ADGRF4 homology model

PROTEIN CLASS

Class B2 (Adhesion)

RECEPTOR

SPECIES

Homo sapiens

STATE

Active

VERSION

2020-10-08

MODEL

PDB file contains GPCRdb generic numbers in the B-factor field of CA atoms

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MAIN TEMPLATE

CRF1 receptor (sequence similarity: 35%) PDB: 6P9X

TEMPLATES

6VN7 (VPAC1 receptor)
6P9X (CRF1 receptor)
4Z9G (CRF1 receptor)
6PB0 (CRF1 receptor)
None
Main template (%) Additional templates (%) No template - freely modelled (%)
Backbone 73.1 4.8 22.1
Side-chains 15.3 18.7 66.0

Number of backbone templates: 4
Number of rotamer templates: 12

Segment Seq.num. AA GPCRdb# Backbone PDB Rotamer PDB
N-term 384 V - - - -
N-term 385 M - - - -
N-term 386 S - - - -
N-term 387 F - - - -
N-term 388 S - - - -
TM1 389 I 1.27x27 VPAC1 receptor 6VN7 - -
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TM1 399 K 1.37x37 CRF1 receptor 6P9X - -
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ICL2 508 R - - - -
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ICL2 510 M - - - -
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TM5 584 T 5.61x61 CRF1 receptor 6P9X - -
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TM5 588 S 5.65x65 CRF1 receptor 6P9X - -
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ICL3 591 S - - - -
ICL3 592 S - - - -
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ICL3 595 Q - - - -
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TM6 605 K 6.40x40 CRF1 receptor 6P9X CRF1 receptor 6P9X
TM6 606 N 6.41x41 CRF1 receptor 6P9X - -
TM6 607 V 6.42x42 CRF1 receptor 6P9X - -
TM6 608 A 6.43x43 CRF1 receptor 6P9X - -
TM6 609 I 6.44x44 CRF1 receptor 6P9X calcitonin receptor-like receptor 6UUS
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TM6 613 L 6.48x48 CRF1 receptor 6P9X CRF1 receptor 6P9X
TM6 614 L 6.49x49 CRF1 receptor 6P9X CRF1 receptor 6P9X
TM6 615 G 6.50x50 CRF1 receptor 6P9X CRF1 receptor 6P9X
TM6 616 L 6.51x51 CRF1 receptor 6P9X - -
TM6 617 T 6.52x52 CRF1 receptor 6P9X CRF1 receptor 6P9X
TM6 618 W 6.53x53 CRF1 receptor 6P9X - -
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TM6 621 G 6.56x56 CRF1 receptor 4Z9G - -
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TM6 623 A 6.58x58 CRF1 receptor 4Z9G - -
ECL3 624 T - - - -
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ECL3 626 I - - - -
ECL3 627 E - - - -
ECL3 628 G - - - -
ECL3 629 T - - - -
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TM7 634 H 7.39x38 CRF1 receptor 6P9X - -
TM7 635 I 7.40x39 CRF1 receptor 6P9X - -
TM7 636 I 7.41x40 CRF1 receptor 6P9X calcitonin receptor-like receptor 6UUS
TM7 637 F 7.42x41 CRF1 receptor 6P9X - -
TM7 638 A 7.43x42 CRF1 receptor 6P9X CRF1 receptor 4Z9G
TM7 639 L 7.44x43 CRF1 receptor 6P9X PTH1 receptor 6NBI
TM7 640 L 7.45x44 CRF1 receptor 6P9X CRF1 receptor 6P9X
TM7 641 N 7.46x45 CRF1 receptor 6P9X PTH1 receptor 6NBI
TM7 642 A 7.47x46 CRF1 receptor 6P9X - -
TM7 643 F 7.48x47 CRF1 receptor 6P9X CRF1 receptor 6P9X
TM7 644 Q 7.49x49 CRF1 receptor 6P9X CRF1 receptor 6P9X
TM7 645 G 7.50x50 CRF1 receptor 6P9X CRF1 receptor 6P9X
TM7 646 F 7.51x51 CRF1 receptor 6P9X CRF1 receptor 6P9X
TM7 647 F 7.52x52 CRF1 receptor 6P9X CRF1 receptor 6P9X
TM7 648 I 7.53x53 CRF1 receptor 6P9X - -
TM7 649 L 7.54x54 CRF1 receptor 6P9X - -
TM7 650 L 7.55x55 CRF1 receptor 6P9X - -
TM7 651 F 7.56x56 CRF1 receptor 6P9X CRF1 receptor 6P9X
TM7 652 G 7.57x57 CRF1 receptor 6P9X - -
TM7 653 T 7.58x58 CRF1 receptor 6P9X - -
TM7 654 I 7.59x59 CRF1 receptor 6P9X - -
TM7 655 M 7.60x60 CRF1 receptor 6P9X - -
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H8 657 H 8.48x48 CRF1 receptor 6P9X - -
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H8 666 R 8.57x57 CRF1 receptor 6P9X CRF1 receptor 6P9X
H8 667 M 8.58x58 CRF1 receptor 6P9X - -
H8 668 S 8.59x59 CRF1 receptor 6P9X PTH1 receptor 6NBI
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H8 670 L 8.61x61 CRF1 receptor 6P9X - -
H8 671 K 8.62x62 CRF1 receptor 6PB0 PAC1 receptor 6M1I
H8 672 G 8.63x63 CRF1 receptor 6PB0 - -
C-term 673 K - - - -
C-term 674 S - - - -
C-term 675 R - - - -
C-term 676 A - - - -
C-term 677 A - - - -