6CM4_refined

PROTEIN CLASS

Class A (Rhodopsin)

RECEPTOR

D2 receptor

SPECIES

Homo sapiens

STATE

Inactive

VERSION

2020-09-02

MODEL

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PDB file contains GPCRdb generic numbers in the B-factor field of CA atoms

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MAIN TEMPLATE

D2 receptor (sequence similarity: 100%) PDB: 6CM4

TEMPLATES

6KUW (α2C-adrenoceptor)
6CM4 (D2 receptor)
6VMS (D2 receptor)
3PBL (D3 receptor)
3SN6 (β2-adrenoceptor)
None
Main template (%) Additional templates (%) No template - freely modelled (%)
Backbone 85.7 7.8 6.5
Side-chains 73.4 16.0 10.6

Number of backbone templates: 5
Number of rotamer templates: 18

Segment Seq.num. AA GPCRdb# Backbone PDB Rotamer PDB
N-term 26 D - - - -
N-term 27 G - - - -
N-term 28 K - - - -
N-term 29 A - - - -
N-term 30 D - - - -
TM1 31 R 1.29x29 α2C-adrenoceptor 6KUW - -
TM1 32 P 1.30x30 α2C-adrenoceptor 6KUW 5-HT1B receptor 4IAQ
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TM1 34 Y 1.32x32 α2C-adrenoceptor 6KUW Rhodopsin 2Z73
TM1 35 N 1.33x33 D2 receptor 6CM4 - -
TM1 36 Y 1.34x34 D2 receptor 6CM4 succinate receptor 6RNK
TM1 37 Y 1.35x35 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM1 38 A 1.36x36 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM1 39 T 1.37x37 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
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TM1 41 L 1.39x39 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
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TM1 47 V 1.45x45 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM1 48 I 1.46x46 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM1 49 V 1.47x47 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM1 50 F 1.48x48 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM1 51 G 1.49x49 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
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TM1 53 V 1.51x51 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM1 54 L 1.52x52 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM1 55 V 1.53x53 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM1 56 C 1.54x54 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM1 57 M 1.55x55 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM1 58 A 1.56x56 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM1 59 V 1.57x57 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
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ICL1 65 L 12.50x50 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
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TM2 67 T 2.37x37 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM2 68 T 2.38x38 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
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TM2 85 T 2.55x55 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
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TM2 94 L 2.64x63 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
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TM2 97 V 2.67x66 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM2 98 G 2.68x67 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
ECL1 99 E 23.49x49 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6LUQ
ECL1 100 W 23.50x50 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
ECL1 101 K 23.51x51 D2 receptor 6CM4 S1P1 receptor 3V2Y
ECL1 102 F 23.52x52 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM3 103 S 3.21x21 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM3 104 R 3.22x22 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM3 105 I 3.23x23 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM3 106 H 3.24x24 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM3 107 C 3.25x25 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
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TM3 109 I 3.27x27 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
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TM3 125 L 3.43x43 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM3 126 C 3.44x44 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM3 127 A 3.45x45 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM3 128 I 3.46x46 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM3 129 S 3.47x47 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM3 130 I 3.48x48 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM3 131 D 3.49x49 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM3 132 R 3.50x50 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM3 133 Y 3.51x51 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM3 134 T 3.52x52 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM3 135 A 3.53x53 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM3 136 V 3.54x54 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM3 137 A 3.55x55 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM3 138 M 3.56x56 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
ICL2 139 P 34.50x50 - - - -
ICL2 140 M 34.51x51 D3 receptor 3PBL MT2 receptor 6ME7
ICL2 141 L 34.52x52 D3 receptor 3PBL OX1 receptor 6TO7
ICL2 142 Y 34.53x53 D3 receptor 3PBL D3 receptor 3PBL
ICL2 143 N 34.54x54 D3 receptor 3PBL α2A-adrenoceptor 6KUX
ICL2 144 T 34.55x55 D3 receptor 3PBL CCR9 5LWE
ICL2 145 R 34.56x56 D3 receptor 3PBL M4 receptor 6KP6
