6LI0 refined

GPCR CLASS

Class A (Rhodopsin)

RECEPTOR

SPECIES

Homo sapiens

STATE

Inactive

VERSION

2022-10-26

METHOD

MODEL

PDB file contains GPCRdb generic numbers in the B-factor field of Cα atoms

NGL is a WebGL based 3D viewer powered by MMTF.

MAIN TEMPLATE

GPR52 (sequence similarity: 100%) PDB: 6LI0

TEMPLATES

6LI0 (GPR52)
AlphaFold
Main template (%) AlphaFold (%)
Backbone 81.4 18.6
Side-chains 79.2 20.8

Segment Seq.num. AA GPCRdb# Backbone PDB Rotamer PDB
N-term 1 M - AlphaFold AlphaFold AlphaFold AlphaFold
N-term 2 N - AlphaFold AlphaFold AlphaFold AlphaFold
N-term 3 E - AlphaFold AlphaFold AlphaFold AlphaFold
N-term 4 S - AlphaFold AlphaFold AlphaFold AlphaFold
N-term 5 R - AlphaFold AlphaFold AlphaFold AlphaFold
N-term 6 W - AlphaFold AlphaFold AlphaFold AlphaFold
N-term 7 T - AlphaFold AlphaFold AlphaFold AlphaFold
N-term 8 E - AlphaFold AlphaFold AlphaFold AlphaFold
N-term 9 W - AlphaFold AlphaFold AlphaFold AlphaFold
N-term 10 R - AlphaFold AlphaFold AlphaFold AlphaFold
N-term 11 I - AlphaFold AlphaFold AlphaFold AlphaFold
N-term 12 L - AlphaFold AlphaFold AlphaFold AlphaFold
N-term 13 N - AlphaFold AlphaFold AlphaFold AlphaFold
N-term 14 M - AlphaFold AlphaFold AlphaFold AlphaFold
N-term 15 S - AlphaFold AlphaFold AlphaFold AlphaFold
N-term 16 S - AlphaFold AlphaFold AlphaFold AlphaFold
N-term 17 G - AlphaFold AlphaFold AlphaFold AlphaFold
N-term 18 I - AlphaFold AlphaFold AlphaFold AlphaFold
N-term 19 V - AlphaFold AlphaFold AlphaFold AlphaFold
N-term 20 N - AlphaFold AlphaFold AlphaFold AlphaFold
N-term 21 V - GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
N-term 22 S - GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
N-term 23 E - GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
N-term 24 R - GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
N-term 25 H - GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
N-term 26 S - GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
N-term 27 C - GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
N-term 28 P - GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
N-term 29 L - GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
N-term 30 G - GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
N-term 31 F - GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
N-term 32 G - GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
N-term 33 H - GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
N-term 34 Y - GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
N-term 35 S - GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
N-term 36 V - GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
N-term 37 V - GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
N-term 38 D - GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
N-term 39 V - GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM1 40 C 1.32x32 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM1 41 I 1.33x33 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM1 42 F 1.34x34 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM1 43 E 1.35x35 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM1 44 T 1.36x36 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM1 45 V 1.37x37 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM1 46 V 1.38x38 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM1 47 I 1.39x39 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM1 48 V 1.40x40 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM1 49 L 1.41x41 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM1 50 L 1.42x42 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM1 51 T 1.43x43 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM1 52 F 1.44x44 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM1 53 L 1.45x45 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM1 54 I 1.46x46 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM1 55 I 1.47x47 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM1 56 A 1.48x48 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM1 57 G 1.49x49 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM1 58 N 1.50x50 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM1 59 L 1.51x51 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM1 60 T 1.52x52 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM1 61 V 1.53x53 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM1 62 I 1.54x54 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM1 63 F 1.55x55 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM1 64 V 1.56x56 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM1 65 F 1.57x57 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM1 66 H 1.58x58 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM1 67 C 1.59x59 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM1 68 A 1.60x60 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
ICL1 69 P 12.48x48 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
ICL1 70 L 12.49x49 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
ICL1 71 L 12.50x50 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
ICL1 72 H 12.51x51 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
ICL1 73 H 12.52x52 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM2 74 Y 2.37x37 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM2 75 T 2.38x38 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM2 76 T 2.39x39 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM2 77 S 2.40x40 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM2 78 Y 2.41x41 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM2 79 F 2.42x42 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM2 80 I 2.43x43 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM2 81 Q 2.44x44 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM2 82 T 2.45x45 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM2 83 M 2.46x46 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM2 84 A 2.47x47 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM2 85 Y 2.48x48 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM2 86 A 2.49x49 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM2 87 D 2.50x50 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM2 88 L 2.51x51 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM2 89 F 2.52x52 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM2 90 V 2.53x53 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM2 91 G 2.54x54 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM2 92 V 2.55x55 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM2 93 S 2.56x56 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM2 94 C 2.57x57 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM2 95 L 2.58x58 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM2 96 V 2.59x59 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM2 97 P 2.60x60 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM2 98 T 2.61x61 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM2 99 L 2.62x62 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM2 100 S 2.63x63 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM2 101 L 2.64x64 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM2 102 L 2.65x65 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM2 103 H 2.66x66 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM2 104 Y 2.67x67 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
