S
P
Y
A
V
V
280
                   
A
L
L
A
Q
F
G
P
I
E
290
ECL3 TM7      
W
V
T
P
Y
A
A
Q
L
P
300
                   
V
M
F
A
K
A
S
A
I
H
310
                H8
N
P
M
I
Y
S
V
S
H
P
320
                   
K
F
R
E
R
I
A
S
N
F
330
  C-term      
P
W
I
L
T
C
C
Q
Y
D
340
                   
E
K
E
I
E
D
D
K
D
A
350
                   
E
A
E
I
P
A
G
E
Q
S
360
                   
G
G
E
T
A
D
A
A
Q
M
370
                   
K
E
M
M
A
M
M
Q
K
M
380
                   
Q
A
Q
Q
Q
Q
Q
P
A
Y
390
                   
P
P
Q
G
Y
P
P
Q
G
Y
400
                   
P
P
P
P
P
Q
G
Y
P
P
410
                   
Q
G
Y
P
P
Q
G
Y
P
P
420
                   
Q
G
Y
P
P
P
P
Q
G
P
430
                   
P
P
Q
G
P
P
P
Q
A
A
440
                   
P
P
Q
G
V
D
N
Q
A
Y
450
   
Q
A

LINKS

DIAGRAMS

ICL1 K S L Q ICL1ECL1 K Y W V F ECL1ICL2 P M S A S K K M ICL2ECL2 W G A Y T L E G V L C N C S F D Y I T R D T ECL2ICL3 A A M A K R L N A K E L R K A ICL3ECL3 P I E W V ECL3N-term M G R D I P D N E T W W Y N P Y M D I H P H W K Q F D Q V N-termC-term W I L T C C Q Y D E K E I E D D K D A E A E I P A G E Q S G G E T A D A A Q M K E M M A M M Q K M Q A Q Q Q Q Q P A Y P P Q G Y P P Q G Y P P P P P Q G Y P P Q G Y P P Q G Y P P Q G Y P P P P Q G P P P Q G P P P Q A A P P Q G V D N Q A Y Q A C-term P A A V Y Y S L G I F I A I C G I I G C V G N G V V I Y L F T K T T P A N M F I I N L A F S D F T F S L V N G F P L M T I S C F M G N A A C K V Y G L I G G I F G L M S I M T M T M I S I D R Y N V I G R S H R K A F I M I I F V W I W S T I W A I G P I F G T T R S N I L C M Y I F A F M C P I V V I F F C Y F N I V M S V S N H E K E M Q A G A N A E M K L A K I S I V I V T Q F L L S W S P Y A V V A L L A Q F G T P Y A A Q L P V M F A K A S A I H N P M I Y S V S H P K I A S F R E R N F P
Pick color:
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 




Invitro Mutant Data: Increased binding/potency: >5-fold, >10-fold; Reduced binding/potency: >5-fold, >10-fold; No/low effect (<5-fold); and N/A

G N G V C G I I G C I A I F I G L S Y Y 1 I N L A F S D F T F S V L N G F P L M T I 2 M T M T M I S M L G F I G G I L G Y V K 3 A F I M I I F V W I W S T I W A I G P I 4 Y C F F I V V I P C M F A F I Y M C L I N 5 I V I V T Q F L L S W S P Y A V V A L L 6 M P N H I A S A K A F M V P L Q A A Y 7
Pick color:
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 




Invitro Mutant Data: Increased binding/potency: >5-fold, >10-fold; Reduced binding/potency: >5-fold, >10-fold; No/low effect (<5-fold); and N/A

MUTATIONS

ENDOGENOUS LIGANDS

No endogenous ligands available

STRUCTURE MODELS

No structure models available. Check the Archive on Structure models for earlier releases.

STRUCTURES

No structures available