GPR179 homology model

PROTEIN CLASS

Class C (Glutamate)

RECEPTOR

GPR179

SPECIES

Homo sapiens

STATE

Active

VERSION

2022-06-19

MODEL

PDB file contains GPCRdb generic numbers in the B-factor field of CA atoms

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MAIN TEMPLATE

GABAB2 (sequence similarity: 8%) PDB: 7C7Q
Align

TEMPLATES

7C7Q (GABAB2)
7CA5 (GABAB2)
7EWP (GPR158)
4OO9 (mGlu5 receptor)
None
Main template (%) Additional templates (%) No template - freely modelled (%)
Backbone 85.5 9.0 5.5
Side-chains 60.1 21.0 19.0

Number of backbone templates: 4
Number of rotamer templates: 11

Segment Seq.num. AA GPCRdb# Backbone PDB Rotamer PDB
N-term 54 E - GABAB2 7C7Q GABAB2 7C7Q
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TM7 630 K 7.51x51 GABAB2 7C7Q GABAB2 7C7Q
TM7 631 F 7.52x52 GABAB2 7C7Q GPR158 7SHE
TM7 632 W 7.53x53 GABAB2 7C7Q - -
TM7 633 K 7.54x54 GABAB2 7C7Q - -
TM7 634 L 7.55x55 GABAB2 7C7Q GABAB2 7C7Q
TM7 635 G 7.56x56 GABAB2 7C7Q - -
TM7 636 A 7.57x57 GABAB2 7CA5 mGlu5 receptor 6FFI
TM7 637 P 7.58x58 GABAB2 7CA5 - -
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H8 639 R 8.47x47 mGlu5 receptor 4OO9 - -
H8 640 E 8.48x48 mGlu5 receptor 4OO9 - -
H8 641 E 8.49x49 mGlu5 receptor 4OO9 - -
H8 642 M 8.50x50 - - - -
H8 643 V 8.51x51 - - - -
H8 644 D 8.52x52 - - - -
H8 645 E 8.53x53 - - - -
H8 646 V 8.54x54 - - - -
H8 647 C 8.55x55 - - - -
H8 648 E 8.56x56 - - - -
H8 649 D 8.57x57 - - - -
C-term 650 E - - - - -
C-term 651 L - - - - -
C-term 652 D - - - - -
C-term 653 L - - - - -
C-term 654 Q - - - - -