5WB2 refined

PROTEIN CLASS

Class A (Rhodopsin)

RECEPTOR

SPECIES

Human cytomegalovirus

STATE

Active

VERSION

2021-10-06

MODEL

PDB file contains GPCRdb generic numbers in the B-factor field of CA atoms

NGL is a WebGL based 3D viewer powered by MMTF.

MAIN TEMPLATE

US28 (sequence similarity: 100%) PDB: 5WB2

TEMPLATES

5WB2 (US28)
5WB1 (US28)
4XT1 (US28)
6WWZ (CCR6)
None
Main template (%) Additional templates (%) No template - freely modelled (%)
Backbone 95.7 2.0 2.3
Side-chains 93.3 2.0 4.7

Number of backbone templates: 4
Number of rotamer templates: 5

Segment Seq.num. AA GPCRdb# Backbone PDB Rotamer PDB
N-term 17 D - US28 5WB2 US28 5WB2
N-term 18 E - US28 5WB2 US28 5WB2
N-term 19 D - US28 5WB2 US28 5WB2
N-term 20 A - US28 5WB2 US28 5WB2
N-term 21 T - US28 5WB2 US28 5WB2
N-term 22 P - US28 5WB2 US28 5WB2
N-term 23 C - US28 5WB2 US28 5WB2
N-term 24 V - US28 5WB2 US28 5WB2
TM1 25 F 1.24x24 US28 5WB2 US28 5WB2
TM1 26 T 1.25x25 US28 5WB2 US28 5WB2
TM1 27 D 1.26x26 US28 5WB2 US28 5WB2
TM1 28 V 1.27x27 US28 5WB2 US28 5WB2
TM1 29 L 1.28x28 US28 5WB2 US28 5WB2
TM1 30 N 1.29x29 US28 5WB2 US28 5WB2
TM1 31 Q 1.30x30 US28 5WB2 US28 5WB2
TM1 32 S 1.31x31 US28 5WB2 US28 5WB2
TM1 33 K 1.32x32 US28 5WB2 US28 5WB2
TM1 34 P 1.33x33 US28 5WB2 US28 5WB2
TM1 35 V 1.34x34 US28 5WB2 US28 5WB2
TM1 36 T 1.35x35 US28 5WB2 US28 5WB2
TM1 37 L 1.36x36 US28 5WB2 US28 5WB2
TM1 38 F 1.37x37 US28 5WB2 US28 5WB2
TM1 39 L 1.38x38 US28 5WB2 US28 5WB2
TM1 40 Y 1.39x39 US28 5WB2 US28 5WB2
TM1 41 G 1.40x40 US28 5WB2 US28 5WB2
TM1 42 V 1.41x41 US28 5WB2 US28 5WB2
TM1 43 V 1.42x42 US28 5WB2 US28 5WB2
TM1 44 F 1.43x43 US28 5WB2 US28 5WB2
TM1 45 L 1.44x44 US28 5WB2 US28 5WB2
TM1 46 F 1.45x45 US28 5WB2 US28 5WB2
TM1 47 G 1.46x46 US28 5WB2 US28 5WB2
TM1 48 S 1.47x47 US28 5WB2 US28 5WB2
TM1 49 I 1.48x48 US28 5WB2 US28 5WB2
TM1 50 G 1.49x49 US28 5WB2 US28 5WB2
TM1 51 N 1.50x50 US28 5WB2 US28 5WB2
TM1 52 F 1.51x51 US28 5WB2 US28 5WB2
TM1 53 L 1.52x52 US28 5WB2 US28 5WB2
TM1 54 V 1.53x53 US28 5WB2 US28 5WB2
TM1 55 I 1.54x54 US28 5WB2 US28 5WB2
TM1 56 F 1.55x55 US28 5WB2 US28 5WB2
TM1 57 T 1.56x56 US28 5WB2 US28 5WB2
TM1 58 I 1.57x57 US28 5WB2 US28 5WB2
TM1 59 T 1.58x58 US28 5WB2 US28 5WB2
TM1 60 W 1.59x59 US28 5WB2 US28 5WB2
TM1 61 R 1.60x60 US28 4XT1 US28 4XT1
ICL1 62 R 12.48x48 - - - -
ICL1 63 R 12.49x49 CCR6 6WWZ apelin receptor 5VBL
