ADGRF1 homology model

PROTEIN CLASS

Class B2 (Adhesion)

RECEPTOR

ADGRF1

SPECIES

Homo sapiens

STATE

Intermediate

VERSION

2022-06-19

MODEL

PDB file contains GPCRdb generic numbers in the B-factor field of CA atoms

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MAIN TEMPLATE

GLP-1 receptor (sequence similarity: 12%) PDB: 5NX2
Align

TEMPLATES

7WU3 (ADGRF1)
5NX2 (GLP-1 receptor)
6VN7 (VPAC1 receptor)
None
Main template (%) Additional templates (%) No template - freely modelled (%)
Backbone 74.9 15.1 10.0
Side-chains 13.7 71.5 14.8

Number of backbone templates: 3
Number of rotamer templates: 7

Segment Seq.num. AA GPCRdb# Backbone PDB Rotamer PDB
N-term 573 M - ADGRF1 7WU3 ADGRF1 7WU3
N-term 574 S - ADGRF1 7WU3 ADGRF1 7WU3
N-term 575 P - ADGRF1 7WU3 ADGRF1 7WU3
N-term 576 F - ADGRF1 7WU3 ADGRF1 7WU3
N-term 577 V - ADGRF1 7WU3 ADGRF1 7WU3
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ICL1 616 K - - - - -
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TM2 627 M 2.50x50 GLP-1 receptor 5NX2 ADGRF1 7WU3
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TM2 647 V 2.70x70 GLP-1 receptor 5NX2 ADGRF1 7WU3
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ECL1 650 T - - - - -
ECL1 651 V - - - - -
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TM4 717 T 4.60x60 GLP-1 receptor 5NX2 ADGRF1 7WU3
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TM4 719 A 4.62x62 GLP-1 receptor 5NX2 ADGRF1 7WU3
TM4 720 V 4.63x63 GLP-1 receptor 5NX2 GLP-1 receptor 5NX2
TM4 721 T 4.64x64 GLP-1 receptor 5NX2 ADGRF1 7WU3
TM4 722 Q 4.65x65 GLP-1 receptor 5NX2 ADGRF1 7WU3
ECL2 723 P - - - - -
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ECL2 725 N - ADGRF1 7WU3 ADGRF1 7WU3
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ECL2 732 V - - - - -
ECL2 733 C 45.50x50 GLP-1 receptor 5NX2 GLP-1 receptor 5NX2
ECL2 734 W 45.51x51 GLP-1 receptor 5NX2 GLP-1 receptor 5NX2
ECL2 735 L 45.52x52 GLP-1 receptor 5NX2 ADGRL3 7SF7
ECL2 736 N - - - - -
ECL2 737 W - ADGRF1 7WU3 ADGRF1 7WU3
ECL2 738 S - ADGRF1 7WU3 ADGRF1 7WU3
ECL2 739 N - ADGRF1 7WU3 - -
ECL2 740 G - ADGRF1 7WU3 ADGRF1 7WU3
ECL2 741 S - - - - -
TM5 742 K 5.34x34 GLP-1 receptor 5NX2 GIP receptor 7FIN
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TM5 744 L 5.36x36 GLP-1 receptor 5NX2 ADGRF1 7WU3
TM5 745 L 5.37x37 GLP-1 receptor 5NX2 ADGRF1 7WU3
TM5 746 A 5.38x38 ADGRF1 7WU3 ADGRF1 7WU3
TM5 747 F 5.39x39 ADGRF1 7WU3 ADGRF1 7WU3
TM5 748 V 5.40x40 GLP-1 receptor 5NX2 ADGRF1 7WU3
