ADGRL2 homology model

PROTEIN CLASS

Class B2 (Adhesion)

RECEPTOR

ADGRL2

SPECIES

Homo sapiens

STATE

Inactive

VERSION

2021-04-08

MODEL

PDB file contains GPCRdb generic numbers in the B-factor field of CA atoms

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MAIN TEMPLATE

CRF1 receptor (sequence similarity: 9%) PDB: 4K5Y
Align

TEMPLATES

7D77 (ADGRG3)
4K5Y (CRF1 receptor)
6WZG (secretin receptor)
None
Main template (%) Additional templates (%) No template - freely modelled (%)
Backbone 75.5 10.6 13.9
Side-chains 19.4 31.1 49.5

Number of backbone templates: 3
Number of rotamer templates: 15

Segment Seq.num. AA GPCRdb# Backbone PDB Rotamer PDB
N-term 837 A - - - - -
N-term 838 Y - - - - -
N-term 839 K - - - - -
N-term 840 D - - - - -
N-term 841 G - - - - -
TM1 842 V 1.34x34 ADGRG3 7D77 CRF1 receptor 4Z9G
TM1 843 H 1.35x35 ADGRG3 7D77 CRF1 receptor 4Z9G
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TM1 845 L 1.37x37 CRF1 receptor 4K5Y calcitonin receptor-like receptor 7KNU
TM1 846 L 1.38x38 CRF1 receptor 4K5Y - -
TM1 847 L 1.39x39 CRF1 receptor 4K5Y calcitonin receptor-like receptor 7KNU
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TM1 849 V 1.41x41 CRF1 receptor 4K5Y glucagon receptor 5YQZ
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TM1 851 T 1.43x43 CRF1 receptor 4K5Y calcitonin receptor-like receptor 7KNU
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TM1 855 I 1.47x47 CRF1 receptor 4K5Y - -
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TM1 857 I 1.49x49 CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
TM1 858 S 1.50x50 CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
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TM1 868 T 1.60x60 CRF1 receptor 4K5Y - -
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ICL1 875 L 12.50x50 ADGRG3 7D77 PTH1 receptor 6FJ3
ICL1 876 Q 12.51x51 - - - -
TM2 877 S 2.44x44 CRF1 receptor 4K5Y - -
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TM2 901 I 2.68x68 CRF1 receptor 4K5Y - -
TM2 902 D 2.69x69 CRF1 receptor 4K5Y - -
TM2 903 K 2.70x70 CRF1 receptor 4K5Y - -
ECL1 904 T - - - - -
ECL1 905 K - - - - -
ECL1 906 Y - - - - -
ECL1 907 A - - - - -
TM3 908 I 3.27x27 CRF1 receptor 4K5Y - -
TM3 909 A 3.28x28 CRF1 receptor 4K5Y GLP-1 receptor 6LN2
TM3 910 C 3.29x29 CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
TM3 911 P 3.30x30 CRF1 receptor 4K5Y - -
TM3 912 I 3.31x31 CRF1 receptor 4K5Y CT receptor 6NIY
TM3 913 F 3.32x32 CRF1 receptor 4K5Y - -
TM3 914 A 3.33x33 CRF1 receptor 4K5Y glucagon receptor 5YQZ
TM3 915 G 3.34x34 CRF1 receptor 4K5Y - -
TM3 916 L 3.35x35 CRF1 receptor 4K5Y GLP-1 receptor 6LN2
TM3 917 L 3.36x36 CRF1 receptor 4K5Y - -
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TM3 927 W 3.46x46 CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
TM3 928 M 3.47x47 CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
TM3 929 C 3.48x48 CRF1 receptor 4K5Y - -
TM3 930 L 3.49x49 CRF1 receptor 4K5Y ADGRG3 7D77
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TM3 937 L 3.56x56 CRF1 receptor 4K5Y ADGRG3 7D77
TM3 938 M 3.57x57 CRF1 receptor 4K5Y - -
TM3 939 L 3.58x58 CRF1 receptor 4K5Y GLP-1 receptor 6LN2
TM3 940 V 3.59x59 CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
TM3 941 E 3.60x60 CRF1 receptor 4K5Y - -
ICL2 942 V - CRF1 receptor 4K5Y - -
ICL2 943 F - - - - -
ICL2 944 E - - - - -
ICL2 945 S - - - - -
ICL2 946 E - CRF1 receptor 4K5Y - -
ICL2 947 Y - CRF1 receptor 4K5Y - -
TM4 948 S 4.40x41 CRF1 receptor 4K5Y - -
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TM4 953 Y 4.45x46 CRF1 receptor 4K5Y calcitonin receptor-like receptor 7KNU
TM4 954 Y 4.46x47 CRF1 receptor 4K5Y calcitonin receptor-like receptor 7KNU
TM4 955 V 4.47x48 CRF1 receptor 4K5Y PTH1 receptor 6FJ3
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TM4 957 G 4.49x491 CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
TM4 958 Y 4.50x50 CRF1 receptor 4K5Y - -
TM4 959 L 4.51x51 CRF1 receptor 4K5Y - -
TM4 960 F 4.52x52 CRF1 receptor 4K5Y calcitonin receptor-like receptor 7KNU
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TM4 965 V 4.57x57 CRF1 receptor 4K5Y PTH1 receptor 6FJ3
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TM4 969 A 4.61x61 CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