ICL1 64 I 12.50x50 CCR6 6WWZ - -
ICL1 65 Q 12.51x51 - - - -
TM2 66 C 2.37x37 US28 5WB2 US28 5WB2
TM2 67 S 2.38x38 US28 5WB2 US28 5WB2
TM2 68 G 2.39x39 US28 5WB2 US28 5WB2
TM2 69 D 2.40x40 US28 5WB2 US28 5WB2
TM2 70 V 2.41x41 US28 5WB2 US28 5WB2
TM2 71 Y 2.42x42 US28 5WB2 US28 5WB2
TM2 72 F 2.43x43 US28 5WB2 US28 5WB2
TM2 73 I 2.44x44 US28 5WB2 US28 5WB2
TM2 74 N 2.45x45 US28 5WB2 US28 5WB2
TM2 75 L 2.46x46 US28 5WB2 US28 5WB2
TM2 76 A 2.47x47 US28 5WB2 US28 5WB2
TM2 77 A 2.48x48 US28 5WB2 US28 5WB2
TM2 78 A 2.49x49 US28 5WB2 US28 5WB2
TM2 79 D 2.50x50 US28 5WB2 US28 5WB2
TM2 80 L 2.51x51 US28 5WB2 US28 5WB2
TM2 81 L 2.52x52 US28 5WB2 US28 5WB2
TM2 82 F 2.53x53 US28 5WB2 US28 5WB2
TM2 83 V 2.54x54 US28 5WB2 US28 5WB2
TM2 84 C 2.55x55 US28 5WB2 US28 5WB2
TM2 85 T 2.56x56 US28 5WB2 US28 5WB2
TM2 86 L 2.57x57 US28 5WB2 US28 5WB2
TM2 87 P 2.58x58 US28 5WB2 US28 5WB2
TM2 88 L 2.59x59 US28 5WB2 US28 5WB2
TM2 89 W 2.60x60 US28 5WB2 US28 5WB2
TM2 90 M 2.61x61 US28 5WB2 US28 5WB2
TM2 91 Q 2.62x62 US28 5WB2 - -
TM2 92 Y 2.63x63 US28 5WB2 US28 5WB2
TM2 93 L 2.64x64 US28 5WB2 US28 5WB2
TM2 94 L 2.65x65 US28 5WB2 US28 5WB2
TM2 95 D 2.66x66 US28 5WB2 US28 5WB2
ECL1 96 H - US28 5WB2 US28 5WB2
ECL1 97 N - US28 5WB2 US28 5WB2
ECL1 98 S - US28 5WB2 US28 5WB2
ECL1 99 L - US28 5WB2 US28 5WB2
TM3 100 A 3.21x21 US28 5WB2 US28 5WB2
TM3 101 S 3.22x22 US28 5WB2 US28 5WB2
TM3 102 V 3.23x23 US28 5WB2 US28 5WB2
TM3 103 P 3.24x24 US28 5WB2 US28 5WB2
TM3 104 C 3.25x25 US28 5WB2 US28 5WB2
TM3 105 T 3.26x26 US28 5WB2 US28 5WB2
TM3 106 L 3.27x27 US28 5WB2 US28 5WB2
TM3 107 L 3.28x28 US28 5WB2 US28 5WB2
TM3 108 T 3.29x29 US28 5WB2 US28 5WB2
TM3 109 A 3.30x30 US28 5WB2 US28 5WB2
TM3 110 C 3.31x31 US28 5WB2 US28 5WB2
TM3 111 F 3.32x32 US28 5WB2 US28 5WB2
TM3 112 Y 3.33x33 US28 5WB2 US28 5WB2
TM3 113 V 3.34x34 US28 5WB2 US28 5WB2
TM3 114 A 3.35x35 US28 5WB2 US28 5WB2
TM3 115 M 3.36x36 US28 5WB2 US28 5WB2
TM3 116 F 3.37x37 US28 5WB2 US28 5WB2
TM3 117 A 3.38x38 US28 5WB2 US28 5WB2
TM3 118 S 3.39x39 US28 5WB2 US28 5WB2
TM3 119 L 3.40x40 US28 5WB2 US28 5WB2
TM3 120 C 3.41x41 US28 5WB2 US28 5WB2
TM3 121 F 3.42x42 US28 5WB2 US28 5WB2
TM3 122 I 3.43x43 US28 5WB2 US28 5WB2
TM3 123 T 3.44x44 US28 5WB2 US28 5WB2
TM3 124 E 3.45x45 US28 5WB2 US28 5WB2
TM3 125 I 3.46x46 US28 5WB2 US28 5WB2
