6OL9 refined

PROTEIN CLASS

Class A (Rhodopsin)

RECEPTOR

M5 receptor

SPECIES

Homo sapiens

STATE

Inactive

VERSION

2021-07-19

MODEL

PDB file contains GPCRdb generic numbers in the B-factor field of CA atoms

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MAIN TEMPLATE

M5 receptor (sequence similarity: 100%) PDB: 6OL9

TEMPLATES

6OL9 (M5 receptor)
6OIJ (M1 receptor)
None
Main template (%) Additional templates (%) No template - freely modelled (%)
Backbone 90.8 3.3 5.9
Side-chains 85.3 6.5 8.2

Number of backbone templates: 2
Number of rotamer templates: 14

Segment Seq.num. AA GPCRdb# Backbone PDB Rotamer PDB
N-term 21 P - - - - -
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TM4 169 W 4.64x64 M5 receptor 6OL9 M5 receptor 6OL9
TM4 170 Q 4.65x65 M5 receptor 6OL9 M5 receptor 6OL9
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ECL2 180 L - M5 receptor 6OL9 - -
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ECL2 182 E - M5 receptor 6OL9 M5 receptor 6OL9
ECL2 183 C 45.50x50 M5 receptor 6OL9 M5 receptor 6OL9
ECL2 184 Q 45.51x51 M5 receptor 6OL9 M5 receptor 6OL9
ECL2 185 I 45.52x52 M5 receptor 6OL9 M5 receptor 6OL9
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ECL2 187 F - M5 receptor 6OL9 M5 receptor 6OL9
ECL2 188 L - M5 receptor 6OL9 M5 receptor 6OL9
ECL2 189 S - M5 receptor 6OL9 M5 receptor 6OL9
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TM5 200 A 5.45x46 M5 receptor 6OL9 M5 receptor 6OL9
TM5 201 A 5.46x461 M5 receptor 6OL9 M5 receptor 6OL9
TM5 202 F 5.47x47 M5 receptor 6OL9 M5 receptor 6OL9
TM5 203 Y 5.48x48 M5 receptor 6OL9 M5 receptor 6OL9
TM5 204 I 5.49x49 M5 receptor 6OL9 M5 receptor 6OL9
TM5 205 P 5.50x50 M5 receptor 6OL9 M5 receptor 6OL9
TM5 206 V 5.51x51 M5 receptor 6OL9 M5 receptor 6OL9
TM5 207 S 5.52x52 M5 receptor 6OL9 M5 receptor 6OL9
TM5 208 V 5.53x53 M5 receptor 6OL9 M5 receptor 6OL9
TM5 209 M 5.54x54 M5 receptor 6OL9 M5 receptor 6OL9
TM5 210 T 5.55x55 M5 receptor 6OL9 M5 receptor 6OL9
TM5 211 I 5.56x56 M5 receptor 6OL9 M5 receptor 6OL9
TM5 212 L 5.57x57 M5 receptor 6OL9 M5 receptor 6OL9
TM5 213 Y 5.58x58 M5 receptor 6OL9 M5 receptor 6OL9
TM5 214 C 5.59x59 M5 receptor 6OL9 M5 receptor 6OL9
TM5 215 R 5.60x60 M5 receptor 6OL9 M5 receptor 6OL9
TM5 216 I 5.61x61 M5 receptor 6OL9 M5 receptor 6OL9
TM5 217 Y 5.62x62 M5 receptor 6OL9 M5 receptor 6OL9
TM5 218 R 5.63x63 M5 receptor 6OL9 M2 receptor 5YC8
TM5 219 E 5.64x64 M5 receptor 6OL9 M5 receptor 6OL9
TM5 220 T 5.65x65 M5 receptor 6OL9 M3 receptor 5ZHP
TM5 221 E 5.66x66 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
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TM5 223 R 5.68x68 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM5 224 T 5.69x69 M1 receptor 6OIJ α2A-adrenoceptor 6KUX
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TM5 226 D 5.71x71 M1 receptor 6OIJ GPBA receptor 7CFN
TM5 227 L 5.72x72 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
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TM5 229 D 5.74x74 M1 receptor 6OIJ - -
TM5 230 L 5.75x75 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
ICL3 231 Q - - - - -
ICL3 232 G - - - - -
ICL3 233 S - - - - -
ICL3 234 D - - - - -
ICL3 235 S - - - - -
ICL3 426 M - - - - -
ICL3 427 T - - - - -
ICL3 428 K - - - - -
ICL3 429 R - - - - -
ICL3 430 K - - - - -