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TM5 750 P 5.42x42 GLP-1 receptor 5NX2 GLP-1 receptor 5NX2
TM5 751 A 5.43x43 GLP-1 receptor 5NX2 ADGRF1 7WU3
TM5 752 L 5.44x44 GLP-1 receptor 5NX2 GLP-1 receptor 5NX2
TM5 753 A 5.45x45 GLP-1 receptor 5NX2 ADGRF1 7WU3
TM5 754 I 5.46x46 GLP-1 receptor 5NX2 ADGRF1 7WU3
TM5 755 V 5.47x47 GLP-1 receptor 5NX2 ADGRF1 7WU3
TM5 756 A 5.48x48 GLP-1 receptor 5NX2 ADGRF1 7WU3
TM5 757 V 5.49x49 GLP-1 receptor 5NX2 GLP-1 receptor 5NX2
TM5 758 N 5.50x50 GLP-1 receptor 5NX2 GLP-1 receptor 5NX2
TM5 759 F 5.51x51 GLP-1 receptor 5NX2 GLP-1 receptor 5NX2
TM5 760 V 5.52x52 GLP-1 receptor 5NX2 ADGRF1 7WU3
TM5 761 V 5.53x53 GLP-1 receptor 5NX2 ADGRF1 7WU3
TM5 762 V 5.54x54 GLP-1 receptor 5NX2 ADGRF1 7WU3
TM5 763 L 5.55x55 GLP-1 receptor 5NX2 ADGRF1 7WU3
TM5 764 L 5.56x56 GLP-1 receptor 5NX2 ADGRF1 7WU3
TM5 765 V 5.57x57 GLP-1 receptor 5NX2 GLP-1 receptor 5NX2
TM5 766 L 5.58x58 GLP-1 receptor 5NX2 ADGRF1 7WU3
TM5 767 T 5.59x59 GLP-1 receptor 5NX2 ADGRF1 7WU3
TM5 768 K 5.60x60 GLP-1 receptor 5NX2 ADGRF1 7WU3
TM5 769 L 5.61x61 GLP-1 receptor 5NX2 ADGRF1 7WU3
TM5 770 W 5.62x62 GLP-1 receptor 5NX2 ADGRF1 7WU3
TM5 771 R 5.63x63 GLP-1 receptor 5NX2 secretin receptor 6WZG
ICL3 772 P - - - - -
ICL3 773 T - - - - -
ICL3 774 V - - - - -
ICL3 775 G - - - - -
ICL3 776 E - - - - -
ICL3 777 R - - - - -
ICL3 778 L - - - - -
ICL3 779 S - - - - -
ICL3 780 R - - - - -
TM6 781 D 6.30x30 GLP-1 receptor 5NX2 PTH1 receptor 6FJ3
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TM6 783 K 6.32x32 GLP-1 receptor 5NX2 - -
TM6 784 A 6.33x33 GLP-1 receptor 5NX2 ADGRF1 7WU3
TM6 785 T 6.34x34 GLP-1 receptor 5NX2 ADGRF1 7WU3
TM6 786 I 6.35x35 GLP-1 receptor 5NX2 ADGRF1 7WU3
TM6 787 I 6.36x36 GLP-1 receptor 5NX2 ADGRF1 7WU3
TM6 788 R 6.37x37 GLP-1 receptor 5NX2 GLP-1 receptor 5NX2
TM6 789 V 6.38x38 GLP-1 receptor 5NX2 ADGRF1 7WU3
TM6 790 G 6.39x39 GLP-1 receptor 5NX2 ADGRF1 7WU3
TM6 791 K 6.40x40 GLP-1 receptor 5NX2 GLP-1 receptor 5NX2
TM6 792 S 6.41x41 GLP-1 receptor 5NX2 GLP-1 receptor 5NX2
TM6 793 L 6.42x42 GLP-1 receptor 5NX2 ADGRF1 7WU3
TM6 794 L 6.43x43 GLP-1 receptor 5NX2 GLP-1 receptor 5NX2
TM6 795 I 6.44x44 GLP-1 receptor 5NX2 ADGRF1 7WU3
TM6 796 L 6.45x45 GLP-1 receptor 5NX2 GLP-1 receptor 5NX2
TM6 797 T 6.46x46 GLP-1 receptor 5NX2 ADGRF1 7WU3
TM6 798 P 6.47x47 GLP-1 receptor 5NX2 ADGRF1 7WU3
TM6 799 L 6.48x48 GLP-1 receptor 5NX2 GLP-1 receptor 5NX2
TM6 800 L 6.49x49 GLP-1 receptor 5NX2 GLP-1 receptor 5NX2
TM6 801 G 6.50x50 GLP-1 receptor 5NX2 ADGRF1 7WU3
TM6 802 L 6.51x51 GLP-1 receptor 5NX2 ADGRF1 7WU3