ICL2 146 Y 34.57x57 D3 receptor 3PBL - -
ICL2 147 S 34.58x58 - - - -
TM4 148 S 4.38x38 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
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TM4 151 R 4.41x41 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM4 152 V 4.42x42 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM4 153 T 4.43x43 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM4 154 V 4.44x44 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM4 155 M 4.45x45 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM4 156 I 4.46x46 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM4 157 S 4.47x47 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM4 158 I 4.48x48 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM4 159 V 4.49x49 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM4 160 W 4.50x50 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM4 161 V 4.51x51 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM4 162 L 4.52x52 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM4 163 S 4.53x53 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM4 164 F 4.54x54 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM4 165 T 4.55x55 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM4 166 I 4.56x56 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM4 167 S 4.57x57 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM4 168 C 4.58x59 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM4 169 P 4.59x60 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM4 170 L 4.60x61 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM4 171 L 4.61x62 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM4 172 F 4.62x63 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
ECL2 173 G D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
ECL2 174 L D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
ECL2 175 N D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
ECL2 176 N D2 receptor 6CM4 - -
ECL2 177 A D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
ECL2 178 D D2 receptor 6CM4 - -
ECL2 179 Q D2 receptor 6CM4 - -
ECL2 180 N D2 receptor 6CM4 - -
ECL2 181 E D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
ECL2 182 C 45.50x50 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
ECL2 183 I 45.51x51 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
ECL2 184 I 45.52x52 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
ECL2 185 A - - - -
TM5 186 N 5.35x36 D2 receptor 6VMS D2 receptor 6VMS
TM5 187 P 5.36x37 D2 receptor 6VMS D2 receptor 6VMS
TM5 188 A 5.37x38 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM5 189 F 5.38x39 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM5 190 V 5.39x40 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM5 191 V 5.40x41 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM5 192 Y 5.41x42 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM5 193 S 5.42x43 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM5 194 S 5.43x44 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM5 195 I 5.44x45 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM5 196 V 5.45x46 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM5 197 S 5.46x461 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM5 198 F 5.47x47 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM5 199 Y 5.48x48 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM5 200 V 5.49x49 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM5 201 P 5.50x50 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM5 202 F 5.51x51 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM5 203 I 5.52x52 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM5 204 V 5.53x53 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM5 205 T 5.54x54 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM5 206 L 5.55x55 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM5 207 L 5.56x56 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM5 208 V 5.57x57 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM5 209 Y 5.58x58 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM5 210 I 5.59x59 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM5 211 K 5.60x60 D2 receptor 6CM4 H1 receptor 3RZE
TM5 212 I 5.61x61 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM5 213 Y 5.62x62 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM5 214 I 5.63x63 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM5 215 V 5.64x64 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM5 216 L 5.65x65 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM5 217 R 5.66x66 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6LUQ
TM5 218 R 5.67x67 D2 receptor 6CM4 α2A-adrenoceptor 6KUX
TM5 219 R 5.68x68 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM5 220 R 5.69x69 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM5 221 K 5.70x70 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6LUQ
TM5 222 R 5.71x71 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6LUQ
TM5 223 V 5.72x72 β2-adrenoceptor 3SN6 D2 receptor 6VMS
TM5 224 N 5.73x73 β2-adrenoceptor 3SN6 - -
TM5 225 T 5.74x74 β2-adrenoceptor 3SN6 - -
TM5 226 K 5.75x75 β2-adrenoceptor 3SN6 - -
ICL3 227 R - - - -
ICL3 228 S - - - -
ICL3 229 S - - - -
ICL3 230 R - - - -
ICL3 231 A - - - -
ICL3 357 T - - - -
ICL3 358 M - - - -
ICL3 359 S - - - -
ICL3 360 R - - - -
ICL3 361 R - - - -
