CCR6 (q5bk58_rat)

FAMILY

Class A (Rhodopsin) Protein receptors Chemokine receptors CCR6

GENE

Ccr6 ()

ORGANISM

Rat (Rattus norvegicus)

ALT. NAMES

C-C motif chemokine receptor 6, CC chemokine receptor 6

SOURCE

TREMBL

SEQUENCE

N-term        
M
N
F
T
E
A
N
Y
G
M
10
                   
E
D
Y
T
G
S
D
Y
S
M
20
                   
F
P
E
T
E
P
C
S
L
Q
30
TM1              
E
V
R
D
F
T
K
V
F
V
40
                   
P
I
A
Y
S
L
I
C
V
F
50
                   
G
L
L
G
N
I
M
V
V
I
60
          ICL1  
T
F
A
F
Y
K
K
A
R
S
70
TM2              
M
T
D
V
Y
L
L
N
M
A
80
                   
I
T
D
I
L
F
V
L
T
L
90
                   
P
F
W
A
V
T
H
A
T
D
100
ECL1 TM3      
T
W
I
F
G
N
T
M
C
K
110
                   
L
M
K
G
T
Y
A
V
N
F
120
                   
N
C
G
M
L
L
L
A
C
I
130
                   
S
M
D
R
Y
I
A
I
V
Q
140
ICL2            
A
T
K
S
F
R
V
R
S
R
150
TM4              
T
L
T
H
S
K
V
I
C
L
160
                   
T
V
W
F
V
S
I
I
I
S
170
                   
S
P
T
F
F
F
N
K
Q
Y
180
ECL2            
K
L
Q
G
R
D
V
C
E
P
190
              TM5
Q
Y
K
L
V
S
E
P
I
T
200
                   
W
K
L
L
G
M
G
L
E
L
210
                   
L
F
G
F
F
I
P
L
L
F
220
                   
M
V
F
C
Y
L
F
I
I
K
230
          ICL3 TM6
T
L
V
Q
A
Q
N
S
K
R
240
               
H
R
A
I
R
V
V
I
A
V
250
                   
V
L
V
F
L
A
C
Q
I
P
260
                   
H
N
M
V
L
L
V
T
A
A
270
          ECL3 TM7
N
T
G
K
M
G
R
S
C
S
280
               
A
E
K
A
L
A
Y
A
R
N
290
                   
V
A
E
V
L
A
F
L
H
C
300
                   
C
L
N
P
V
L
Y
A
F
I
310
H8                
G
Q
K
F
R
S
Y
F
M
K
320
                   
I
M
K
D
V
W
C
M
R
R
330
C-term        
K
S
K
V
P
T
F
F
C
A
340
                   
R
V
Y
S
E
S
Y
I
S
R
350
                   
Q
T
S
E
T
V
E
N
D
N
360
           
A
S
S
F
T
M

LINKS

DIAGRAMS

7TM

ICL1 K K A R ICL1ECL1 T W I F ECL1ICL2 A T K S F R V R S R ICL2ECL2 K Q Y K L Q G R D V C E P Q Y K L V S E ECL2ICL3 Q N ICL3ECL3 G R ECL3N-term M N F T E A N Y G M E D Y T G S D Y S M F P E T E P C S L N-termC-term C M R R K S K V P T F F C A R V Y S E S Y I S R Q T S E T V E N D N A S S F T M C-term Q E V R D F T K V F V P I A Y S L I C V F G L L G N I M V V I T F A F Y S M T D V Y L L N M A I T D I L F V L T L P F W A V T H A T D G N T M C K L M K G T Y A V N F N C G M L L L A C I S M D R Y I A I V Q T L T H S K V I C L T V W F V S I I I S S P T F F F N P I T W K L L G M G L E L L F G F F I P L L F M V F C Y L F I I K T L V Q A S K R H R A I R V V I A V V L V F L A C Q I P H N M V L L V T A A N T G K M S C S A E K A L A Y A R N V A E V L A F L H C C L N P V L Y A F I G Q K F M K V W F R S Y I M K D
Pick color:
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 




Invitro Mutant Data: Increased binding/potency: >5-fold, >10-fold; Reduced binding/potency: >5-fold, >10-fold; No/low effect (<5-fold); and N/A

I N G L L G F V C I L S Y A I P V F V K 1 L N M A I T D I L F V L T L P F W A V T 2 C A L L L M G C N F N V A Y T G K M L K 3 S K V I C L T V W F V S I I I S S P T 4 Y C F V M F L L P I F F G F L L E L G M G 5 I A V V L V F L A C Q I P H N M V L L V 6 V P N L C C H L F A L V E A V N R A Y 7
Pick color:
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 




Invitro Mutant Data: Increased binding/potency: >5-fold, >10-fold; Reduced binding/potency: >5-fold, >10-fold; No/low effect (<5-fold); and N/A

MUTATIONS

PHYSIOLOGICAL LIGANDS

No physiological ligands available

STRUCTURE MODELS

No structure models available. Check the Archive on Structure models for earlier releases.

STRUCTURES

No structures available