GPR179 homology model

PROTEIN CLASS

Class C (Glutamate)

RECEPTOR

GPR179

SPECIES

Homo sapiens

STATE

Intermediate

VERSION

2022-06-19

MODEL

PDB file contains GPCRdb generic numbers in the B-factor field of CA atoms

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MAIN TEMPLATE

GABAB2 (sequence similarity: 8%) PDB: 7CA5
Align

TEMPLATES

7SHE (GPR158)
7EWP (GPR158)
7CA5 (GABAB2)
7C7Q (GABAB2)
4OO9 (mGlu5 receptor)
None
Main template (%) Additional templates (%) No template - freely modelled (%)
Backbone 69.1 21.2 9.7
Side-chains 2.5 57.9 39.6

Number of backbone templates: 5
Number of rotamer templates: 14

Segment Seq.num. AA GPCRdb# Backbone PDB Rotamer PDB
TM1 377 A 1.36x36 GPR158 7SHE - -
TM1 378 A 1.37x37 GPR158 7SHE - -
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ICL3 571 F - - - - -
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TM6 598 L 6.60x60 GPR158 7EWP GPR158 7EWP
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TM7 626 I 7.47x471 GABAB2 7CA5 CaS receptor 7DD5
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TM7 633 K 7.54x54 GABAB2 7CA5 - -
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C-term 650 E - - - - -
C-term 651 L - - - - -
C-term 652 D - - - - -
C-term 653 L - - - - -
C-term 654 Q - - - - -