TM3 126 A 3.47x47 US28 5WB2 US28 5WB2
TM3 127 L 3.48x48 US28 5WB2 US28 5WB2
TM3 128 D 3.49x49 US28 5WB2 US28 5WB2
TM3 129 R 3.50x50 US28 5WB2 US28 5WB2
TM3 130 Y 3.51x51 US28 5WB2 US28 5WB2
TM3 131 Y 3.52x52 US28 5WB2 US28 5WB2
TM3 132 A 3.53x53 US28 5WB2 US28 5WB2
TM3 133 I 3.54x54 US28 5WB2 US28 5WB2
TM3 134 V 3.55x55 US28 5WB2 US28 5WB2
ICL2 135 Y - US28 5WB2 US28 5WB2
ICL2 136 M - US28 5WB2 US28 5WB2
ICL2 137 R - US28 5WB2 - -
ICL2 138 Y - US28 5WB2 US28 5WB2
ICL2 139 R - US28 5WB2 US28 5WB2
TM4 140 P 4.38x38 US28 5WB2 US28 5WB2
TM4 141 V 4.39x39 US28 5WB2 US28 5WB2
TM4 142 K 4.40x40 US28 5WB2 US28 4XT1
TM4 143 Q 4.41x41 US28 5WB2 US28 5WB2
TM4 144 A 4.42x42 US28 5WB2 US28 5WB2
TM4 145 C 4.43x43 US28 5WB2 US28 5WB2
TM4 146 L 4.44x44 US28 5WB2 US28 5WB2
TM4 147 F 4.45x45 US28 5WB2 US28 5WB2
TM4 148 S 4.46x46 US28 5WB2 US28 5WB2
TM4 149 I 4.47x47 US28 5WB2 US28 5WB2
TM4 150 F 4.48x48 US28 5WB2 US28 5WB2
TM4 151 W 4.49x49 US28 5WB2 US28 5WB2
TM4 152 W 4.50x50 US28 5WB2 US28 5WB2
TM4 153 I 4.51x51 US28 5WB2 US28 5WB2
TM4 154 F 4.52x52 US28 5WB2 US28 5WB2
TM4 155 A 4.53x53 US28 5WB2 US28 5WB2
TM4 156 V 4.54x54 US28 5WB2 US28 5WB2
TM4 157 I 4.55x55 US28 5WB2 US28 5WB2
TM4 158 I 4.56x56 US28 5WB2 US28 5WB2
TM4 159 A 4.57x57 US28 5WB2 US28 5WB2
TM4 160 I 4.58x59 US28 5WB2 US28 5WB2
TM4 161 P 4.59x60 US28 5WB2 US28 5WB2
TM4 162 H 4.60x61 US28 5WB2 US28 5WB2
TM4 163 F 4.61x62 US28 5WB2 US28 5WB2
TM4 164 M 4.62x63 US28 5WB2 US28 5WB2
ECL2 165 V - US28 5WB2 US28 5WB2
ECL2 166 V - US28 5WB2 US28 5WB2
ECL2 167 T - US28 5WB2 US28 5WB2
ECL2 168 K - US28 5WB2 - -
ECL2 169 K - US28 5WB2 - -
ECL2 170 D - US28 5WB2 US28 5WB2
ECL2 171 N - US28 5WB2 US28 5WB2
ECL2 172 Q - US28 5WB2 - -
ECL2 173 C 45.50x50 US28 5WB2 US28 5WB2
ECL2 174 M 45.51x51 US28 5WB2 US28 5WB2
ECL2 175 T 45.52x52 US28 5WB2 US28 5WB2
ECL2 176 D - US28 5WB2 US28 5WB2
ECL2 177 Y - US28 5WB2 US28 5WB2
ECL2 178 D - US28 5WB2 US28 5WB2
ECL2 179 Y - US28 5WB2 US28 5WB2
ECL2 180 L - US28 5WB2 US28 5WB2
ECL2 181 E - US28 5WB2 US28 5WB2
ECL2 182 V - US28 5WB2 US28 5WB2
TM5 183 S 5.33x34 US28 5WB2 US28 5WB2
TM5 184 Y 5.34x35 US28 5WB2 US28 5WB2
TM5 185 P 5.35x36 US28 5WB2 US28 5WB2
TM5 186 I 5.36x37 US28 5WB2 US28 5WB2
TM5 187 I 5.37x38 US28 5WB2 US28 5WB2
TM5 188 L 5.38x39 US28 5WB2 US28 5WB2
TM5 189 N 5.39x40 US28 5WB2 US28 5WB2
