Rhodopsin (opsd_sarxa)

FAMILY

Class A (Rhodopsin) Sensory receptors Opsins Rhodopsin

GENE

rho

ORGANISM

Hawaiian squirrelfish (Sargocentron xantherythrum)

ALT. NAMES

Rhodopsin

SOURCE

SWISSPROT

SEQUENCE

N-term        
T
E
G
P
Y
F
Y
V
P
M
10
                   
V
N
T
T
G
I
V
R
S
P
20
                   
Y
E
Y
P
Q
Y
Y
L
V
N
30
TM1              
P
A
A
F
A
I
L
G
A
Y
40
                   
M
F
F
L
I
I
V
G
F
P
50
                   
V
N
F
M
T
L
Y
V
T
L
60
    ICL1 TM2  
E
H
K
K
L
R
T
P
L
N
70
                   
Y
I
L
L
N
L
A
V
A
D
80
                   
L
F
M
V
I
G
G
F
T
T
90
                   
T
M
Y
T
S
M
H
G
Y
F
100
ECL1 TM3      
V
L
G
R
L
G
C
N
L
E
110
                   
G
F
F
A
T
L
G
G
M
I
120
                   
S
L
W
S
L
A
V
L
A
I
130
                   
E
R
W
V
V
V
C
K
P
I
140
ICL2   TM4    
S
N
F
R
F
G
E
N
H
A
150
                   
I
M
G
V
S
L
T
W
G
M
160
                   
A
L
A
C
T
V
P
P
L
V
170
  ECL2          
G
W
S
R
Y
I
P
E
G
M
180
                   
Q
C
S
C
G
I
D
Y
Y
T
190
          TM5    
R
A
E
G
F
N
N
E
T
F
200
                   
V
L
Y
M
F
C
C
H
F
T
210
                   
V
P
L
T
I
I
F
F
C
Y
220
                   
G
R
L
L
C
A
V
K
E
A
230
        ICL3 TM6
A
A
A
Q
Q
E
S
E
T
T
240
                 
Q
R
A
E
R
E
V
T
R
M
250
                   
V
V
I
M
V
I
G
F
L
V
260
                   
C
W
L
P
Y
A
S
V
A
W
270
          ECL3  
F
V
F
T
H
Q
G
S
E
F
280
TM7              
G
P
L
F
M
T
I
P
A
F
290
                   
F
A
K
S
S
A
I
Y
N
P
300
            H8    
M
I
Y
I
C
M
N
K
Q
F
310
                   
R
H
C
M
I
T
T
L
F
C
320
C-term        
G
K
N
P
F
E
G
E
E
E
330
                   
G
A
S
S
T
K
T
E
A
S
340
               
S
A
S
S
V
S
P
A

LINKS

UniProt

DIAGRAMS

ICL1 K K L R ICL1ECL1 Y F V L ECL1ICL2 P I S N F R F ICL2ECL2 W S R Y I P E G M Q C S C G I D Y Y T R A E G F ECL2ICL3 Q E S ICL3ECL3 Q G S E F ECL3N-term T E G P Y F Y V P M V N T T G I V R S P Y E Y P Q Y Y L V N-termC-term C G K N P F E G E E E G A S S T K T E A S S A S S V S P A C-term N P A A F A I L G A Y M F F L I I V G F P V N F M T L Y V T L E H T P L N Y I L L N L A V A D L F M V I G G F T T T M Y T S M H G G R L G C N L E G F F A T L G G M I S L W S L A V L A I E R W V V V C K G E N H A I M G V S L T W G M A L A C T V P P L V G N N E T F V L Y M F C C H F T V P L T I I F F C Y G R L L C A V K E A A A A Q E T T Q R A E R E V T R M V V I M V I G F L V C W L P Y A S V A W F V F T H G P L F M T I P A F F A K S S A I Y N P M I Y I C M N K Q M I T F R H C T L F
Pick color:
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 




Invitro Mutant Data: Increased binding/potency: >5-fold, >10-fold; Reduced binding/potency: >5-fold, >10-fold; No/low effect (<5-fold); and N/A

F N V P F G V I I L F F M Y A G L I A F 1 L N L A V A D L F M V G I G F T T T M Y T 2 V A L S W L S I M G G L T A F F G E L N 3 A I M G V S L T W G M A L A C T V P P L 4 Y C F F I I T L P V T F H C C F M Y L V F 5 V I M V I G F L V C W L P Y A S V A W F 6 M P N Y I A S S K A F F A P I T M F L 7
Pick color:
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 




Invitro Mutant Data: Increased binding/potency: >5-fold, >10-fold; Reduced binding/potency: >5-fold, >10-fold; No/low effect (<5-fold); and N/A

MUTATIONS

0 mutation data points available.

ENDOGENOUS LIGANDS

No endogenous ligands available

STRUCTURE MODELS

No structure models available. Check the Archive on Structure models for earlier releases.

STRUCTURES

No structures available