ECL1 105 S - GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
ECL1 106 T - GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
ECL1 107 G - GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
ECL1 108 V - GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
ECL1 109 H - GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM3 110 E 3.21x21 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM3 111 S 3.22x22 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM3 112 L 3.23x23 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM3 113 T 3.24x24 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM3 114 C 3.25x25 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM3 115 Q 3.26x26 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM3 116 V 3.27x27 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM3 117 F 3.28x28 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM3 118 G 3.29x29 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM3 119 Y 3.30x30 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM3 120 I 3.31x31 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM3 121 I 3.32x32 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM3 122 S 3.33x33 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM3 123 V 3.34x34 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM3 124 L 3.35x35 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM3 125 K 3.36x36 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM3 126 S 3.37x37 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM3 127 V 3.38x38 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM3 128 S 3.39x39 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM3 129 M 3.40x40 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM3 130 A 3.41x41 GPR52 6LI0 AlphaFold AlphaFold
TM3 131 C 3.42x42 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM3 132 L 3.43x43 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM3 133 A 3.44x44 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM3 134 C 3.45x45 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM3 135 I 3.46x46 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM3 136 S 3.47x47 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM3 137 V 3.48x48 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM3 138 D 3.49x49 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM3 139 R 3.50x50 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM3 140 Y 3.51x51 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM3 141 L 3.52x52 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM3 142 A 3.53x53 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM3 143 I 3.54x54 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM3 144 T 3.55x55 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM3 145 K 3.56x56 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
ICL2 146 P 34.50x50 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
ICL2 147 L 34.51x51 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
ICL2 148 S 34.52x52 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
ICL2 149 Y 34.53x53 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
ICL2 150 N 34.54x54 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
ICL2 151 Q 34.55x55 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
ICL2 152 L 34.56x56 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
ICL2 153 V 34.57x57 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM4 154 T 4.38x38 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM4 155 P 4.39x39 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM4 156 C 4.40x40 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
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TM4 158 L 4.42x42 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM4 159 R 4.43x43 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM4 160 I 4.44x44 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM4 161 C 4.45x45 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM4 162 I 4.46x46 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM4 163 I 4.47x47 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM4 164 L 4.48x48 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM4 165 I 4.49x49 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM4 166 W 4.50x50 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM4 167 I 4.51x51 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM4 168 Y 4.52x52 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM4 169 S 4.53x53 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM4 170 C 4.54x54 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM4 171 L 4.55x55 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM4 172 I 4.56x56 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM4 173 F 4.57x57 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM4 174 L 4.58x59 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM4 175 P 4.59x60 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM4 176 S 4.60x61 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM4 177 F 4.61x62 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM4 178 F 4.62x63 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
ECL2 179 G - GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
ECL2 180 W - GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
ECL2 181 G - GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
ECL2 182 K - GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
ECL2 183 P - GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
