ADGRE3 homology model

PROTEIN CLASS

Class B2 (Adhesion)

RECEPTOR

ADGRE3

SPECIES

Homo sapiens

STATE

Inactive

VERSION

2021-01-08

MODEL

PDB file contains GPCRdb generic numbers in the B-factor field of CA atoms

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MAIN TEMPLATE

CRF1 receptor (sequence similarity: 36%) PDB: 4Z9G
Align

TEMPLATES

6VN7 (VPAC1 receptor)
4Z9G (CRF1 receptor)
6WZG (secretin receptor)
7D3S (secretin receptor)
6M1H (PAC1 receptor)
None
Main template (%) Additional templates (%) No template - freely modelled (%)
Backbone 71.5 11.3 17.3
Side-chains 19.4 22.9 57.7

Number of backbone templates: 5
Number of rotamer templates: 13

Segment Seq.num. AA GPCRdb# Backbone PDB Rotamer PDB
N-term 339 S - - - -
N-term 340 S - - - -
N-term 341 F - - - -
N-term 342 A - - - -
N-term 343 V - - - -
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ECL1 414 E - - - -
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ICL2 458 S - - - -
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ECL2 494 D - - - -
ECL2 495 R - - - -
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ECL2 499 H - - - -
ECL2 500 L - - - -
TM5 501 D 5.32x32 - - - -
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TM5 508 F 5.39x39 CRF1 receptor 4Z9G - -
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TM5 528 W 5.59x59 CRF1 receptor 4Z9G - -
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TM5 534 L 5.65x65 CRF1 receptor 4Z9G CRF1 receptor 4Z9G
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ICL3 536 S - - - -
ICL3 537 L - - - -
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ICL3 539 S - - - -
ICL3 541 V - - - -
ICL3 542 S - - - -
ICL3 543 T - - - -
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ICL3 545 Q - - - -
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TM6 571 Q 6.59x59 PAC1 receptor 6M1H - -
ECL3 572 V - - - -
ECL3 573 G - - - -
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ECL3 575 A - - - -
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TM7 585 I 7.44x43 CRF1 receptor 4Z9G calcitonin receptor-like receptor 6UUS
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TM7 587 N 7.46x45 CRF1 receptor 4Z9G PTH1 receptor 6FJ3
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TM7 590 Q 7.49x49 CRF1 receptor 4Z9G CRF1 receptor 4Z9G
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TM7 598 Y 7.57x57 secretin receptor 6WZG secretin receptor 6WZG
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H8 610 Q 8.55x55 secretin receptor 6WZG secretin receptor 6WZG
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H8 612 W 8.57x57 secretin receptor 6WZG - -
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H8 616 I 8.61x61 secretin receptor 6WZG - -
H8 617 V 8.62x62 secretin receptor 6WZG - -
H8 618 K 8.63x63 secretin receptor 6WZG - -
C-term 619 S - - - -
C-term 620 K - - - -
C-term 621 S - - - -
C-term 622 E - - - -
C-term 623 S - - - -