6OIJ_refined

PROTEIN CLASS

Class A (Rhodopsin)

RECEPTOR

M1 receptor

SPECIES

Homo sapiens

STATE

Active

VERSION

2020-09-02

MODEL

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PDB file contains GPCRdb generic numbers in the B-factor field of CA atoms

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MAIN TEMPLATE

M1 receptor (sequence similarity: 100%) PDB: 6OIJ

TEMPLATES

6WJC (M1 receptor)
6OIJ (M1 receptor)
6OL9 (M5 receptor)
None
Main template (%) Additional templates (%) No template - freely modelled (%)
Backbone 87.6 6.9 5.6
Side-chains 82.4 10.5 7.2

Number of backbone templates: 3
Number of rotamer templates: 10

Segment Seq.num. AA GPCRdb# Backbone PDB Rotamer PDB
N-term 17 A M1 receptor 6WJC M1 receptor 6WJC
N-term 18 P M1 receptor 6WJC M1 receptor 6WJC
N-term 19 G M1 receptor 6WJC M1 receptor 6WJC
N-term 20 K M1 receptor 6WJC M1 receptor 6WJC
N-term 21 G M1 receptor 6WJC M1 receptor 6WJC
TM1 22 P 1.29x29 M1 receptor 6WJC M1 receptor 6WJC
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TM1 24 Q 1.31x31 M1 receptor 6OIJ Rhodopsin 5DYS
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TM1 26 A 1.33x33 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM1 27 F 1.34x34 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM1 28 I 1.35x35 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM1 29 G 1.36x36 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM1 30 I 1.37x37 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM1 31 T 1.38x38 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM1 32 T 1.39x39 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM1 33 G 1.40x40 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM1 34 L 1.41x41 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
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TM1 38 A 1.45x45 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM1 39 T 1.46x46 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
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TM1 41 T 1.48x48 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM1 42 G 1.49x49 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM1 43 N 1.50x50 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM1 44 L 1.51x51 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM1 45 L 1.52x52 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM1 46 V 1.53x53 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM1 47 L 1.54x54 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM1 48 I 1.55x55 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM1 49 S 1.56x56 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM1 50 F 1.57x57 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM1 51 K 1.58x58 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
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TM2 74 I 2.53x53 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM2 75 G 2.54x54 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM2 76 T 2.55x55 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM2 77 F 2.56x551 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM2 78 S 2.57x56 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM2 79 M 2.58x57 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM2 80 N 2.59x58 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM2 81 L 2.60x59 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM2 82 Y 2.61x60 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM2 83 T 2.62x61 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM2 84 T 2.63x62 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM2 85 Y 2.64x63 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM2 86 L 2.65x64 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM2 87 L 2.66x65 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM2 88 M 2.67x66 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM2 89 G 2.68x67 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
ECL1 90 H 23.49x49 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
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ECL1 93 L 23.52x52 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM3 94 G 3.21x21 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM3 95 T 3.22x22 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM3 96 L 3.23x23 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM3 97 A 3.24x24 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM3 98 C 3.25x25 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
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TM3 102 L 3.29x29 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
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TM3 111 A 3.38x38 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
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TM3 118 L 3.45x45 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM3 119 I 3.46x46 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM3 120 S 3.47x47 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM3 121 F 3.48x48 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM3 122 D 3.49x49 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM3 123 R 3.50x50 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM3 124 Y 3.51x51 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM3 125 F 3.52x52 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM3 126 S 3.53x53 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM3 127 V 3.54x54 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM3 128 T 3.55x55 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM3 129 R 3.56x56 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
ICL2 130 P 34.50x50 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
ICL2 131 L 34.51x51 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
ICL2 132 S 34.52x52 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
ICL2 133 Y 34.53x53 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
ICL2 134 R 34.54x54 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
ICL2 135 A 34.55x55 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
ICL2 136 K 34.56x56 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
ICL2 137 R 34.57x57 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
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TM4 147 G 4.47x47 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM4 148 L 4.48x48 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
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TM4 150 W 4.50x50 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM4 151 L 4.51x51 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM4 152 V 4.52x52 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM4 153 S 4.53x53 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM4 154 F 4.54x54 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM4 155 V 4.55x55 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM4 156 L 4.56x56 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM4 157 W 4.57x57 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM4 158 A 4.58x58 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM4 159 P 4.59x59 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM4 160 A 4.60x60 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM4 161 I 4.61x61 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM4 162 L 4.62x62 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM4 163 F 4.63x63 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
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TM4 165 Q 4.65x65 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM4 166 Y 4.66x66 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM4 167 L 4.67x67 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM4 168 V 4.68x68 M1 receptor 6OIJ M2 receptor 4MQT
TM4 169 G 4.69x69 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
ECL2 170 E M1 receptor 6OIJ - -
ECL2 171 R M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
ECL2 172 T M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
ECL2 173 V M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
ECL2 174 L M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
ECL2 175 A M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
ECL2 176 G M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
ECL2 177 Q M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
ECL2 178 C 45.50x50 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
ECL2 179 Y 45.51x51 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
ECL2 180 I 45.52x52 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
ECL2 181 Q M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
