6D26 refined

PROTEIN CLASS

Class A (Rhodopsin)

RECEPTOR

SPECIES

Homo sapiens

STATE

Inactive

VERSION

2021-09-08

MODEL

PDB file contains GPCRdb generic numbers in the B-factor field of CA atoms

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MAIN TEMPLATE

DP2 receptor (sequence similarity: 100%) PDB: 6D26

TEMPLATES

6D26 (DP2 receptor)
6OMM (FPR2/ALX)
5UNG (AT2 receptor)
None
Main template (%) Additional templates (%) No template - freely modelled (%)
Backbone 94.8 1.5 3.7
Side-chains 94.5 1.5 4.0

Number of backbone templates: 3
Number of rotamer templates: 6

Segment Seq.num. AA GPCRdb# Backbone PDB Rotamer PDB
N-term 5 A - DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
N-term 6 T - DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
N-term 7 L - DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
N-term 8 K - DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
N-term 9 P - DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
N-term 10 L - DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
N-term 11 C - DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
N-term 12 P - DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
N-term 13 I - DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
N-term 14 L - DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
N-term 15 E - DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
N-term 16 Q - DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
N-term 17 M - DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
N-term 18 S - DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
N-term 19 R - DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
N-term 20 L - DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
N-term 21 Q - DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
N-term 22 S - DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
N-term 23 H - DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
N-term 24 S - DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
N-term 25 N - DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
N-term 26 T - DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
N-term 27 S - DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
N-term 28 I - DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
N-term 29 R - DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
N-term 30 Y - DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
N-term 31 I - DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
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TM1 57 V 1.57x57 DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
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TM2 65 V 2.38x38 DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
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TM2 67 T 2.40x40 DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
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TM2 69 W 2.42x42 DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
TM2 70 V 2.43x43 DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
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ECL1 98 E 23.51x51 DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
ECL1 99 L 23.52x52 DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
TM3 100 G 3.21x21 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
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TM3 106 L 3.27x27 DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
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ECL2 173 I - DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
ECL2 174 S - DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
ECL2 175 R - DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
ECL2 176 L - DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
ECL2 177 D - DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
ECL2 178 G - DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
ECL2 179 R - DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
ECL2 180 I - DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
ECL2 181 M - DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
ECL2 182 C 45.50x50 DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
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ECL2 187 L - DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
ECL2 188 L - DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
ECL2 189 L - DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
ECL2 190 N - DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
ECL2 191 P - DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
ECL2 192 G - DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
ECL2 193 P - DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
TM5 194 D 5.26x27 DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
TM5 195 R 5.27x28 DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
TM5 196 D 5.28x29 DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
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TM5 209 S 5.41x42 DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
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TM5 211 F 5.43x44 DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
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TM5 215 F 5.47x47 DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
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TM5 217 V 5.49x49 DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
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TM5 219 L 5.51x51 DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
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TM5 222 I 5.54x54 DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
TM5 223 A 5.55x55 DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
TM5 224 S 5.56x56 DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
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TM5 226 H 5.58x58 DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
TM5 227 A 5.59x59 DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
TM5 228 A 5.60x60 DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
TM5 229 V 5.61x61 DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
TM5 230 S 5.62x62 DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
TM5 231 L 5.63x63 DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
TM5 232 R 5.64x64 DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
TM5 233 L 5.65x65 DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
TM5 234 Q 5.66x66 DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
TM5 235 H 5.67x67 DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
TM5 236 R 5.68x68 DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
ICL3 237 G - - - - -
ICL3 238 R - - - - -
ICL3 239 R - - - - -
ICL3 240 R - - - - -
TM6 241 P 6.30x30 AT2 receptor 5UNG - -
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TM6 244 F 6.33x33 DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
TM6 245 V 6.34x34 DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
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TM6 247 L 6.36x36 DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
TM6 248 V 6.37x37 DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
TM6 249 A 6.38x38 DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
TM6 250 A 6.39x39 DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
TM6 251 V 6.40x40 DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
TM6 252 V 6.41x41 DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
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TM6 256 A 6.45x45 DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
TM6 257 L 6.46x46 DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
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TM6 259 W 6.48x48 DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
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TM6 263 H 6.52x52 DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
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H8 320 R 8.59x59 DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
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H8 322 V 8.61x61 DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
H8 323 L 8.62x62 DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
H8 324 E 8.63x63 DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
H8 325 S 8.64x64 DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
C-term 326 V - DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
C-term 327 L - DP2 receptor 6D26 DP2 receptor 6D26
C-term 328 V - - - - -
C-term 329 D - - - - -
C-term 330 D - - - - -