6OIJ_refined

PROTEIN CLASS

Class A (Rhodopsin)

RECEPTOR

M1 receptor

SPECIES

Homo sapiens

STATE

Active (Δ distance (Å): 9.5 docs)

VERSION

2019-09-03

MODEL

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MAIN TEMPLATE

M1 receptor (sequence similarity: 100%) PDB: 6OIJ

TEMPLATES

5CXV (M1 receptor)
6OIJ (M1 receptor)
4AMJ (β1-adrenoceptor)
None
Main template (%) Additional templates (%) No template - freely modelled (%)
Backbone 87.9 4.9 7.2
Side-chains 82.6 8.2 9.2

Number of backbone templates: 3
Number of rotamer templates: 12

Segment Seq.num. GPCRdb# Backbone PDB Rotamer PDB
N-term 17 - - - -
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N-term 20 - - - -
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ECL2 175 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
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ECL2 177 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
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TM5 220 5.70x70 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
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TM5 223 5.73x73 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
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ICL3 226 - - - -
ICL3 227 - - - -
ICL3 228 - - - -
ICL3 229 - - - -
ICL3 230 - - - -
ICL3 349 - - - -
ICL3 350 - - - -
ICL3 351 - - - -
ICL3 352 - - - -
ICL3 353 - - - -
TM6 354 6.24x24 β1-adrenoceptor 4AMJ - -
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TM6 365 6.35x35 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
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TM6 375 6.45x45 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 376 6.46x46 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
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TM6 378 6.48x48 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 379 6.49x49 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 380 6.50x50 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
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TM6 383 6.53x53 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 384 6.54x54 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
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ECL3 392 - - - -
ECL3 393 M1 receptor 5CXV - -
ECL3 394 M1 receptor 5CXV M1 receptor 5CXV
ECL3 395 - - - -
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TM7 400 7.35x34 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
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TM7 411 7.46x46 M1 receptor 6OIJ M2 receptor 4MQT
TM7 412 7.47x47 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM7 413 7.48x48 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM7 414 7.49x49 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM7 415 7.50x50 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM7 416 7.51x51 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM7 417 7.52x52 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM7 418 7.53x53 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM7 419 7.54x54 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM7 420 7.55x55 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM7 421 7.56x56 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
H8 422 8.47x47 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
H8 423 8.48x48 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
H8 424 8.49x49 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
H8 425 8.50x50 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
H8 426 8.51x51 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
H8 427 8.52x52 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
H8 428 8.53x53 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
H8 429 8.54x54 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
H8 430 8.55x55 M1 receptor 6OIJ A2A receptor 5G53
H8 431 8.56x56 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
H8 432 8.57x57 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
H8 433 8.58x58 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
H8 434 8.59x59 M1 receptor 5CXV M1 receptor 5CXV
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