6MEO_refined

PROTEIN CLASS

Class A (Rhodopsin)

RECEPTOR

SPECIES

Homo sapiens

STATE

Inactive

VERSION

2020-11-03

MODEL

PDB file contains GPCRdb generic numbers in the B-factor field of CA atoms

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MAIN TEMPLATE

CCR5 (sequence similarity: 100%) PDB: 6MEO

TEMPLATES

5UIW (CCR5)
6MEO (CCR5)
4MBS (CCR5)
6WWZ (CCR6)
None
Main template (%) Additional templates (%) No template - freely modelled (%)
Backbone 85.1 10.3 4.6
Side-chains 85.1 9.9 5.0

Number of backbone templates: 4
Number of rotamer templates: 7

Segment Seq.num. AA GPCRdb# Backbone PDB Rotamer PDB
N-term 17 S - - - -
N-term 18 E - - - -
N-term 19 P - - - -
N-term 20 C - - - -
N-term 21 Q - - - -
TM1 22 K 1.24x24 CCR5 5UIW - -
TM1 23 I 1.25x25 CCR5 5UIW ETB receptor 5X93
TM1 24 N 1.26x26 CCR5 5UIW CCR5 5UIW
TM1 25 V 1.27x27 CCR5 5UIW CCR5 5UIW
TM1 26 K 1.28x28 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM1 27 Q 1.29x29 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM1 28 I 1.30x30 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM1 29 A 1.31x31 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM1 30 A 1.32x32 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM1 31 R 1.33x33 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM1 32 L 1.34x34 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM1 33 L 1.35x35 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM1 34 P 1.36x36 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM1 35 P 1.37x37 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM1 36 L 1.38x38 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM1 37 Y 1.39x39 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM1 38 S 1.40x40 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM1 39 L 1.41x41 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM1 40 V 1.42x42 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM1 41 F 1.43x43 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM1 42 I 1.44x44 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM1 43 F 1.45x45 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM1 44 G 1.46x46 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM1 45 F 1.47x47 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM1 46 V 1.48x48 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM1 47 G 1.49x49 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM1 48 N 1.50x50 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM1 49 M 1.51x51 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM1 50 L 1.52x52 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM1 51 V 1.53x53 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM1 52 I 1.54x54 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM1 53 L 1.55x55 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM1 54 I 1.56x56 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM1 55 L 1.57x57 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM1 56 I 1.58x58 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM1 57 N 1.59x59 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM1 58 C 1.60x60 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
ICL1 59 K 12.48x48 - - - -
ICL1 60 R 12.49x49 CCR6 6WWZ apelin receptor 5VBL
ICL1 61 L 12.50x50 CCR6 6WWZ CCR7 6QZH
ICL1 62 K 12.51x51 - - - -
TM2 63 S 2.37x37 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM2 64 M 2.38x38 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM2 65 T 2.39x39 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM2 66 D 2.40x40 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM2 67 I 2.41x41 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM2 68 Y 2.42x42 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM2 69 L 2.43x43 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM2 70 L 2.44x44 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM2 71 N 2.45x45 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM2 72 L 2.46x46 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM2 73 A 2.47x47 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM2 74 I 2.48x48 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM2 75 S 2.49x49 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM2 76 D 2.50x50 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM2 77 L 2.51x51 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM2 78 F 2.52x52 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM2 79 F 2.53x53 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM2 80 L 2.54x54 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM2 81 L 2.55x55 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM2 82 T 2.56x56 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM2 83 V 2.57x57 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM2 84 P 2.58x58 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM2 85 F 2.59x59 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM2 86 W 2.60x60 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM2 87 A 2.61x61 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM2 88 H 2.62x62 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM2 89 Y 2.63x63 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM2 90 A 2.64x64 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM2 91 A 2.65x65 CCR5 5UIW CCR5 5UIW
TM2 92 A 2.66x66 CCR5 5UIW CCR5 5UIW
ECL1 93 Q 23.49x49 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
ECL1 94 W 23.50x50 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
ECL1 95 D 23.51x51 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
ECL1 96 F 23.52x52 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM3 97 G 3.21x21 CCR5 5UIW CCR5 5UIW
TM3 98 N 3.22x22 CCR5 5UIW CCR5 5UIW
TM3 99 T 3.23x23 CCR5 5UIW CCR5 5UIW
TM3 100 M 3.24x24 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM3 101 C 3.25x25 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM3 102 Q 3.26x26 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM3 103 L 3.27x27 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM3 104 L 3.28x28 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM3 105 T 3.29x29 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM3 106 G 3.30x30 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM3 107 L 3.31x31 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM3 108 Y 3.32x32 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM3 109 F 3.33x33 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM3 110 I 3.34x34 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM3 111 G 3.35x35 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
