GPR179 homology model

PROTEIN CLASS

Class C (Glutamate)

RECEPTOR

GPR179

SPECIES

Homo sapiens

STATE

Active

VERSION

2021-11-02

MODEL

PDB file contains GPCRdb generic numbers in the B-factor field of CA atoms

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MAIN TEMPLATE

GABAB2 (sequence similarity: 8%) PDB: 7C7Q
Align

TEMPLATES

7C7Q (GABAB2)
6WIV (GABAB2)
7CA5 (GABAB2)
4OO9 (mGlu5 receptor)
None
Main template (%) Additional templates (%) No template - freely modelled (%)
Backbone 88.2 1.3 10.4
Side-chains 60.7 8.9 30.4

Number of backbone templates: 4
Number of rotamer templates: 11

Segment Seq.num. AA GPCRdb# Backbone PDB Rotamer PDB
N-term 54 E - GABAB2 7C7Q GABAB2 7C7Q
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N-term 355 Q - GABAB2 7C7Q GABAB2 7C7Q
N-term 356 C - GABAB2 7C7Q GABAB2 7C7Q
N-term 357 L - GABAB2 7C7Q GABAB2 7C7Q
N-term 358 P - GABAB2 7C7Q GABAB2 7C7Q
N-term 359 C - GABAB2 7C7Q GABAB2 7C7Q
N-term 360 P - GABAB2 7C7Q GABAB2 7C7Q
N-term 361 E - GABAB2 7C7Q GABAB2 7C7Q
N-term 362 G - GABAB2 7C7Q GABAB2 7C7Q
N-term 363 C - GABAB2 7C7Q GABAB2 7C7Q
N-term 364 T - GABAB2 7C7Q GABAB2 7C7Q
N-term 365 S - GABAB2 7C7Q GABAB2 7C7Q
N-term 366 C - GABAB2 7C7Q GABAB2 7C7Q
N-term 367 M - GABAB2 7C7Q GABAB2 7C7Q
N-term 368 D - GABAB2 7C7Q GABAB2 7C7Q
N-term 369 A - GABAB2 7C7Q GABAB2 7C7Q
N-term 370 T - GABAB2 7C7Q GABAB2 7C7Q
N-term 371 P - GABAB2 7C7Q GABAB2 7C7Q
N-term 372 C - GABAB2 7C7Q GABAB2 7C7Q
N-term 373 L - GABAB2 7C7Q GABAB2 7C7Q
N-term 374 V - GABAB2 7C7Q GABAB2 7C7Q
N-term 375 E - GABAB2 7C7Q GABAB2 7C7Q
N-term 376 E - GABAB2 7C7Q GABAB2 7C7Q
TM1 377 A 1.36x36 GABAB2 7C7Q - -
TM1 378 A 1.37x37 GABAB2 7C7Q - -
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ECL2 508 W - - - - -
ECL2 509 T - - - - -
ECL2 510 V - - - - -
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ECL2 524 I - - - - -
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ECL2 526 G - - - - -
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ECL2 529 P - - - - -
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ECL2 531 G - - - - -
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ICL3 568 L - - - - -
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ICL3 570 A - - - - -
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ICL3 572 H - - - - -
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ECL3 599 V - - - - -
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ECL3 601 S - - - - -
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C-term 650 E - - - - -
C-term 651 L - - - - -
C-term 652 D - - - - -
C-term 653 L - - - - -
C-term 654 Q - - - - -