7VV6 refined

PROTEIN CLASS

Class A (Rhodopsin)

RECEPTOR

SPECIES

Homo sapiens

STATE

Active

VERSION

2022-06-19

MODEL

PDB file contains GPCRdb generic numbers in the B-factor field of CA atoms

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MAIN TEMPLATE

MRGPRX2 (sequence similarity: 100%) PDB: 7VV6

TEMPLATES

7VV6 (MRGPRX2)
7VDL (MRGPRX2)
6C1R (C5a1 receptor)
None
Main template (%) Additional templates (%) No template - freely modelled (%)
Backbone 96.3 2.6 1.1
Side-chains 96.3 2.2 1.5

Number of backbone templates: 3
Number of rotamer templates: 3

Segment Seq.num. AA GPCRdb# Backbone PDB Rotamer PDB
N-term 19 D - MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
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N-term 23 L - MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
N-term 24 L - MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
N-term 25 L - MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
N-term 26 C - MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
N-term 27 G - MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
N-term 28 K - MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
N-term 29 E - MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
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ECL1 101 F - - - - -
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ICL2 138 R 34.54x54 MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
ICL2 139 C 34.55x55 MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
ICL2 140 R 34.56x56 MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
ICL2 141 R 34.57x57 MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
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TM4 143 R 4.39x39 C5a1 receptor 6C1R CXCR2 6LFL
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TM4 164 E 4.60x60 MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
TM4 165 G 4.61x61 MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
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ECL2 170 F - MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
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ECL2 172 F - MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
ECL2 173 S - MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
ECL2 174 D - MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
ECL2 175 G - MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
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TM5 182 T 5.38x38 MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
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TM5 189 A 5.45x45 MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
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TM5 191 L 5.47x47 MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
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TM5 197 V 5.53x53 MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
TM5 198 L 5.54x54 MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
TM5 199 C 5.55x55 MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
TM5 200 G 5.56x56 MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
TM5 201 S 5.57x57 MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
TM5 202 S 5.58x58 MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
TM5 203 L 5.59x59 MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
TM5 204 A 5.60x60 MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
TM5 205 L 5.61x61 MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
TM5 206 L 5.62x62 MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
TM5 207 V 5.63x63 MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
TM5 208 R 5.64x64 MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
TM5 209 I 5.65x65 MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
TM5 210 L 5.66x66 MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
TM5 211 C 5.67x67 MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
TM5 212 G 5.68x68 MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
ICL3 213 S - MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
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ICL3 215 G - MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
ICL3 216 L - MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
TM6 217 P 6.29x29 MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
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TM6 221 L 6.33x33 MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
TM6 222 Y 6.34x34 MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
TM6 223 L 6.35x35 MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
TM6 224 T 6.36x36 MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
TM6 225 I 6.37x37 MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
TM6 226 L 6.38x38 MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
TM6 227 L 6.39x39 MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
TM6 228 T 6.40x40 MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
TM6 229 V 6.41x41 MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
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TM6 234 L 6.46x46 MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
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TM6 236 G 6.48x48 MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
TM6 237 L 6.49x49 MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
TM6 238 P 6.50x50 MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
TM6 239 F 6.51x51 MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
TM6 240 G 6.52x52 MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
TM6 241 I 6.53x53 MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
TM6 242 Q 6.54x54 MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
TM6 243 W 6.55x55 MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
TM6 244 F 6.56x56 MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
TM6 245 L 6.57x57 MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
TM6 246 I 6.58x58 MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
TM6 247 L 6.59x59 MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
TM6 248 W 6.60x60 MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
TM6 249 I 6.61x61 MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
TM6 250 W 6.62x62 MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
ECL3 251 K - MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
ECL3 252 D - MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
ECL3 253 S - MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
ECL3 254 D - MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
ECL3 255 V - MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
TM7 256 L 7.30x29 MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
TM7 257 F 7.31x30 MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
TM7 258 C 7.32x31 MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
TM7 259 H 7.33x32 MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
TM7 260 I 7.34x33 MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
TM7 261 H 7.35x34 MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
TM7 262 P 7.36x35 MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
TM7 263 V 7.37x36 MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
TM7 264 S 7.38x37 MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
TM7 265 V 7.39x38 MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
TM7 266 V 7.40x39 MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
TM7 267 L 7.41x40 MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
TM7 268 S 7.42x41 MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
TM7 269 S 7.43x42 MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
TM7 270 L 7.44x43 MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
TM7 271 N 7.45x45 MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
TM7 272 S 7.46x46 MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
TM7 273 S 7.47x47 MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
TM7 274 A 7.48x48 MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
TM7 275 N 7.49x49 MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
TM7 276 P 7.50x50 MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
TM7 277 I 7.51x51 MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
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TM7 280 F 7.54x54 MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
TM7 281 F 7.55x55 MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
TM7 282 V 7.56x56 MRGPRX2 7VV6 MRGPRX2 7VV6
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C-term 290 R - - - - -