TM6 362 K 6.24x24 D2 receptor 6VMS D2 receptor 6VMS
TM6 363 L 6.25x25 D2 receptor 6VMS D2 receptor 6VMS
TM6 364 S 6.26x26 D2 receptor 6VMS D2 receptor 6VMS
TM6 365 Q 6.27x27 D2 receptor 6VMS D2 receptor 6VMS
TM6 366 Q 6.28x28 D2 receptor 6VMS D2 receptor 6VMS
TM6 367 K 6.29x29 D2 receptor 6VMS D2 receptor 6VMS
TM6 368 E 6.30x30 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM6 369 K 6.31x31 D2 receptor 6CM4 D3 receptor 3PBL
TM6 370 K 6.32x32 D2 receptor 6CM4 D3 receptor 3PBL
TM6 371 A 6.33x33 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM6 372 T 6.34x34 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM6 373 Q 6.35x35 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM6 374 M 6.36x36 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM6 375 L 6.37x37 D2 receptor 6CM4 α2A-adrenoceptor 6KUX
TM6 376 A 6.38x38 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM6 377 I 6.39x39 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM6 378 V 6.40x40 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM6 379 L 6.41x41 D2 receptor 6CM4 D3 receptor 3PBL
TM6 380 G 6.42x42 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM6 381 V 6.43x43 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM6 382 F 6.44x44 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM6 383 I 6.45x45 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM6 384 I 6.46x46 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM6 385 C 6.47x47 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM6 386 W 6.48x48 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM6 387 L 6.49x49 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM6 388 P 6.50x50 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM6 389 F 6.51x51 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM6 390 F 6.52x52 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM6 391 I 6.53x53 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM6 392 T 6.54x54 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM6 393 H 6.55x55 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM6 394 I 6.56x56 D2 receptor 6CM4 D4 receptor 5WIV
TM6 395 L 6.57x57 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM6 396 N 6.58x58 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM6 397 I 6.59x59 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM6 398 H 6.60x60 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6VMS
TM6 399 C 6.61x61 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
ECL3 400 D D2 receptor 6CM4 - -
ECL3 401 C D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
ECL3 402 N D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
ECL3 403 I D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM7 404 P 7.31x30 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM7 405 P 7.32x31 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM7 406 V 7.33x32 D2 receptor 6CM4 μ receptor 4DKL
TM7 407 L 7.34x33 D2 receptor 6CM4 D3 receptor 3PBL
TM7 408 Y 7.35x34 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM7 409 S 7.36x35 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM7 410 A 7.37x36 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM7 411 F 7.38x37 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM7 412 T 7.39x38 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM7 413 W 7.40x39 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM7 414 L 7.41x40 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM7 415 G 7.42x41 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM7 416 Y 7.43x42 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM7 417 V 7.44x43 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM7 418 N 7.45x45 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM7 419 S 7.46x46 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM7 420 A 7.47x47 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM7 421 V 7.48x48 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM7 422 N 7.49x49 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM7 423 P 7.50x50 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM7 424 I 7.51x51 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM7 425 I 7.52x52 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM7 426 Y 7.53x53 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM7 427 T 7.54x54 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM7 428 T 7.55x55 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM7 429 F 7.56x56 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
H8 430 N 8.47x47 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
H8 431 I 8.48x48 D2 receptor 6CM4 D3 receptor 3PBL
H8 432 E 8.49x49 D2 receptor 6CM4 D3 receptor 3PBL
H8 433 F 8.50x50 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
H8 434 R 8.51x51 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6LUQ
H8 435 K 8.52x52 D2 receptor 6CM4 D3 receptor 3PBL
H8 436 A 8.53x53 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
H8 437 F 8.54x54 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
H8 438 L 8.55x55 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6LUQ
H8 439 K 8.56x56 D2 receptor 6CM4 D3 receptor 3PBL
H8 440 I 8.57x57 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
H8 441 L 8.58x58 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
H8 442 H 8.59x59 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6LUQ
C-term 443 C - - - -