TM6 431 R 6.24x24 M5 receptor 6OL9 β1-adrenoceptor 4AMJ
TM6 432 V 6.25x25 M5 receptor 6OL9 M5 receptor 6OL9
TM6 433 V 6.26x26 M5 receptor 6OL9 M5 receptor 6OL9
TM6 434 L 6.27x27 M5 receptor 6OL9 M5 receptor 6OL9
TM6 435 V 6.28x28 M5 receptor 6OL9 M5 receptor 6OL9
TM6 436 K 6.29x29 M5 receptor 6OL9 M5 receptor 6OL9
TM6 437 E 6.30x30 M5 receptor 6OL9 M5 receptor 6OL9
TM6 438 R 6.31x31 M5 receptor 6OL9 M4 receptor 6KP6
TM6 439 K 6.32x32 M5 receptor 6OL9 M1 receptor 6WJC
TM6 440 A 6.33x33 M5 receptor 6OL9 M5 receptor 6OL9
TM6 441 A 6.34x34 M5 receptor 6OL9 M5 receptor 6OL9
TM6 442 Q 6.35x35 M5 receptor 6OL9 M5 receptor 6OL9
TM6 443 T 6.36x36 M5 receptor 6OL9 M5 receptor 6OL9
TM6 444 L 6.37x37 M5 receptor 6OL9 M5 receptor 6OL9
TM6 445 S 6.38x38 M5 receptor 6OL9 M5 receptor 6OL9
TM6 446 A 6.39x39 M5 receptor 6OL9 M5 receptor 6OL9
TM6 447 I 6.40x40 M5 receptor 6OL9 M5 receptor 6OL9
TM6 448 L 6.41x41 M5 receptor 6OL9 M5 receptor 6OL9
TM6 449 L 6.42x42 M5 receptor 6OL9 M5 receptor 6OL9
TM6 450 A 6.43x43 M5 receptor 6OL9 M5 receptor 6OL9
TM6 451 F 6.44x44 M5 receptor 6OL9 M5 receptor 6OL9
TM6 452 I 6.45x45 M5 receptor 6OL9 M5 receptor 6OL9
TM6 453 I 6.46x46 M5 receptor 6OL9 M5 receptor 6OL9
TM6 454 T 6.47x47 M5 receptor 6OL9 M5 receptor 6OL9
TM6 455 W 6.48x48 M5 receptor 6OL9 M5 receptor 6OL9
TM6 456 T 6.49x49 M5 receptor 6OL9 M5 receptor 6OL9
TM6 457 P 6.50x50 M5 receptor 6OL9 M5 receptor 6OL9
TM6 458 Y 6.51x51 M5 receptor 6OL9 M5 receptor 6OL9
TM6 459 N 6.52x52 M5 receptor 6OL9 M5 receptor 6OL9
TM6 460 I 6.53x53 M5 receptor 6OL9 M5 receptor 6OL9
TM6 461 M 6.54x54 M5 receptor 6OL9 M5 receptor 6OL9
TM6 462 V 6.55x55 M5 receptor 6OL9 M5 receptor 6OL9
TM6 463 L 6.56x56 M5 receptor 6OL9 M5 receptor 6OL9
TM6 464 V 6.57x57 M5 receptor 6OL9 M5 receptor 6OL9
TM6 465 S 6.58x58 M5 receptor 6OL9 M5 receptor 6OL9
TM6 466 T 6.59x59 M5 receptor 6OL9 M5 receptor 6OL9
TM6 467 F 6.60x60 M5 receptor 6OL9 M5 receptor 6OL9
TM6 468 C 6.61x61 M5 receptor 6OL9 M5 receptor 6OL9
ECL3 469 D - M5 receptor 6OL9 - -
ECL3 470 K - M5 receptor 6OL9 - -
ECL3 471 C - M5 receptor 6OL9 M5 receptor 6OL9
ECL3 472 V - M5 receptor 6OL9 M5 receptor 6OL9
TM7 473 P 7.31x30 M5 receptor 6OL9 M5 receptor 6OL9
TM7 474 V 7.32x31 M5 receptor 6OL9 M5 receptor 6OL9
TM7 475 T 7.33x32 M5 receptor 6OL9 M5 receptor 6OL9
TM7 476 L 7.34x33 M5 receptor 6OL9 M5 receptor 6OL9
TM7 477 W 7.35x34 M5 receptor 6OL9 M5 receptor 6OL9
TM7 478 H 7.36x35 M5 receptor 6OL9 M5 receptor 6OL9
TM7 479 L 7.37x36 M5 receptor 6OL9 M5 receptor 6OL9
TM7 480 G 7.38x37 M5 receptor 6OL9 M5 receptor 6OL9
TM7 481 Y 7.39x38 M5 receptor 6OL9 M5 receptor 6OL9
TM7 482 W 7.40x39 M5 receptor 6OL9 M5 receptor 6OL9
TM7 483 L 7.41x40 M5 receptor 6OL9 M5 receptor 6OL9
TM7 484 C 7.42x41 M5 receptor 6OL9 M5 receptor 6OL9
TM7 485 Y 7.43x42 M5 receptor 6OL9 M5 receptor 6OL9
TM7 486 V 7.44x43 M5 receptor 6OL9 M5 receptor 6OL9
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TM7 489 T 7.47x47 M5 receptor 6OL9 M5 receptor 6OL9
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TM7 493 I 7.51x51 M5 receptor 6OL9 M5 receptor 6OL9
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H8 511 L 8.59x59 M5 receptor 6OL9 M5 receptor 6OL9
C-term 512 C - M5 receptor 6OL9 M5 receptor 6OL9
C-term 513 R - M5 receptor 6OL9 M5 receptor 6OL9
C-term 514 W - - - - -
C-term 515 K - - - - -
C-term 516 K - - - - -