ECL2 184 G - GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
ECL2 185 Y - GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
ECL2 186 H - GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
ECL2 187 G - GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
ECL2 188 D - GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
ECL2 189 I - GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
ECL2 190 F - GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
ECL2 191 E - GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
ECL2 192 W - GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
ECL2 193 C 45.50x50 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
ECL2 194 A 45.51x51 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
ECL2 195 T 45.52x52 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
ECL2 196 S - GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
ECL2 197 W - GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
ECL2 198 L - GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
ECL2 199 T - GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM5 200 S 5.36x37 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM5 201 A 5.37x38 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM5 202 Y 5.38x39 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM5 203 F 5.39x40 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM5 204 T 5.40x41 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM5 205 G 5.41x42 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM5 206 F 5.42x43 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM5 207 I 5.43x44 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM5 208 V 5.44x45 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM5 209 C 5.45x46 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM5 210 L 5.46x461 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM5 211 L 5.47x47 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM5 212 Y 5.48x48 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM5 213 A 5.49x49 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM5 214 P 5.50x50 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM5 215 A 5.51x51 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM5 216 A 5.52x52 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM5 217 F 5.53x53 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM5 218 V 5.54x54 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM5 219 V 5.55x55 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM5 220 C 5.56x56 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM5 221 F 5.57x57 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM5 222 T 5.58x58 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM5 223 Y 5.59x59 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM5 224 F 5.60x60 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM5 225 H 5.61x61 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM5 226 I 5.62x62 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM5 227 F 5.63x63 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM5 228 K 5.64x64 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM5 229 I 5.65x65 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM5 230 C 5.66x66 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM5 231 R 5.67x67 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM5 232 Q 5.68x68 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM5 233 H 5.69x69 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM5 234 T 5.70x70 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM5 235 K 5.71x71 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM5 236 E 5.72x72 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM5 237 I 5.73x73 AlphaFold AlphaFold AlphaFold AlphaFold
TM5 238 N 5.74x74 AlphaFold AlphaFold AlphaFold AlphaFold
TM5 239 D 5.75x75 AlphaFold AlphaFold AlphaFold AlphaFold
TM5 240 R 5.76x76 AlphaFold AlphaFold AlphaFold AlphaFold
TM5 241 R 5.77x77 AlphaFold AlphaFold AlphaFold AlphaFold
TM5 242 A 5.78x78 AlphaFold AlphaFold AlphaFold AlphaFold
TM5 243 R 5.79x79 AlphaFold AlphaFold AlphaFold AlphaFold
TM5 244 F 5.80x80 AlphaFold AlphaFold AlphaFold AlphaFold
ICL3 245 P - AlphaFold AlphaFold AlphaFold AlphaFold
ICL3 246 S - AlphaFold AlphaFold AlphaFold AlphaFold
ICL3 247 H - AlphaFold AlphaFold AlphaFold AlphaFold
ICL3 248 E - AlphaFold AlphaFold AlphaFold AlphaFold
ICL3 249 V - AlphaFold AlphaFold AlphaFold AlphaFold
ICL3 250 D - AlphaFold AlphaFold AlphaFold AlphaFold
TM6 251 S 6.21x21 AlphaFold AlphaFold AlphaFold AlphaFold
TM6 252 S 6.22x22 AlphaFold AlphaFold AlphaFold AlphaFold
TM6 253 R 6.23x23 AlphaFold AlphaFold AlphaFold AlphaFold
TM6 254 E 6.24x24 AlphaFold AlphaFold AlphaFold AlphaFold
TM6 255 T 6.25x25 AlphaFold AlphaFold AlphaFold AlphaFold
TM6 256 G 6.26x26 AlphaFold AlphaFold AlphaFold AlphaFold
TM6 257 H 6.27x27 AlphaFold AlphaFold AlphaFold AlphaFold
TM6 258 S 6.28x28 AlphaFold AlphaFold AlphaFold AlphaFold
TM6 259 P 6.29x29 AlphaFold AlphaFold AlphaFold AlphaFold
TM6 260 D 6.30x30 AlphaFold AlphaFold AlphaFold AlphaFold
TM6 261 R 6.31x31 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM6 262 R 6.32x32 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM6 263 Y 6.33x33 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM6 264 A 6.34x34 GPR52 6LI0 AlphaFold AlphaFold
TM6 265 M 6.35x35 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM6 266 V 6.36x36 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM6 267 L 6.37x37 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM6 268 F 6.38x38 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM6 269 R 6.39x39 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM6 270 I 6.40x40 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM6 271 T 6.41x41 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM6 272 S 6.42x42 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM6 273 V 6.43x43 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM6 274 F 6.44x44 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM6 275 Y 6.45x45 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM6 276 M 6.46x46 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM6 277 L 6.47x47 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM6 278 W 6.48x48 GPR52 6LI0 AlphaFold AlphaFold
TM6 279 L 6.49x49 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
TM6 280 P 6.50x50 GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
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