TM6 803 T 6.52x52 GLP-1 receptor 5NX2 ADGRF1 7WU3
TM6 804 W 6.53x53 GLP-1 receptor 5NX2 ADGRF1 7WU3
TM6 805 G 6.54x54 GLP-1 receptor 5NX2 ADGRF1 7WU3
TM6 806 F 6.55x55 GLP-1 receptor 5NX2 ADGRF1 7WU3
TM6 807 G 6.56x56 GLP-1 receptor 5NX2 ADGRF1 7WU3
TM6 808 I 6.57x57 GLP-1 receptor 5NX2 ADGRF1 7WU3
TM6 809 G 6.58x58 GLP-1 receptor 5NX2 ADGRF1 7WU3
TM6 810 T 6.59x59 ADGRF1 7WU3 ADGRF1 7WU3
TM6 811 I 6.60x60 ADGRF1 7WU3 ADGRF1 7WU3
TM6 812 V 6.61x61 ADGRF1 7WU3 ADGRF1 7WU3
TM6 813 D 6.62x62 ADGRF1 7WU3 ADGRF1 7WU3
TM6 814 S 6.63x63 ADGRF1 7WU3 ADGRF1 7WU3
ECL3 815 Q - - - - -
TM7 816 N 7.35x34 GLP-1 receptor 5NX2 - -
TM7 817 L 7.36x35 GLP-1 receptor 5NX2 ADGRF1 7WU5
TM7 818 A 7.37x36 GLP-1 receptor 5NX2 ADGRF1 7WU3
TM7 819 W 7.38x37 GLP-1 receptor 5NX2 ADGRF1 7WU3
TM7 820 H 7.39x38 GLP-1 receptor 5NX2 ADGRF1 7WU3
TM7 821 V 7.40x39 GLP-1 receptor 5NX2 ADGRF1 7WU3
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TM7 829 F 7.48x47 GLP-1 receptor 5NX2 GLP-1 receptor 5NX2
TM7 830 Q 7.49x49 GLP-1 receptor 5NX2 GLP-1 receptor 5NX2
TM7 831 G 7.50x50 GLP-1 receptor 5NX2 GLP-1 receptor 5NX2
TM7 832 F 7.51x51 GLP-1 receptor 5NX2 ADGRF1 7WU3
TM7 833 F 7.52x52 GLP-1 receptor 5NX2 ADGRF1 7WU3
TM7 834 I 7.53x53 GLP-1 receptor 5NX2 ADGRF1 7WU3
TM7 835 L 7.54x54 GLP-1 receptor 5NX2 ADGRF1 7WU3
TM7 836 C 7.55x55 GLP-1 receptor 5NX2 ADGRF1 7WU3
TM7 837 F 7.56x56 GLP-1 receptor 5NX2 ADGRF1 7WU3
TM7 838 G 7.57x57 GLP-1 receptor 5NX2 ADGRF1 7WU3
TM7 839 I 7.58x58 GLP-1 receptor 5NX2 ADGRF1 7WU3
TM7 840 L 7.59x59 GLP-1 receptor 5NX2 ADGRF1 7WU3
TM7 841 L 7.60x60 GLP-1 receptor 5NX2 ADGRF1 7WU3
H8 842 D 8.47x47 GLP-1 receptor 5NX2 ADGRF1 7WU3
H8 843 S 8.48x48 GLP-1 receptor 5NX2 ADGRF1 7WU3
H8 844 K 8.49x49 GLP-1 receptor 5NX2 ADGRF1 7WU3
H8 845 L 8.50x50 GLP-1 receptor 5NX2 ADGRF1 7WU3
H8 846 R 8.51x51 GLP-1 receptor 5NX2 ADGRF1 7WU3
H8 847 Q 8.52x52 GLP-1 receptor 5NX2 ADGRF1 7WU3
H8 848 L 8.53x53 GLP-1 receptor 5NX2 ADGRF1 7WU3
H8 849 L 8.54x54 GLP-1 receptor 5NX2 ADGRF1 7WU3
H8 850 F 8.55x55 GLP-1 receptor 5NX2 ADGRF1 7WU3
H8 851 N 8.56x56 GLP-1 receptor 5NX2 ADGRF1 7WU3
H8 852 K 8.57x57 GLP-1 receptor 5NX2 ADGRF1 7WU3
H8 853 L 8.58x58 VPAC1 receptor 6VN7 ADGRL3 7SF7
H8 854 S 8.59x59 VPAC1 receptor 6VN7 PTH1 receptor 6FJ3
H8 855 A 8.60x60 VPAC1 receptor 6VN7 - -
H8 856 L 8.61x61 VPAC1 receptor 6VN7 - -
H8 857 S 8.62x62 VPAC1 receptor 6VN7 - -
H8 858 S 8.63x63 VPAC1 receptor 6VN7 - -
C-term 859 W - - - - -
C-term 860 K - - - - -
C-term 861 Q - - - - -
C-term 862 T - - - - -
C-term 863 E - - - - -