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TM3 113 F 3.37x37 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM3 114 S 3.38x38 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM3 115 G 3.39x39 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM3 116 I 3.40x40 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM3 117 F 3.41x41 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM3 118 F 3.42x42 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM3 119 I 3.43x43 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM3 120 I 3.44x44 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM3 121 L 3.45x45 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
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TM3 123 T 3.47x47 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM3 124 I 3.48x48 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM3 125 D 3.49x49 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM3 126 R 3.50x50 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM3 127 Y 3.51x51 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM3 128 L 3.52x52 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM3 129 A 3.53x53 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM3 130 V 3.54x54 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM3 131 V 3.55x55 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM3 132 H 3.56x56 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
ICL2 133 A 34.50x50 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
ICL2 134 V 34.51x51 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
ICL2 135 F 34.52x52 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
ICL2 136 A 34.53x53 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
ICL2 137 L 34.54x54 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
ICL2 138 K 34.55x55 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
ICL2 139 A 34.56x56 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
ICL2 140 R 34.57x57 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM4 141 T 4.38x38 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM4 142 V 4.39x39 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM4 143 T 4.40x40 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM4 144 F 4.41x41 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM4 145 G 4.42x42 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM4 146 V 4.43x43 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM4 147 V 4.44x44 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM4 148 T 4.45x45 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM4 149 S 4.46x46 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM4 150 V 4.47x47 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM4 151 I 4.48x48 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM4 152 T 4.49x49 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM4 153 W 4.50x50 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM4 154 V 4.51x51 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM4 155 V 4.52x52 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM4 156 A 4.53x53 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM4 157 V 4.54x54 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM4 158 F 4.55x55 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM4 159 A 4.56x56 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM4 160 S 4.57x57 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM4 161 L 4.58x59 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM4 162 P 4.59x60 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM4 163 G 4.60x61 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM4 164 I 4.61x62 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM4 165 I 4.62x63 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM4 166 F 4.63x64 CCR5 5UIW CCR5 5UIW
TM4 167 T 4.64x65 CCR5 5UIW CCR5 5UIW
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ECL2 170 Q CCR5 6MEO CCR5 6MEO
ECL2 171 K CCR5 6MEO CCR5 6MEO
ECL2 172 E CCR5 6MEO CCR5 6MEO
ECL2 173 G CCR5 6MEO CCR5 6MEO
ECL2 174 L CCR5 6MEO CCR5 6MEO
ECL2 175 H CCR5 6MEO CCR5 6MEO
ECL2 176 Y CCR5 6MEO CCR5 6MEO
ECL2 177 T CCR5 6MEO CCR5 6MEO
ECL2 178 C 45.50x50 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
ECL2 179 S 45.51x51 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
ECL2 180 S 45.52x52 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
ECL2 181 H CCR5 6MEO CCR5 6MEO
ECL2 182 F CCR5 6MEO CCR5 6MEO
ECL2 183 P CCR5 6MEO CCR5 6MEO
ECL2 184 Y CCR5 6MEO CCR5 6MEO
ECL2 185 S CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM5 186 Q 5.30x31 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM5 187 Y 5.31x32 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM5 188 Q 5.32x33 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM5 189 F 5.33x34 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM5 190 W 5.34x35 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM5 191 K 5.35x36 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM5 192 N 5.36x37 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM5 193 F 5.37x38 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM5 194 Q 5.38x39 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM5 195 T 5.39x40 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM5 196 L 5.40x41 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM5 197 K 5.41x42 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM5 198 I 5.42x43 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM5 199 V 5.43x44 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM5 200 I 5.44x45 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
