6W2Y refined

PROTEIN CLASS

Class C (Glutamate)

RECEPTOR

SPECIES

Homo sapiens

STATE

Inactive

VERSION

2021-10-06

MODEL

PDB file contains GPCRdb generic numbers in the B-factor field of CA atoms

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MAIN TEMPLATE

GABAB1 (sequence similarity: 100%) PDB: 6W2Y

TEMPLATES

6W2Y (GABAB1)
7CA5 (GABAB2)
7C7Q (GABAB2)
4OO9 (mGlu5 receptor)
None
Main template (%) Additional templates (%) No template - freely modelled (%)
Backbone 93.8 1.3 5.0
Side-chains 82.2 4.4 13.4

Number of backbone templates: 4
Number of rotamer templates: 9

Segment Seq.num. AA GPCRdb# Backbone PDB Rotamer PDB
N-term 166 E - GABAB1 6W2Y GABAB1 6W2Y
N-term 167 R - GABAB1 6W2Y GABAB1 6W2Y
N-term 168 R - GABAB1 6W2Y GABAB1 6W2Y
N-term 169 A - GABAB1 6W2Y GABAB1 6W2Y
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N-term 173 G - GABAB1 6W2Y GABAB1 6W2Y
N-term 174 A - GABAB1 6W2Y GABAB1 6W2Y
N-term 175 L - GABAB1 6W2Y GABAB1 6W2Y
N-term 176 F - GABAB1 6W2Y GABAB1 6W2Y
N-term 177 P - GABAB1 6W2Y GABAB1 6W2Y
N-term 178 M - GABAB1 6W2Y GABAB1 6W2Y
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N-term 181 G - GABAB1 6W2Y GABAB1 6W2Y
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N-term 201 S - GABAB1 6W2Y GABAB1 6W2Y
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N-term 241 I - GABAB1 6W2Y GABAB1 6W2Y
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N-term 248 S - GABAB1 6W2Y GABAB1 6W2Y
N-term 249 V - GABAB1 6W2Y GABAB1 6W2Y
N-term 250 S - GABAB1 6W2Y GABAB1 6W2Y
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N-term 279 R - GABAB1 6W2Y GABAB1 6W2Y
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ECL2 746 P - GABAB1 6W2Y GABAB1 6W2Y
ECL2 747 K - - - - -
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ECL2 758 L - GABAB1 6W2Y - -
ECL2 759 E - GABAB1 6W2Y - -
ECL2 760 H - GABAB1 6W2Y GABAB1 6W2Y
ECL2 761 C 45.50x50 GABAB1 6W2Y GABAB1 6W2Y
ECL2 762 S 45.51x51 GABAB1 6W2Y - -
ECL2 763 S 45.52x52 GABAB1 6W2Y GABAB1 6W2Y
ECL2 764 R - GABAB1 6W2Y - -
TM5 765 K 5.35x35 GABAB1 6W2Y - -
TM5 766 M 5.36x36 GABAB1 6W2Y GABAB2 6WIV
TM5 767 N 5.37x37 GABAB1 6W2Y GABAB1 6W2Y
TM5 768 T 5.38x38 GABAB1 6W2Y GABAB1 6W2Y
TM5 769 W 5.39x39 GABAB1 6W2Y GABAB1 6W2Y
TM5 770 L 5.40x40 GABAB1 6W2Y GABAB1 6W2Y
TM5 771 G 5.41x41 GABAB1 6W2Y GABAB1 6W2Y
TM5 772 I 5.42x42 GABAB1 6W2Y GABAB1 6W2Y
TM5 773 F 5.43x43 GABAB1 6W2Y GABAB1 6W2Y
TM5 774 Y 5.44x44 GABAB1 6W2Y GABAB1 6W2Y
TM5 775 G 5.45x45 GABAB1 6W2Y GABAB1 6W2Y
TM5 776 Y 5.46x46 GABAB1 6W2Y GABAB1 6W2Y
TM5 777 K 5.47x47 GABAB1 6W2Y GABAB1 6W2Y
TM5 778 G 5.48x48 GABAB1 6W2Y GABAB1 6W2Y
TM5 779 L 5.49x49 GABAB1 6W2Y GABAB1 6W2Y
TM5 780 L 5.50x50 GABAB1 6W2Y GABAB1 6W2Y
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TM5 785 I 5.55x55 GABAB1 6W2Y GABAB1 6W2Y
TM5 786 F 5.56x56 GABAB1 6W2Y GABAB2 6WIV
TM5 787 L 5.57x57 GABAB1 6W2Y GABAB2 6WIV
TM5 788 A 5.58x58 GABAB1 6W2Y GABAB1 6W2Y
TM5 789 Y 5.59x59 GABAB1 6W2Y - -
TM5 790 E 5.60x60 GABAB1 6W2Y GABAB2 6WIV
TM5 791 T 5.61x61 GABAB1 6W2Y GABAB2 6WIV
TM5 792 K 5.62x62 GABAB1 6W2Y - -