ECL2 182 F M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
ECL2 183 L M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
ECL2 184 S M1 receptor 6OIJ - -
TM5 185 Q 5.35x36 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6WJC
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TM5 187 I 5.37x38 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM5 188 I 5.38x39 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM5 189 T 5.39x40 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM5 190 F 5.40x41 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM5 191 G 5.41x42 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM5 192 T 5.42x43 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM5 193 A 5.43x44 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM5 194 M 5.44x45 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6WJC
TM5 195 A 5.45x46 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM5 196 A 5.46x461 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM5 197 F 5.47x47 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM5 198 Y 5.48x48 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM5 199 L 5.49x49 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM5 200 P 5.50x50 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM5 201 V 5.51x51 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM5 202 T 5.52x52 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM5 203 V 5.53x53 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM5 204 M 5.54x54 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM5 205 C 5.55x55 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM5 206 T 5.56x56 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM5 207 L 5.57x57 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM5 208 Y 5.58x58 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM5 209 W 5.59x59 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM5 210 R 5.60x60 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM5 211 I 5.61x61 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM5 212 Y 5.62x62 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM5 213 R 5.63x63 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM5 214 E 5.64x64 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM5 215 T 5.65x65 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM5 216 E 5.66x66 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM5 217 N 5.67x67 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM5 218 R 5.68x68 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM5 219 A 5.69x69 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM5 220 R 5.70x70 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM5 221 E 5.71x71 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM5 222 L 5.72x72 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM5 223 A 5.73x73 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM5 224 A 5.74x74 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM5 225 L 5.75x75 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
ICL3 226 Q - - - -
ICL3 227 G - - - -
ICL3 228 S - - - -
ICL3 229 E - - - -
ICL3 230 T - - - -
ICL3 349 L - - - -
ICL3 350 A - - - -
ICL3 351 K - - - -
ICL3 352 R - - - -
ICL3 353 K - - - -
TM6 354 T 6.24x24 M5 receptor 6OL9 - -
TM6 355 F 6.25x25 M5 receptor 6OL9 - -
TM6 356 S 6.26x26 M5 receptor 6OL9 D2 receptor 6VMS
TM6 357 L 6.27x27 M5 receptor 6OL9 M5 receptor 6OL9
TM6 358 V 6.28x28 M5 receptor 6OL9 M5 receptor 6OL9
TM6 359 K 6.29x29 M5 receptor 6OL9 M5 receptor 6OL9
TM6 360 E 6.30x30 M5 receptor 6OL9 M5 receptor 6OL9
TM6 361 K 6.31x31 M5 receptor 6OL9 M2 receptor 6OIK
TM6 362 K 6.32x32 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 363 A 6.33x33 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 364 A 6.34x34 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 365 R 6.35x35 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 366 T 6.36x36 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 367 L 6.37x37 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 368 S 6.38x38 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6WJC
TM6 369 A 6.39x39 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 370 I 6.40x40 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 371 L 6.41x41 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 372 L 6.42x42 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 373 A 6.43x43 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 374 F 6.44x44 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 375 I 6.45x45 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 376 L 6.46x46 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 377 T 6.47x47 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 378 W 6.48x48 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 379 T 6.49x49 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 380 P 6.50x50 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 381 Y 6.51x51 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 382 N 6.52x52 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
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TM6 384 M 6.54x54 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 385 V 6.55x55 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 386 L 6.56x56 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 387 V 6.57x57 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 388 S 6.58x58 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 389 T 6.59x59 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 390 F 6.60x60 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 391 C 6.61x61 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
ECL3 392 K - - - -
ECL3 393 D M1 receptor 6WJC - -
ECL3 394 C M1 receptor 6WJC M1 receptor 6WJC
ECL3 395 V - - - -
TM7 396 P 7.31x30 M1 receptor 6WJC M1 receptor 6WJC
TM7 397 E 7.32x31 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM7 398 T 7.33x32 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM7 399 L 7.34x33 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM7 400 W 7.35x34 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM7 401 E 7.36x35 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM7 402 L 7.37x36 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM7 403 G 7.38x37 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM7 404 Y 7.39x38 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM7 405 W 7.40x39 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM7 406 L 7.41x40 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM7 407 C 7.42x41 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM7 408 Y 7.43x42 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM7 409 V 7.44x43 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM7 410 N 7.45x45 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM7 411 S 7.46x46 M1 receptor 6OIJ M2 receptor 4MQT
TM7 412 T 7.47x47 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM7 413 I 7.48x48 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM7 414 N 7.49x49 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM7 415 P 7.50x50 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM7 416 M 7.51x51 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM7 417 C 7.52x52 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM7 418 Y 7.53x53 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM7 419 A 7.54x54 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM7 420 L 7.55x55 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM7 421 C 7.56x56 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
H8 422 N 8.47x47 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
H8 423 K 8.48x48 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
H8 424 A 8.49x49 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
H8 425 F 8.50x50 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
H8 426 R 8.51x51 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
H8 427 D 8.52x52 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
H8 428 T 8.53x53 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
H8 429 F 8.54x54 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
H8 430 R 8.55x55 M1 receptor 6OIJ α2B-adrenoceptor 6K41
H8 431 L 8.56x56 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
H8 432 L 8.57x57 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
H8 433 L 8.58x58 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
H8 434 L 8.59x59 M1 receptor 6WJC M1 receptor 6WJC
H8 435 C 8.60x60 M1 receptor 6WJC M1 receptor 6WJC
C-term 436 R - - - -
C-term 437 W - - - -
C-term 438 D - - - -
C-term 439 K - - - -
C-term 440 R - - - -