ADGRA1 homology model

PROTEIN CLASS

Class B2 (Adhesion)

RECEPTOR

SPECIES

Homo sapiens

STATE

Inactive (Δ distance (Å): -1.21 docs)

VERSION

2019-09-03

MODEL

PDB file contains GPCRdb generic numbers in the B-factor field of CA atoms

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MAIN TEMPLATE

CRF1 receptor (sequence similarity: 26%) PDB: 4Z9G

TEMPLATES

5UZ7 (CT receptor)
6NIY (CT receptor)
4Z9G (CRF1 receptor)
None
Main template (%) Additional templates (%) No template - freely modelled (%)
Backbone 71.8 8.8 19.4
Side-chains 12.2 12.2 75.5

Number of backbone templates: 3
Number of rotamer templates: 11

Segment Seq.num. GPCRdb# Backbone PDB Rotamer PDB
N-term 3 - - - -
N-term 4 - - - -
N-term 5 - - - -
N-term 6 - - - -
N-term 7 - - - -
TM1 8 1.27x27 CT receptor 5UZ7 - -
TM1 9 1.28x28 CT receptor 5UZ7 - -
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ICL1 47 - - - -
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ECL1 77 - - - -
ECL1 78 - - - -
ECL1 79 - - - -
ECL1 80 - - - -
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ICL2 115 - - - -
ICL2 116 - - - -
ICL2 117 - - - -
ICL2 118 - - - -
ICL2 119 - - - -
ICL2 120 - - - -
ICL2 121 - - - -
ICL2 122 - - - -
ICL2 123 - - - -
ICL2 124 - - - -
ICL2 125 - - - -
ICL2 126 - - - -
ICL2 127 - - - -
ICL2 128 - - - -
ICL2 129 - - - -
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ECL2 160 - - - -
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ECL2 162 - - - -
ECL2 163 - - - -
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ECL2 165 - - - -
ECL2 166 - - - -
ECL2 167 - - - -
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ECL2 171 - - - -
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ICL3 206 - - - -
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ICL3 246 - - - -
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ICL3 249 - - - -
ICL3 250 - - - -
TM6 251 6.34x34 CRF1 receptor 4Z9G - -
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ECL3 277 CRF1 receptor 4Z9G - -
ECL3 278 CRF1 receptor 4Z9G - -
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ECL3 280 CRF1 receptor 4Z9G - -
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TM7 286 7.37x36 CRF1 receptor 4Z9G CRF1 receptor 4Z9G
TM7 287 7.38x37 CRF1 receptor 4Z9G CRF1 receptor 4Z9G
TM7 288 7.39x38 CRF1 receptor 4Z9G - -
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TM7 290 7.41x40 CRF1 receptor 4Z9G - -
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TM7 293 7.44x43 CRF1 receptor 4Z9G glucagon receptor 5EE7
TM7 294 7.45x44 CRF1 receptor 4Z9G GLP-1 receptor 5VEW
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TM7 296 7.47x46 CRF1 receptor 4Z9G - -
TM7 297 7.48x47 CRF1 receptor 4Z9G - -
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TM7 300 7.51x51 CRF1 receptor 4Z9G GLP-1 receptor 5VEW
TM7 301 7.52x52 CRF1 receptor 4Z9G CRF1 receptor 4Z9G
TM7 302 7.53x53 CRF1 receptor 4Z9G CRF1 receptor 4Z9G
TM7 303 7.54x54 CRF1 receptor 4Z9G - -
TM7 304 7.55x55 CRF1 receptor 4Z9G GLP-1 receptor 5VEW
TM7 305 7.56x56 CRF1 receptor 4Z9G - -
TM7 306 7.57x57 CT receptor 6NIY - -
TM7 307 7.58x58 CT receptor 6NIY CT receptor 6NIY
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TM7 309 7.60x60 CT receptor 6NIY - -
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H8 325 8.62x62 CT receptor 6NIY CT receptor 6NIY
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C-term 327 - - - -
C-term 328 - - - -
C-term 329 - - - -
C-term 330 - - - -
C-term 331 - - - -