TM5 190 V 5.40x41 US28 5WB2 US28 5WB2
TM5 191 E 5.41x42 US28 5WB2 US28 5WB2
TM5 192 L 5.42x43 US28 5WB2 US28 5WB2
TM5 193 M 5.43x44 US28 5WB2 US28 5WB2
TM5 194 L 5.44x45 US28 5WB2 US28 5WB2
TM5 195 G 5.45x46 US28 5WB2 US28 5WB2
TM5 196 A 5.46x461 US28 5WB2 US28 5WB2
TM5 197 F 5.47x47 US28 5WB2 US28 5WB2
TM5 198 V 5.48x48 US28 5WB2 US28 5WB2
TM5 199 I 5.49x49 US28 5WB2 US28 5WB2
TM5 200 P 5.50x50 US28 5WB2 US28 5WB2
TM5 201 L 5.51x51 US28 5WB2 US28 5WB2
TM5 202 S 5.52x52 US28 5WB2 US28 5WB2
TM5 203 V 5.53x53 US28 5WB2 US28 5WB2
TM5 204 I 5.54x54 US28 5WB2 US28 5WB2
TM5 205 S 5.55x55 US28 5WB2 US28 5WB2
TM5 206 Y 5.56x56 US28 5WB2 US28 5WB2
TM5 207 C 5.57x57 US28 5WB2 US28 5WB2
TM5 208 Y 5.58x58 US28 5WB2 US28 5WB2
TM5 209 Y 5.59x59 US28 5WB2 US28 5WB2
TM5 210 R 5.60x60 US28 5WB2 US28 5WB2
TM5 211 I 5.61x61 US28 5WB2 US28 5WB2
TM5 212 S 5.62x62 US28 5WB2 US28 5WB2
TM5 213 R 5.63x63 US28 5WB2 US28 5WB2
TM5 214 I 5.64x64 US28 5WB2 US28 5WB2
TM5 215 V 5.65x65 US28 5WB2 US28 5WB2
TM5 216 A 5.66x66 US28 5WB2 US28 5WB2
TM5 217 V 5.67x67 US28 5WB2 US28 5WB2
TM5 218 S 5.68x68 US28 5WB2 US28 5WB2
ICL3 219 Q - US28 5WB2 US28 5WB2
ICL3 220 S - US28 5WB2 US28 5WB2
ICL3 221 R - US28 5WB2 US28 5WB2
TM6 222 H 6.29x29 US28 5WB2 US28 5WB2
TM6 223 K 6.30x30 US28 5WB2 US28 5WB2
TM6 224 G 6.31x31 US28 5WB2 US28 5WB2
TM6 225 R 6.32x32 US28 5WB2 US28 5WB2
TM6 226 I 6.33x33 US28 5WB2 US28 5WB2
TM6 227 V 6.34x34 US28 5WB2 US28 5WB2
TM6 228 R 6.35x35 US28 5WB2 US28 5WB2
TM6 229 V 6.36x36 US28 5WB2 US28 5WB2
TM6 230 L 6.37x37 US28 5WB2 US28 5WB2
TM6 231 I 6.38x38 US28 5WB2 US28 5WB2
TM6 232 A 6.39x39 US28 5WB2 US28 5WB2
TM6 233 V 6.40x40 US28 5WB2 US28 5WB2
TM6 234 V 6.41x41 US28 5WB2 US28 5WB2
TM6 235 L 6.42x42 US28 5WB2 US28 5WB2
TM6 236 V 6.43x43 US28 5WB2 US28 5WB2
TM6 237 F 6.44x44 US28 5WB2 US28 5WB2
TM6 238 I 6.45x45 US28 5WB2 US28 5WB2
TM6 239 I 6.46x46 US28 5WB2 US28 5WB2
TM6 240 F 6.47x47 US28 5WB2 US28 5WB2
TM6 241 W 6.48x48 US28 5WB2 US28 5WB2
TM6 242 L 6.49x49 US28 5WB2 US28 5WB2
TM6 243 P 6.50x50 US28 5WB2 US28 5WB2
TM6 244 Y 6.51x51 US28 5WB2 US28 5WB2
TM6 245 H 6.52x52 US28 5WB2 US28 5WB2
TM6 246 L 6.53x53 US28 5WB2 US28 5WB2
TM6 247 T 6.54x54 US28 5WB2 US28 5WB2
TM6 248 L 6.55x55 US28 5WB2 US28 5WB2
TM6 249 F 6.56x56 US28 5WB2 US28 5WB2
TM6 250 V 6.57x57 US28 5WB2 US28 5WB2
TM6 251 D 6.58x58 US28 5WB2 US28 5WB2
