ADGRG4 homology model

PROTEIN CLASS

Class B2 (Adhesion)

RECEPTOR

SPECIES

Homo sapiens

STATE

Inactive

VERSION

2020-09-02

MODEL

PDB file contains GPCRdb generic numbers in the B-factor field of CA atoms

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MAIN TEMPLATE

CRF1 receptor (sequence similarity: 35%) PDB: 4Z9G

TEMPLATES

6NBI (PTH1 receptor)
6FJ3 (PTH1 receptor)
4Z9G (CRF1 receptor)
6M1H (PAC1 receptor)
6PB1 (CRF2 receptor)
None
Main template (%) Additional templates (%) No template - freely modelled (%)
Backbone 72.2 10.7 17.1
Side-chains 20.6 20.6 58.7

Number of backbone templates: 5
Number of rotamer templates: 11

Segment Seq.num. AA GPCRdb# Backbone PDB Rotamer PDB
TM1 2731 S 1.27x27 PTH1 receptor 6NBI - -
TM1 2732 R 1.28x28 PTH1 receptor 6NBI - -
TM1 2733 S 1.29x29 PTH1 receptor 6NBI - -
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ICL3 2925 S - - - -
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ICL3 2927 I - - - -
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ICL3 2930 T - - - -
ICL3 2931 R - - - -
ICL3 2932 R - - - -
ICL3 2933 K - - - -
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TM6 2939 L 6.39x39 CRF1 receptor 4Z9G PTH1 receptor 6NBI
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TM6 2942 T 6.42x42 CRF1 receptor 4Z9G CRF1 receptor 4Z9G
TM6 2943 M 6.43x43 CRF1 receptor 4Z9G CT receptor 6NIY
TM6 2944 S 6.44x44 CRF1 receptor 4Z9G - -
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TM6 2946 T 6.46x46 CRF1 receptor 4Z9G - -
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TM6 2954 G 6.54x54 CRF1 receptor 4Z9G - -
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ECL3 2960 W - - - -
ECL3 2961 G - - - -
ECL3 2962 P - - - -
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TM7 2965 N 7.36x35 CRF1 receptor 4Z9G - -
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TM7 2968 L 7.39x38 CRF1 receptor 4Z9G GLP-1 receptor 5VEW
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TM7 2970 L 7.41x40 CRF1 receptor 4Z9G - -
TM7 2971 F 7.42x41 CRF1 receptor 4Z9G - -
TM7 2972 A 7.43x42 CRF1 receptor 4Z9G CRF1 receptor 4Z9G
TM7 2973 I 7.44x43 CRF1 receptor 4Z9G calcitonin receptor-like receptor 6UUS
TM7 2974 F 7.45x44 CRF1 receptor 4Z9G PTH1 receptor 6FJ3
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TM7 2979 G 7.50x50 CRF1 receptor 4Z9G CRF1 receptor 4Z9G
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TM7 2984 V 7.55x55 CRF1 receptor 4Z9G CRF1 receptor 4Z9G
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TM7 2987 C 7.58x58 CRF2 receptor 6PB1 CRF2 receptor 6PB1
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H8 2991 E 8.48x48 CRF2 receptor 6PB1 - -
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H8 2993 V 8.50x50 CRF2 receptor 6PB1 CRF2 receptor 6PB1
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H8 3000 H 8.57x57 CRF2 receptor 6PB1 - -
H8 3001 L 8.58x58 CRF2 receptor 6PB1 - -
H8 3002 C 8.59x59 CRF2 receptor 6PB1 - -
H8 3003 C 8.60x60 CRF2 receptor 6PB1 - -
H8 3004 G 8.61x61 CRF2 receptor 6PB1 - -
H8 3005 W 8.62x62 CRF2 receptor 6PB1 - -
H8 3006 L 8.63x63 CRF2 receptor 6PB1 CRF2 receptor 6PB1
C-term 3007 R - - - -
C-term 3008 L - - - -
C-term 3009 D - - - -
C-term 3010 N - - - -
C-term 3011 S - - - -