4O9R refined

PROTEIN CLASS

Class F (Frizzled)

RECEPTOR

SMO

SPECIES

Homo sapiens

STATE

Inactive

VERSION

2021-04-08

MODEL

PDB file contains GPCRdb generic numbers in the B-factor field of CA atoms

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MAIN TEMPLATE

SMO (sequence similarity: 100%) PDB: 4O9R

TEMPLATES

4O9R (SMO)
4N4W (SMO)
6XBM (SMO)
4QIM (SMO)
6O3C (SMO)
None
Main template (%) Additional templates (%) No template - freely modelled (%)
Backbone 86.4 9.0 4.6
Side-chains 83.7 11.2 5.2

Number of backbone templates: 5
Number of rotamer templates: 9

Segment Seq.num. AA GPCRdb# Backbone PDB Rotamer PDB
N-term 192 Q - SMO 4O9R SMO 4O9R
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TM6 484 F 6.65x65 SMO 4O9R SMO 4O9R
TM6 485 R 6.66x66 SMO 4O9R SMO 4N4W
TM6 486 D 6.67x67 SMO 4O9R SMO 4O9R
TM6 487 Y 6.68x68 SMO 4O9R SMO 4O9R
TM6 488 V 6.69x69 SMO 4O9R SMO 4O9R
TM6 489 L 6.70x70 SMO 4O9R SMO 4O9R
TM6 490 C 6.71x71 SMO 4O9R SMO 4O9R
TM6 491 Q 6.72x72 SMO 4O9R SMO 4N4W
TM6 492 A 6.73x73 SMO 4O9R SMO 4O9R
TM6 493 N 6.74x74 SMO 4O9R SMO 4O9R
TM6 494 V 6.75x75 SMO 6XBM SMO 6XBM
TM6 495 T 6.76x76 SMO 6XBM SMO 6XBM
TM6 496 I 6.77x77 SMO 6XBM SMO 6XBM
ECL3 497 G - - - - -
ECL3 498 L - - - - -
ECL3 499 P - - - - -
ECL3 500 T - - - - -
ECL3 501 K - - - - -
ECL3 502 Q - - - - -
ECL3 503 P - - - - -
ECL3 504 I - - - - -
ECL3 505 P - SMO 4O9R SMO 4O9R
ECL3 506 D - SMO 4O9R SMO 4O9R
ECL3 507 C - SMO 4O9R SMO 4O9R
ECL3 508 E - SMO 4O9R SMO 4O9R
ECL3 509 I - SMO 4O9R SMO 4O9R
ECL3 510 K - SMO 4O9R - -
ECL3 511 N - SMO 4O9R SMO 4O9R
ECL3 512 R - SMO 4O9R SMO 4O9R
ECL3 513 P - SMO 4O9R SMO 4O9R
TM7 514 S 7.34x34 SMO 4O9R SMO 4O9R
TM7 515 L 7.35x35 SMO 4O9R SMO 4O9R
TM7 516 L 7.36x36 SMO 4O9R SMO 4O9R
TM7 517 V 7.37x37 SMO 4O9R SMO 4O9R
TM7 518 E 7.38x38 SMO 4O9R SMO 4O9R
TM7 519 K 7.39x39 SMO 4O9R SMO 4O9R
TM7 520 I 7.40x40 SMO 4O9R SMO 4O9R
TM7 521 N 7.41x41 SMO 4O9R SMO 4O9R
TM7 522 L 7.42x42 SMO 4O9R SMO 4O9R
TM7 523 F 7.43x43 SMO 4O9R SMO 4O9R
TM7 524 A 7.44x44 SMO 4O9R SMO 4O9R
TM7 525 M 7.45x45 SMO 4O9R SMO 4O9R
TM7 526 F 7.46x46 SMO 4O9R SMO 4O9R
TM7 527 G 7.47x47 SMO 4O9R SMO 4O9R
TM7 528 T 7.48x48 SMO 4O9R SMO 4O9R
TM7 529 G 7.49x49 SMO 4O9R SMO 4O9R
TM7 530 I 7.50x50 SMO 4O9R SMO 4O9R
TM7 531 A 7.51x51 SMO 4O9R SMO 4O9R
TM7 532 M 7.52x52 SMO 4O9R SMO 4O9R
TM7 533 S 7.53x53 SMO 4O9R SMO 4O9R
TM7 534 T 7.54x54 SMO 4O9R SMO 4O9R
TM7 535 W 7.55x55 SMO 4O9R SMO 4O9R
TM7 536 V 7.56x56 SMO 4O9R SMO 4O9R
TM7 537 W 7.57x57 SMO 4O9R SMO 4O9R
H8 538 T 8.47x47 SMO 4O9R SMO 4O9R
H8 539 K 8.48x48 SMO 4O9R SMO 5V56
H8 540 A 8.49x49 SMO 4O9R SMO 4O9R
H8 541 T 8.50x50 SMO 4O9R SMO 4O9R
H8 542 L 8.51x51 SMO 4O9R SMO 4O9R
H8 543 L 8.52x52 SMO 4O9R SMO 4O9R
H8 544 I 8.53x53 SMO 4O9R SMO 4O9R
H8 545 W 8.54x54 SMO 4O9R SMO 4O9R
H8 546 R 8.55x55 SMO 4O9R SMO 5V56
H8 547 R 8.56x56 SMO 4O9R SMO 5V57
H8 548 T 8.57x57 SMO 4O9R SMO 4O9R
H8 549 W 8.58x58 SMO 4O9R SMO 4N4W
H8 550 C 8.59x59 SMO 4QIM SMO 4QIM
H8 551 R 8.60x60 SMO 4QIM SMO 4QIM
H8 552 L 8.61x61 SMO 4QIM SMO 5V57
H8 553 T 8.62x62 SMO 4QIM SMO 5V57
C-term 554 G - - - - -
C-term 555 Q - - - - -
C-term 556 S - - - - -
C-term 557 D - - - - -
C-term 558 D - - - - -