7BU6 refined

PROTEIN CLASS

Class A (Rhodopsin)

RECEPTOR

β1-adrenoceptor

SPECIES

Homo sapiens

STATE

Active

VERSION

2022-06-19

MODEL

PDB file contains GPCRdb generic numbers in the B-factor field of CA atoms

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MAIN TEMPLATE

β1-adrenoceptor (sequence similarity: 100%) PDB: 7BU6

TEMPLATES

4AMJ (β1-adrenoceptor)
6H7N (β1-adrenoceptor)
7BU6 (β1-adrenoceptor)
None
Main template (%) Additional templates (%) No template - freely modelled (%)
Backbone 88.7 4.8 6.4
Side-chains 86.5 6.4 7.1

Number of backbone templates: 3
Number of rotamer templates: 8

Segment Seq.num. AA GPCRdb# Backbone PDB Rotamer PDB
N-term 45 P - - - - -
N-term 46 A - - - - -
N-term 47 S - - - - -
N-term 48 E - - - - -
N-term 49 S - - - - -
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ICL2 166 Y 34.53x53 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
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ICL2 168 S 34.55x55 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
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ICL2 170 L 34.57x57 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
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TM4 173 A 4.40x40 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
TM4 174 R 4.41x41 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
TM4 175 A 4.42x42 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
TM4 176 R 4.43x43 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
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TM4 189 V 4.56x56 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
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TM4 191 F 4.58x58 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
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ECL2 203 S - β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
ECL2 204 D - β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
ECL2 205 E - β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
ECL2 206 A - β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
ECL2 207 R - β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
ECL2 208 R - β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
ECL2 209 C - β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
ECL2 210 Y - β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
ECL2 211 N - β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
ECL2 212 D - β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
ECL2 213 P - β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
ECL2 214 K - β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
ECL2 215 C - β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
ECL2 216 C 45.50x50 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
ECL2 217 D 45.51x51 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
ECL2 218 F 45.52x52 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
ECL2 219 V - β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
ECL2 220 T - β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
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TM5 223 A 5.37x38 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
TM5 224 Y 5.38x39 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
TM5 225 A 5.39x40 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
TM5 226 I 5.40x41 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
TM5 227 A 5.41x42 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
TM5 228 S 5.42x43 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
TM5 229 S 5.43x44 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
TM5 230 V 5.44x45 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
TM5 231 V 5.45x46 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
TM5 232 S 5.46x461 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
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TM5 239 I 5.53x53 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
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TM5 241 A 5.55x55 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
TM5 242 F 5.56x56 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
TM5 243 V 5.57x57 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
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TM5 245 L 5.59x59 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
TM5 246 R 5.60x60 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
TM5 247 V 5.61x61 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
TM5 248 F 5.62x62 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
TM5 249 R 5.63x63 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BVQ
TM5 250 E 5.64x64 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
TM5 251 A 5.65x65 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
TM5 252 Q 5.66x66 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
TM5 253 K 5.67x67 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BVQ
TM5 254 Q 5.68x68 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
TM5 255 V 5.69x69 β1-adrenoceptor 6H7N NTS1 receptor 4BUO
TM5 256 K 5.70x70 β1-adrenoceptor 6H7N α1B-adrenoceptor 7B6W
TM5 257 K 5.71x71 β1-adrenoceptor 6H7N β1-adrenoceptor 6H7N
TM5 258 I 5.72x72 β1-adrenoceptor 6H7N β1-adrenoceptor 6H7N
TM5 259 D 5.73x73 β1-adrenoceptor 6H7N β1-adrenoceptor 6H7N
TM5 260 S 5.74x74 β1-adrenoceptor 6H7N A2A receptor 3VG9
ICL3 261 C - - - - -
ICL3 262 E - - - - -
ICL3 263 R - - - - -
ICL3 264 R - - - - -
ICL3 265 F - - - - -
ICL3 308 K - - - - -
ICL3 309 R - - - - -
ICL3 310 R - - - - -
ICL3 311 P - - - - -
ICL3 312 S - - - - -
TM6 313 R 6.24x24 β1-adrenoceptor 4AMJ β1-adrenoceptor 4AMJ
TM6 314 L 6.25x25 β1-adrenoceptor 4AMJ - -
TM6 315 V 6.26x26 β1-adrenoceptor 4AMJ β1-adrenoceptor 7BVQ
TM6 316 A 6.27x27 β1-adrenoceptor 4AMJ β1-adrenoceptor 7BVQ
TM6 317 L 6.28x28 β1-adrenoceptor 4AMJ β1-adrenoceptor 7BVQ
TM6 318 R 6.29x29 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
TM6 319 E 6.30x30 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BVQ
TM6 320 Q 6.31x31 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
TM6 321 K 6.32x32 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
TM6 322 A 6.33x33 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
TM6 323 L 6.34x34 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
TM6 324 K 6.35x35 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 4AMJ
TM6 325 T 6.36x36 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
TM6 326 L 6.37x37 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
TM6 327 G 6.38x38 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
TM6 328 I 6.39x39 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
TM6 329 I 6.40x40 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
TM6 330 M 6.41x41 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
TM6 331 G 6.42x42 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
TM6 332 V 6.43x43 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
TM6 333 F 6.44x44 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
TM6 334 T 6.45x45 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
TM6 335 L 6.46x46 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
TM6 336 C 6.47x47 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
TM6 337 W 6.48x48 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
TM6 338 L 6.49x49 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
TM6 339 P 6.50x50 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
TM6 340 F 6.51x51 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
TM6 341 F 6.52x52 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
TM6 342 L 6.53x53 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
TM6 343 A 6.54x54 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
TM6 344 N 6.55x55 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
TM6 345 V 6.56x56 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
TM6 346 V 6.57x57 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
TM6 347 K 6.58x58 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
TM6 348 A 6.59x59 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
TM6 349 F 6.60x60 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
TM6 350 H 6.61x61 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
ECL3 351 R - β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
ECL3 352 E - β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
ECL3 353 L - β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
ECL3 354 V - β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
TM7 355 P 7.31x30 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
TM7 356 D 7.32x31 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
TM7 357 R 7.33x32 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
TM7 358 L 7.34x33 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
TM7 359 F 7.35x34 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
TM7 360 V 7.36x35 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
TM7 361 F 7.37x36 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
TM7 362 F 7.38x37 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
TM7 363 N 7.39x38 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
TM7 364 W 7.40x39 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
TM7 365 L 7.41x40 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
TM7 366 G 7.42x41 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
TM7 367 Y 7.43x42 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
TM7 368 A 7.44x43 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
TM7 369 N 7.45x45 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
TM7 370 S 7.46x46 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
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TM7 374 P 7.50x50 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
TM7 375 I 7.51x51 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
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TM7 377 Y 7.53x53 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
TM7 378 C 7.54x54 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
TM7 379 R 7.55x55 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
H8 380 S 8.47x47 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
H8 381 P 8.48x48 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
H8 382 D 8.49x49 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
H8 383 F 8.50x50 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
H8 384 R 8.51x51 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
H8 385 K 8.52x52 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BVQ
H8 386 A 8.53x53 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
H8 387 F 8.54x54 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
H8 388 Q 8.55x55 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
H8 389 R 8.56x56 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 4AMJ
H8 390 L 8.57x57 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
H8 391 L 8.58x58 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
H8 392 C 8.59x59 β1-adrenoceptor 7BU6 β1-adrenoceptor 7BU6
C-term 393 C - - - - -
C-term 394 A - - - - -
C-term 395 R - - - - -
C-term 396 R - - - - -
C-term 397 A - - - - -