Rhodopsin (opsd_neosa)

FAMILY

Class A (Rhodopsin) Sensory receptors Opsins Rhodopsin

GENE

rho

ORGANISM

Spotfin squirrelfish (Neoniphon sammara)

ALT. NAMES

Rhodopsin

SOURCE

SWISSPROT

SEQUENCE

N-term        
M
N
G
T
E
G
P
Y
F
Y
10
                   
V
P
M
V
N
T
T
G
V
V
20
                   
R
S
P
Y
E
Y
P
Q
Y
Y
30
    TM1          
L
V
N
P
A
A
F
A
V
L
40
                   
G
A
Y
M
F
F
L
I
I
F
50
                   
G
F
P
I
N
F
L
T
L
Y
60
          ICL1  
V
T
L
E
H
K
K
L
R
T
70
TM2              
P
L
N
Y
I
L
L
N
L
A
80
                   
V
A
D
L
F
M
V
I
G
G
90
                   
F
T
T
T
M
Y
S
S
M
H
100
  ECL1 TM3    
G
Y
F
V
L
G
R
L
G
C
110
                   
N
L
E
G
F
S
A
T
L
G
120
                   
G
M
I
S
L
W
S
L
A
V
130
                   
L
A
I
E
R
W
V
V
V
C
140
  ICL2          
K
P
T
S
N
F
R
F
G
E
150
TM4              
N
H
A
I
M
G
V
S
L
T
160
                   
W
T
M
A
L
A
C
T
V
P
170
        ECL2    
P
L
V
G
W
S
R
Y
I
P
180
                   
E
G
M
Q
C
S
C
G
I
D
190
                   
Y
Y
T
R
A
E
G
F
N
N
200
TM5              
E
S
F
V
L
Y
M
F
F
C
210
                   
H
F
M
V
P
L
I
I
I
F
220
                   
F
C
Y
G
R
L
L
C
A
V
230
                   
K
E
A
A
A
A
Q
Q
E
S
240
TM6              
E
T
T
Q
R
A
E
R
E
V
250
                   
T
R
M
V
I
L
M
V
I
G
260
                   
Y
L
V
C
W
L
P
Y
A
S
270
                   
V
A
W
F
I
F
T
H
Q
G
280
ECL3 TM7      
S
E
F
G
P
L
F
M
T
I
290
                   
P
A
F
F
A
K
S
S
S
I
300
                   
Y
N
P
V
I
Y
I
C
M
N
310
H8                
K
Q
F
R
N
C
M
I
T
T
320
    C-term    
L
F
C
G
K
N
P
F
E
G
330
                   
E
E
E
G
A
S
S
T
K
T
340
                   
E
A
S
S
A
S
S
V
S
P
350
 
A

LINKS

UniProt

DIAGRAMS

ICL1 K K L R ICL1ECL1 Y F V L ECL1ICL2 P T S N F R F ICL2ECL2 W S R Y I P E G M Q C S C G I D Y Y T R A E G F ECL2ICL3 Q E S ICL3ECL3 Q G S E F ECL3N-term M N G T E G P Y F Y V P M V N T T G V V R S P Y E Y P Q Y Y L V N-termC-term C G K N P F E G E E E G A S S T K T E A S S A S S V S P A C-term N P A A F A V L G A Y M F F L I I F G F P I N F L T L Y V T L E H T P L N Y I L L N L A V A D L F M V I G G F T T T M Y S S M H G G R L G C N L E G F S A T L G G M I S L W S L A V L A I E R W V V V C K G E N H A I M G V S L T W T M A L A C T V P P L V G N N E S F V L Y M F F C H F M V P L I I I F F C Y G R L L C A V K E A A A A Q E T T Q R A E R E V T R M V I L M V I G Y L V C W L P Y A S V A W F I F T H G P L F M T I P A F F A K S S S I Y N P V I Y I C M N K Q M I T F R N C T L F
Pick color:
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 




Invitro Mutant Data: Increased binding/potency: >5-fold, >10-fold; Reduced binding/potency: >5-fold, >10-fold; No/low effect (<5-fold); and N/A

F N I P F G F I I L F F M Y A G L V A F 1 L N L A V A D L F M V G I G F T T T M Y S 2 V A L S W L S I M G G L T A S F G E L N 3 A I M G V S L T W T M A L A C T V P P L 4 Y C F F I I I L P V M F H C F F M Y L V F 5 I L M V I G Y L V C W L P Y A S V A W F 6 V P N Y I S S S K A F F A P I T M F L 7
Pick color:
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 




Invitro Mutant Data: Increased binding/potency: >5-fold, >10-fold; Reduced binding/potency: >5-fold, >10-fold; No/low effect (<5-fold); and N/A

MUTATIONS

0 mutation data points available.

ENDOGENOUS LIGANDS

No endogenous ligands available

STRUCTURE MODELS

No structure models available. Check the Archive on Structure models for earlier releases.

STRUCTURES

No structures available