6OMM_refined

PROTEIN CLASS

Class A (Rhodopsin)

RECEPTOR

SPECIES

Homo sapiens

STATE

Active

VERSION

2020-11-03

MODEL

PDB file contains GPCRdb generic numbers in the B-factor field of CA atoms

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MAIN TEMPLATE

FPR2/ALX (sequence similarity: 100%) PDB: 6OMM

TEMPLATES

6LW5 (FPR2/ALX)
6OMM (FPR2/ALX)
None
Main template (%) Additional templates (%) No template - freely modelled (%)
Backbone 92.9 3.2 3.9
Side-chains 92.9 3.2 3.9

Number of backbone templates: 2
Number of rotamer templates: 2

Segment Seq.num. AA GPCRdb# Backbone PDB Rotamer PDB
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TM6 251 F 6.45x45 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 252 I 6.46x46 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 253 C 6.47x47 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 254 W 6.48x48 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 255 F 6.49x49 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 256 P 6.50x50 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 257 F 6.51x51 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 258 Q 6.52x52 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 259 L 6.53x53 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 260 V 6.54x54 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 261 A 6.55x55 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 262 L 6.56x56 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 263 L 6.57x57 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 264 G 6.58x58 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 265 T 6.59x59 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 266 V 6.60x60 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 267 W 6.61x61 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
ECL3 268 L - - - -
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ECL3 270 E FPR2/ALX 6LW5 FPR2/ALX 6LW5
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ECL3 275 G FPR2/ALX 6LW5 FPR2/ALX 6LW5
ECL3 276 K - - - -
TM7 277 Y 7.28x27 FPR2/ALX 6LW5 FPR2/ALX 6LW5
TM7 278 K 7.29x28 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM7 279 I 7.30x29 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM7 280 I 7.31x30 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
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TM7 285 N 7.36x35 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM7 286 P 7.37x36 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
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TM7 290 L 7.41x40 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM7 291 A 7.42x41 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
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TM7 295 S 7.46x46 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
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H8 317 L 8.58x58 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
C-term 318 P - - - -
C-term 319 T - - - -
C-term 320 S - - - -
C-term 321 L - - - -
C-term 322 E - - - -