TM6 252 T 6.59x59 US28 5WB2 US28 5WB2
TM6 253 L 6.60x60 US28 5WB2 US28 5WB2
TM6 254 K 6.61x61 US28 5WB2 US28 5WB2
TM6 255 L 6.62x62 US28 5WB2 US28 5WB2
TM6 256 L 6.63x63 US28 5WB2 US28 5WB2
TM6 257 K 6.64x64 US28 5WB2 US28 5WB2
ECL3 258 W - US28 5WB2 US28 5WB2
ECL3 259 I - US28 5WB2 US28 5WB2
ECL3 260 S - US28 5WB2 US28 5WB2
ECL3 261 S - US28 5WB2 US28 5WB2
TM7 262 S 7.24x23 US28 5WB2 US28 5WB2
TM7 263 C 7.25x24 US28 5WB2 US28 5WB2
TM7 264 E 7.26x25 US28 5WB2 US28 5WB2
TM7 265 F 7.27x26 US28 5WB2 US28 5WB2
TM7 266 E 7.28x27 US28 5WB2 US28 5WB2
TM7 267 R 7.29x28 US28 5WB2 US28 5WB2
TM7 268 S 7.30x29 US28 5WB2 US28 5WB2
TM7 269 L 7.31x30 US28 5WB2 US28 5WB2
TM7 270 K 7.32x31 US28 5WB2 US28 5WB2
TM7 271 R 7.33x32 US28 5WB2 US28 5WB2
TM7 272 A 7.34x33 US28 5WB2 US28 5WB2
TM7 273 L 7.35x34 US28 5WB2 US28 5WB2
TM7 274 I 7.36x35 US28 5WB2 US28 5WB2
TM7 275 L 7.37x36 US28 5WB2 US28 5WB2
TM7 276 T 7.38x37 US28 5WB2 US28 5WB2
TM7 277 E 7.39x38 US28 5WB2 US28 5WB2
TM7 278 S 7.40x39 US28 5WB2 US28 5WB2
TM7 279 L 7.41x40 US28 5WB2 US28 5WB2
TM7 280 A 7.42x41 US28 5WB2 US28 5WB2
TM7 281 F 7.43x42 US28 5WB2 US28 5WB2
TM7 282 C 7.44x43 US28 5WB2 US28 5WB2
TM7 283 H 7.45x45 US28 5WB2 US28 5WB2
TM7 284 C 7.46x46 US28 5WB2 US28 5WB2
TM7 285 C 7.47x47 US28 5WB2 US28 5WB2
TM7 286 L 7.48x48 US28 5WB2 US28 5WB2
TM7 287 N 7.49x49 US28 5WB2 US28 5WB2
TM7 288 P 7.50x50 US28 5WB2 US28 5WB2
TM7 289 L 7.51x51 US28 5WB2 US28 5WB2
TM7 290 L 7.52x52 US28 5WB2 US28 5WB2
TM7 291 Y 7.53x53 US28 5WB2 US28 5WB2
TM7 292 V 7.54x54 US28 5WB2 US28 5WB2
TM7 293 F 7.55x55 US28 5WB2 US28 5WB2
TM7 294 V 7.56x56 US28 5WB2 US28 5WB2
H8 295 G 8.47x47 US28 5WB2 US28 5WB2
H8 296 T 8.48x48 US28 5WB2 US28 5WB2
H8 297 K 8.49x49 US28 5WB2 CCR6 6WWZ
H8 298 F 8.50x50 US28 5WB2 US28 5WB2
H8 299 R 8.51x51 US28 5WB2 US28 5WB2
H8 300 Q 8.52x52 US28 5WB2 US28 5WB2
H8 301 E 8.53x53 US28 5WB2 US28 5WB2
H8 302 L 8.54x54 US28 5WB2 US28 5WB2
H8 303 H 8.55x55 US28 5WB2 US28 5WB2
H8 304 C 8.56x56 US28 5WB2 US28 5WB2
H8 305 L 8.57x57 US28 5WB2 US28 5WB2
H8 306 L 8.58x58 US28 5WB2 US28 5WB2
H8 307 A 8.59x59 US28 5WB2 US28 5WB2
H8 308 E 8.60x60 US28 5WB1 US28 5WB1
H8 309 F 8.61x61 US28 5WB1 US28 5WB1
H8 310 R 8.62x62 US28 5WB1 - -
C-term 311 Q - - - - -
C-term 312 R - - - - -
C-term 313 L - - - - -
C-term 314 F - - - - -
C-term 315 S - - - - -