ADGRD1 homology model

PROTEIN CLASS

Class B2 (Adhesion)

RECEPTOR

SPECIES

Homo sapiens

STATE

Active

VERSION

2020-10-08

MODEL

PDB file contains GPCRdb generic numbers in the B-factor field of CA atoms

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MAIN TEMPLATE

CRF1 receptor (sequence similarity: 42%) PDB: 6P9X

TEMPLATES

5UZ7 (CT receptor)
6P9X (CRF1 receptor)
4Z9G (CRF1 receptor)
4K5Y (CRF1 receptor)
6PB0 (CRF1 receptor)
6WI9 (secretin receptor)
None
Main template (%) Additional templates (%) No template - freely modelled (%)
Backbone 76.2 7.4 16.3
Side-chains 22.3 24.1 53.5

Number of backbone templates: 6
Number of rotamer templates: 12

Segment Seq.num. AA GPCRdb# Backbone PDB Rotamer PDB
N-term 549 I - - - -
N-term 550 L - - - -
N-term 551 M - - - -
N-term 552 Q - - - -
N-term 553 V - - - -
TM1 554 V 1.27x27 CT receptor 5UZ7 - -
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ECL1 628 G - - - -
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ICL2 667 S secretin receptor 6WI9 secretin receptor 6WI9
ICL2 668 E secretin receptor 6WI9 secretin receptor 6WI9
ICL2 669 D - - - -
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ECL2 703 N - - - -
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ECL2 707 S - - - -
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ICL3 745 N - - - -
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C-term 827 T - - - -
C-term 828 S - - - -
C-term 829 S - - - -
C-term 830 S - - - -
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