Rhodopsin (opsd_todpa)
FAMILY
Class A (Rhodopsin) Sensory receptors Opsins Rhodopsin
GENE
RHO
ORGANISM
Japanese flying squid (Todarodes pacificus)
ALT. NAMES
Rhodopsin
SOURCE
SWISSPROT
SEQUENCE
| N-term | |||||||||
|
M
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G
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R
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D
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L
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R
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D
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N
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E
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| 10 | |||||||||
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W
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N
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P
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S
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I
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V
|
V
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H
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| 20 | |||||||||
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P
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H
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W
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R
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E
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F
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D
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Q
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V
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P
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| 30 | |||||||||
| TM1 | |||||||||
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Y
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G
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I
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| 40 | |||||||||
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I
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G
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I
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C
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G
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I
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I
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G
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C
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| 50 | |||||||||
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N
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G
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I
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V
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I
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L
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T
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| 60 | |||||||||
| ICL1 | TM2 | ||||||||
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K
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K
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T
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P
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| 70 | |||||||||
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I
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I
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N
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| 80 | |||||||||
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F
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T
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F
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L
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V
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N
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G
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F
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P
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| 90 | |||||||||
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L
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M
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T
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I
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S
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C
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L
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K
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K
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| 100 | |||||||||
| ECL1 | TM3 | ||||||||
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W
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I
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G
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A
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K
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G
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G
|
G
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I
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F
|
G
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F
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| 120 | |||||||||
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M
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S
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I
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M
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T
|
M
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A
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M
|
I
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S
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| 130 | |||||||||
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I
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D
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N
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I
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G
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R
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| 140 | |||||||||
| ICL2 | TM4 | ||||||||
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M
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A
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A
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K
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K
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M
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S
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| 150 | |||||||||
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R
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A
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F
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I
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M
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I
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I
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F
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V
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W
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| 160 | |||||||||
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L
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W
|
S
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V
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L
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W
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A
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I
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G
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P
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| 170 | |||||||||
| ECL2 | |||||||||
|
I
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F
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G
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W
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G
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A
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Y
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T
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L
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E
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| 180 | |||||||||
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G
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V
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L
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C
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N
|
C
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S
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F
|
D
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Y
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| 190 | |||||||||
| TM5 | |||||||||
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I
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S
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R
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D
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S
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T
|
T
|
R
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S
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N
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| 200 | |||||||||
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I
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L
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C
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M
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I
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G
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|
F
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| 210 | |||||||||
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G
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P
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I
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L
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I
|
I
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F
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F
|
C
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Y
|
| 220 | |||||||||
|
F
|
N
|
I
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V
|
M
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S
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V
|
S
|
N
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H
|
| 230 | |||||||||
|
E
|
K
|
E
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M
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A
|
A
|
M
|
A
|
K
|
R
|
| 240 | |||||||||
| ICL3 | TM6 | ||||||||
|
L
|
N
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A
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K
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E
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L
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R
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K
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A
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Q
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| 250 | |||||||||
|
A
|
G
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A
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N
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A
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M
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R
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L
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| 260 | |||||||||
|
K
|
I
|
S
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I
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V
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I
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V
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S
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Q
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F
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| 270 | |||||||||
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L
|
L
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S
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W
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S
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P
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Y
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A
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V
|
V
|
| 280 | |||||||||
|
A
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L
|
L
|
A
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Q
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F
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G
|
P
|
L
|
E
|
| 290 | |||||||||
| ECL3 | TM7 | ||||||||
|
W
|
V
|
T
|
P
|
Y
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A
|
A
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Q
|
L
|
P
|
| 300 | |||||||||
|
V
|
M
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F
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A
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K
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A
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S
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A
|
I
|
H
|
| 310 | |||||||||
| H8 | |||||||||
|
N
|
P
|
M
|
I
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Y
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S
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V
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S
|
H
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P
|
| 320 | |||||||||
|
K
|
F
|
R
|
E
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A
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I
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S
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Q
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T
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F
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| 330 | |||||||||
| C-term | |||||||||
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P
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W
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V
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L
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T
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C
|
C
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Q
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| 340 | |||||||||
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D
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T
|
E
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D
|
D
|
K
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D
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A
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| 350 | |||||||||
|
E
|
T
|
E
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I
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P
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A
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G
|
E
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S
|
S
|
| 360 | |||||||||
|
D
|
A
|
A
|
P
|
S
|
A
|
D
|
A
|
A
|
Q
|
| 370 | |||||||||
|
M
|
K
|
E
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M
|
M
|
A
|
M
|
M
|
Q
|
K
|
| 380 | |||||||||
|
M
|
Q
|
Q
|
Q
|
Q
|
A
|
A
|
Y
|
P
|
P
|
| 390 | |||||||||
|
Q
|
G
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Y
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A
|
P
|
P
|
P
|
Q
|
G
|
Y
|
| 400 | |||||||||
|
P
|
P
|
Q
|
G
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Y
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P
|
P
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Q
|
G
|
Y
|
| 410 | |||||||||
|
P
|
P
|
Q
|
G
|
Y
|
P
|
P
|
Q
|
G
|
Y
|
| 420 | |||||||||
|
P
|
P
|
P
|
P
|
Q
|
G
|
A
|
P
|
P
|
Q
|
| 430 | |||||||||
|
G
|
A
|
P
|
P
|
A
|
A
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P
|
P
|
Q
|
G
|
| 440 | |||||||||
|
V
|
D
|
N
|
Q
|
A
|
Y
|
Q
|
A
|
LINKS
DIAGRAMS
7TM
Pick color:
Invitro Mutant Data: Increased binding/potency: >5-fold, >10-fold; Reduced binding/potency: >5-fold, >10-fold; No/low effect (<5-fold); and N/A
, 'snake_opsd_todpa.png',
{scale: 3});){kind=link}
, 'snake_opsd_todpa.jpg',
{scale: 3});){kind=link}
Pick color:
Invitro Mutant Data: Increased binding/potency: >5-fold, >10-fold; Reduced binding/potency: >5-fold, >10-fold; No/low effect (<5-fold); and N/A
, 'helixbox_opsd_todpa.png',
{scale: 3});){kind=link}
, 'helixbox_opsd_todpa.jpg',
{scale: 3});){kind=link}
MUTATIONS
PHYSIOLOGICAL LIGANDS
No physiological ligands available
STRUCTURE MODELS
No structure models have been generated as experimental structures are available (see below).