ICL3 793 S - GABAB1 6W2Y - -
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ICL3 795 S - - - - -
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ICL3 797 E - - - - -
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ICL3 799 I - - - - -
ICL3 800 N - GABAB1 6W2Y - -
TM6 801 D 6.35x35 GABAB2 7C7Q GABAB2 7C7Q
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TM6 805 V 6.39x39 GABAB1 6W2Y - -
TM6 806 G 6.40x40 GABAB1 6W2Y GABAB1 6W2Y
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TM6 808 A 6.42x42 GABAB1 6W2Y GABAB1 6W2Y
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TM6 811 N 6.45x45 GABAB1 6W2Y GABAB1 6W2Y
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TM6 816 C 6.50x50 GABAB1 6W2Y GABAB1 6W2Y
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TM6 819 T 6.53x53 GABAB1 6W2Y GABAB1 6W2Y
TM6 820 A 6.54x54 GABAB1 6W2Y GABAB1 6W2Y
TM6 821 P 6.55x55 GABAB1 6W2Y GABAB1 6W2Y
TM6 822 V 6.56x56 GABAB1 6W2Y GABAB1 6W2Y
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TM6 824 M 6.58x58 GABAB1 6W2Y GABAB1 6W2Y
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TM6 826 L 6.60x60 GABAB1 6W2Y GABAB1 6W2Y
ECL3 827 S - GABAB1 6W2Y GABAB1 6W2Y
ECL3 828 S - GABAB1 6W2Y - -
ECL3 829 Q - GABAB1 6W2Y GABAB1 6W2Y
ECL3 830 Q - GABAB1 6W2Y - -
ECL3 831 D - GABAB1 6W2Y - -
TM7 832 A 7.27x28 GABAB1 6W2Y GABAB1 6W2Y
TM7 833 A 7.28x29 GABAB1 6W2Y GABAB1 6W2Y
TM7 834 F 7.29x30 GABAB1 6W2Y GABAB1 6W2Y
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TM7 837 A 7.32x33 GABAB1 6W2Y GABAB1 6W2Y
TM7 838 S 7.33x34 GABAB1 6W2Y - -
TM7 839 L 7.34x35 GABAB1 6W2Y GABAB1 6W2Y
TM7 840 A 7.35x36 GABAB1 6W2Y GABAB1 6W2Y
TM7 841 I 7.36x37 GABAB1 6W2Y GABAB1 6W2Y
TM7 842 V 7.37x38 GABAB1 6W2Y GABAB1 6W2Y
TM7 843 F 7.38x39 GABAB1 6W2Y GABAB1 6W2Y
TM7 844 S 7.39x40 GABAB1 6W2Y mGlu7 receptor 7EPC
TM7 845 S 7.40x41 GABAB1 6W2Y GABAB2 6WIV
TM7 846 Y 7.41x42 GABAB1 6W2Y GABAB1 6W2Y
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TM7 850 V 7.45x46 GABAB1 6W2Y GABAB1 6W2Y
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TM7 852 L 7.47x471 GABAB1 6W2Y GABAB1 6W2Y
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TM7 855 P 7.50x50 GABAB1 6W2Y GABAB1 6W2Y
TM7 856 K 7.51x51 GABAB1 6W2Y GABAB2 6WIV
TM7 857 M 7.52x52 GABAB1 6W2Y mGlu1 receptor 4OR2
TM7 858 R 7.53x53 GABAB1 6W2Y - -
TM7 859 R 7.54x54 GABAB1 6W2Y - -
TM7 860 L 7.55x55 GABAB1 6W2Y GABAB2 6WIV
TM7 861 I 7.56x56 GABAB1 6W2Y - -
TM7 862 T 7.57x57 GABAB2 7CA5 GABAB2 6WIV
TM7 863 R 7.58x58 GABAB2 7CA5 - -
H8 864 G 8.46x46 mGlu5 receptor 4OO9 - -
H8 865 E 8.47x47 mGlu5 receptor 4OO9 mGlu5 receptor 4OO9
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H8 867 Q 8.49x49 mGlu5 receptor 4OO9 - -
H8 868 S 8.50x50 - - - -
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H8 870 A 8.52x52 - - - -
H8 871 Q 8.53x53 - - - -
H8 872 D 8.54x54 - - - -
H8 873 T 8.55x55 - - - -
H8 874 M 8.56x56 - - - -
H8 875 K 8.57x57 - - - -
C-term 876 T - - - - -
C-term 877 G - - - - -
C-term 878 S - - - - -
C-term 879 S - - - - -
C-term 880 T - - - - -