Rhodopsin (opsd_ictpu)

FAMILY

Class A (Rhodopsin) Sensory receptors Opsins Rhodopsin

GENE

rho

ORGANISM

Channel catfish (Ictalurus punctatus)

ALT. NAMES

Rhodopsin

SOURCE

SWISSPROT

SEQUENCE

N-term        
Y
E
Y
P
Q
Y
Y
L
V
N
10
TM1              
P
A
A
Y
A
A
L
G
A
Y
20
                   
M
F
L
L
I
L
V
G
F
P
30
                   
I
N
F
L
T
L
Y
V
T
I
40
    ICL1 TM2  
E
H
K
K
L
R
T
P
L
N
50
                   
Y
I
L
L
N
L
A
V
A
N
60
                   
L
F
M
V
F
G
G
F
T
T
70
                   
T
M
F
T
S
I
R
G
Y
F
80
ECL1 TM3      
V
L
G
H
L
G
C
N
L
E
90
                   
G
F
F
A
T
L
S
G
E
I
100
                   
A
L
W
S
L
V
V
L
A
I
110
                   
E
R
W
V
V
V
C
K
P
I
120
ICL2   TM4    
S
N
F
R
F
G
E
N
H
A
130
                   
I
M
G
L
A
F
T
W
T
M
140
                   
A
M
A
C
A
A
P
P
L
V
150
  ECL2          
G
W
S
R
Y
I
P
E
G
M
160
                   
Q
C
S
C
G
I
D
Y
Y
T
170
          TM5    
R
A
E
G
F
N
N
E
S
F
180
                   
V
V
Y
M
F
T
C
H
F
M
190
                   
T
P
L
T
I
V
F
F
C
Y
200
                   
G
R
L
L
C
A
V
K
E
A
210
        ICL3 TM6
A
A
A
Q
Q
E
S
E
T
T
220
                 
Q
R
A
E
R
E
V
T
R
M
230
                   
V
V
I
M
V
I
A
F
L
I
240
                   
C
W
C
P
Y
A
G
V
A
W
250
          ECL3  
F
I
F
T
H
Q
G
S
E
F
260
TM7              
G
P
V
F
M
T
I
P
A
F
270
                   
F
A
K
S
S
S
I
Y
N
P
280
            H8    
M
I
Y
I
C
L
N
K
Q
F
290
                   
R
H
C
M
I
T
T
L
C
C
300
C-term
G
K
K
A

LINKS

DIAGRAMS

7TM

ICL1 K K L R ICL1ECL1 Y F V L ECL1ICL2 P I S N F R F ICL2ECL2 W S R Y I P E G M Q C S C G I D Y Y T R A E G F ECL2ICL3 Q E S ICL3ECL3 Q G S E F ECL3N-term Y E Y P Q Y Y L V N-termC-term C G K K A C-term N P A A Y A A L G A Y M F L L I L V G F P I N F L T L Y V T I E H T P L N Y I L L N L A V A N L F M V F G G F T T T M F T S I R G G H L G C N L E G F F A T L S G E I A L W S L V V L A I E R W V V V C K G E N H A I M G L A F T W T M A M A C A A P P L V G N N E S F V V Y M F T C H F M T P L T I V F F C Y G R L L C A V K E A A A A Q E T T Q R A E R E V T R M V V I M V I A F L I C W C P Y A G V A W F I F T H G P V F M T I P A F F A K S S S I Y N P M I Y I C L N K Q M I T F R H C T L C
Pick color:
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 




Invitro Mutant Data: Increased binding/potency: >5-fold, >10-fold; Reduced binding/potency: >5-fold, >10-fold; No/low effect (<5-fold); and N/A

F N I P F G V L I L L F M Y A G L A A Y 1 L N L A V A N L F M V G F G F T T T M F T 2 V V L S W L A I E G S L T A F F G E L N 3 A I M G L A F T W T M A M A C A A P P L 4 Y C F F V I T L P T M F H C T F M Y V V F 5 V I M V I A F L I C W C P Y A G V A W F 6 M P N Y I S S S K A F F A P I T M F V 7
Pick color:
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 




Invitro Mutant Data: Increased binding/potency: >5-fold, >10-fold; Reduced binding/potency: >5-fold, >10-fold; No/low effect (<5-fold); and N/A

PHYSIOLOGICAL LIGANDS

No physiological ligands available

STRUCTURE MODELS

No structure models available. Check the Archive on Structure models for earlier releases.

STRUCTURES

No structures available