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TM5 202 G 5.46x461 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM5 203 L 5.47x47 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM5 204 V 5.48x48 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM5 205 L 5.49x49 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM5 206 P 5.50x50 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM5 207 L 5.51x51 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM5 208 L 5.52x52 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM5 209 V 5.53x53 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM5 210 M 5.54x54 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM5 211 V 5.55x55 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM5 212 I 5.56x56 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM5 213 C 5.57x57 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM5 214 Y 5.58x58 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM5 215 S 5.59x59 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM5 216 G 5.60x60 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM5 217 I 5.61x61 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM5 218 L 5.62x62 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM5 219 K 5.63x63 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM5 220 T 5.64x64 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM5 221 L 5.65x65 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM5 222 L 5.66x66 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM5 223 R 5.67x67 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM5 224 C 5.68x68 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
ICL3 225 R CCR5 6MEO CCR5 6MEO
ICL3 226 N CCR5 6MEO CCR5 6MEO
ICL3 227 E CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM6 228 K 6.28x28 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM6 229 K 6.29x29 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM6 230 R 6.30x30 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM6 231 H 6.31x31 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM6 232 R 6.32x32 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM6 233 A 6.33x33 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM6 234 V 6.34x34 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM6 235 R 6.35x35 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM6 236 L 6.36x36 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM6 237 I 6.37x37 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM6 238 F 6.38x38 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM6 239 T 6.39x39 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM6 240 I 6.40x40 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM6 241 M 6.41x41 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM6 242 I 6.42x42 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM6 243 V 6.43x43 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM6 244 Y 6.44x44 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM6 245 F 6.45x45 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM6 246 L 6.46x46 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM6 247 F 6.47x47 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM6 248 W 6.48x48 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM6 249 A 6.49x49 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM6 250 P 6.50x50 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM6 251 Y 6.51x51 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM6 252 N 6.52x52 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM6 253 I 6.53x53 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM6 254 V 6.54x54 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM6 255 L 6.55x55 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM6 256 L 6.56x56 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM6 257 L 6.57x57 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM6 258 N 6.58x58 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM6 259 T 6.59x59 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM6 260 F 6.60x60 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM6 261 Q 6.61x61 CCR5 4MBS CCR5 4MBS
TM6 262 E 6.62x62 CCR5 4MBS CCR5 6AKX
TM6 263 F 6.63x63 CCR5 4MBS CCR5 6AKX
TM6 264 F 6.64x64 CCR5 4MBS CCR5 4MBS
TM6 265 G 6.65x65 CCR5 4MBS CCR5 4MBS
ECL3 266 L - - - -
ECL3 267 N - - - -
TM7 268 N 7.24x23 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM7 269 C 7.25x24 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM7 270 S 7.26x25 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM7 271 S 7.27x26 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM7 272 S 7.28x27 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM7 273 N 7.29x28 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM7 274 R 7.30x29 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM7 275 L 7.31x30 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM7 276 D 7.32x31 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM7 277 Q 7.33x32 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM7 278 A 7.34x33 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM7 279 M 7.35x34 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM7 280 Q 7.36x35 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM7 281 V 7.37x36 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM7 282 T 7.38x37 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM7 283 E 7.39x38 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM7 284 T 7.40x39 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM7 285 L 7.41x40 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM7 286 G 7.42x41 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
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TM7 288 T 7.44x43 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM7 289 H 7.45x45 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM7 290 C 7.46x46 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM7 291 C 7.47x47 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
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TM7 293 N 7.49x49 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM7 294 P 7.50x50 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM7 295 I 7.51x51 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM7 296 I 7.52x52 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM7 297 Y 7.53x53 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM7 298 A 7.54x54 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM7 299 F 7.55x55 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
TM7 300 V 7.56x56 CCR5 6MEO CCR5 6MEO
H8 301 G 8.47x47 CCR5 5UIW CCR5 5UIW
H8 302 E 8.48x48 CCR5 5UIW CCR5 4MBS
H8 303 K 8.49x49 CCR5 5UIW CCR5 5UIW
H8 304 F 8.50x50 CCR5 5UIW CCR5 5UIW
H8 305 R 8.51x51 CCR5 5UIW CCR5 5UIW
H8 306 N 8.52x52 CCR5 5UIW CCR5 5UIW
H8 307 Y 8.53x53 CCR5 5UIW CCR5 5UIW
H8 308 L 8.54x54 CCR5 5UIW CCR5 5UIW
H8 309 L 8.55x55 CCR5 5UIW CCR5 5UIW
H8 310 V 8.56x56 CCR5 5UIW CCR5 4MBS
H8 311 F 8.57x57 CCR5 5UIW CCR5 5UIW
H8 312 F 8.58x58 CCR5 5UIW CCR5 5UIW
H8 313 Q 8.59x59 CCR5 5UIW CCR5 5UIW
C-term 314 K - - - -
C-term 315 H - - - -
C-term 316 I - - - -
C-term 317 A - - - -
C-term 318 K - - - -