ADGRV1 homology model

PROTEIN CLASS

Class B2 (Adhesion)

RECEPTOR

SPECIES

Homo sapiens

STATE

Active

VERSION

2020-09-02

MODEL

PDB file contains GPCRdb generic numbers in the B-factor field of CA atoms

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MAIN TEMPLATE

CRF1 receptor (sequence similarity: 30%) PDB: 6P9X

TEMPLATES

5UZ7 (CT receptor)
6P9X (CRF1 receptor)
4Z9G (CRF1 receptor)
4K5Y (CRF1 receptor)
6PB0 (CRF1 receptor)
6WI9 (secretin receptor)
None
Main template (%) Additional templates (%) No template - freely modelled (%)
Backbone 74.7 7.3 18.1
Side-chains 11.5 19.8 68.8

Number of backbone templates: 6
Number of rotamer templates: 12

Segment Seq.num. AA GPCRdb# Backbone PDB Rotamer PDB
N-term 5890 M - - - -
N-term 5891 S - - - -
N-term 5892 V - - - -
N-term 5893 Y - - - -
N-term 5894 A - - - -
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C-term 6173 G - - - -
C-term 6174 H - - - -
C-term 6175 P - - - -
C-term 6176 G - - - -
C-term 6177 P - - - -