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TM4 971 I 4.63x63 CRF1 receptor 4K5Y - -
TM4 972 D 4.64x64 CRF1 receptor 4K5Y - -
ECL2 973 Y - - - - -
ECL2 974 K - - - - -
ECL2 975 S - - - - -
ECL2 976 Y - - - - -
ECL2 977 G - - - - -
ECL2 978 T - - - - -
ECL2 979 E - - - - -
ECL2 980 K - - - - -
ECL2 981 A - - - - -
ECL2 982 C 45.50x50 CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
ECL2 983 W 45.51x51 CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
ECL2 984 L 45.52x52 CRF1 receptor 4K5Y CT receptor 6NIY
ECL2 985 H - - - - -
ECL2 986 V - secretin receptor 6WZG - -
ECL2 987 D - - - - -
TM5 988 N 5.33x33 secretin receptor 6WZG secretin receptor 6WZG
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TM5 994 F 5.39x39 CRF1 receptor 4K5Y - -
TM5 995 I 5.40x40 CRF1 receptor 4K5Y - -
TM5 996 G 5.41x41 CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
TM5 997 P 5.42x42 CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
TM5 998 V 5.43x43 CRF1 receptor 4K5Y glucagon receptor 5YQZ
TM5 999 T 5.44x44 CRF1 receptor 4K5Y - -
TM5 1000 F 5.45x45 CRF1 receptor 4K5Y GLP-1 receptor 6LN2
TM5 1001 I 5.46x46 CRF1 receptor 4K5Y - -
TM5 1002 I 5.47x47 CRF1 receptor 4K5Y PTH1 receptor 6FJ3
TM5 1003 L 5.48x48 CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
TM5 1004 L 5.49x49 CRF1 receptor 4K5Y PTH1 receptor 6FJ3
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TM5 1006 I 5.51x51 CRF1 receptor 4K5Y - -
TM5 1007 I 5.52x52 CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
TM5 1008 F 5.53x53 CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
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TM5 1014 C 5.59x59 CRF1 receptor 4K5Y GLP-1 receptor 6LN2
TM5 1015 K 5.60x60 CRF1 receptor 4K5Y ADGRG3 7D77
TM5 1016 M 5.61x61 CRF1 receptor 4K5Y - -
TM5 1017 V 5.62x62 CRF1 receptor 4K5Y GLP-1 receptor 6LN2
TM5 1018 K 5.63x63 CRF1 receptor 4K5Y - -
TM5 1019 H 5.64x64 CRF1 receptor 4K5Y - -
TM5 1020 S 5.65x65 CRF1 receptor 4K5Y ADGRG3 7D77
TM5 1021 N 5.66x66 ADGRG3 7D77 - -
TM5 1022 T 5.67x67 ADGRG3 7D77 secretin receptor 7D3S
TM5 1023 L 5.68x68 ADGRG3 7D77 - -
ICL3 1024 K - - - - -
ICL3 1025 P - - - - -
ICL3 1026 D - - - - -
ICL3 1027 S - - - - -
ICL3 1028 S - - - - -
ICL3 1029 R - - - - -
ICL3 1030 L - - - - -
ICL3 1031 E - - - - -
TM6 1032 N 6.34x34 CRF1 receptor 4K5Y - -
TM6 1033 I 6.35x35 CRF1 receptor 4K5Y - -
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TM6 1035 S 6.37x37 CRF1 receptor 4K5Y - -
TM6 1036 W 6.38x38 CRF1 receptor 4K5Y - -
TM6 1037 V 6.39x39 CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
TM6 1038 L 6.40x40 CRF1 receptor 4K5Y ADGRG3 7D77
TM6 1039 G 6.41x41 CRF1 receptor 4K5Y - -
TM6 1040 A 6.42x42 CRF1 receptor 4K5Y - -
TM6 1041 F 6.43x43 CRF1 receptor 4K5Y - -
TM6 1042 A 6.44x44 CRF1 receptor 4K5Y - -
TM6 1043 L 6.45x45 CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
TM6 1044 L 6.46x46 CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
TM6 1045 C 6.47x47 CRF1 receptor 4K5Y - -
TM6 1046 L 6.48x48 CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
TM6 1047 L 6.49x49 CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
TM6 1048 G 6.50x50 CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
TM6 1049 L 6.51x51 CRF1 receptor 4K5Y - -
TM6 1050 T 6.52x52 CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
TM6 1051 W 6.53x53 CRF1 receptor 4K5Y ADGRG3 7D77
TM6 1052 S 6.54x54 CRF1 receptor 4K5Y - -
TM6 1053 F 6.55x55 CRF1 receptor 4K5Y - -
TM6 1054 G 6.56x56 CRF1 receptor 4K5Y - -
TM6 1055 L 6.57x57 CRF1 receptor 4K5Y - -
TM6 1056 L 6.58x58 CRF1 receptor 4K5Y - -
ECL3 1057 F - CRF1 receptor 4K5Y - -
ECL3 1058 I - CRF1 receptor 4K5Y - -
ECL3 1059 N - CRF1 receptor 4K5Y - -
ECL3 1060 E - CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
ECL3 1061 E - CRF1 receptor 4K5Y - -
TM7 1062 T 7.35x34 CRF1 receptor 4K5Y - -
TM7 1063 I 7.36x35 CRF1 receptor 4K5Y CRF2 receptor 6PB1
TM7 1064 V 7.37x36 CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
TM7 1065 M 7.38x37 CRF1 receptor 4K5Y - -
TM7 1066 A 7.39x38 CRF1 receptor 4K5Y - -
TM7 1067 Y 7.40x39 CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
TM7 1068 L 7.41x40 CRF1 receptor 4K5Y GHRH receptor 7CZ5
TM7 1069 F 7.42x41 CRF1 receptor 4K5Y ADGRG3 7D77
TM7 1070 T 7.43x42 CRF1 receptor 4K5Y - -
TM7 1071 I 7.44x43 CRF1 receptor 4K5Y calcitonin receptor-like receptor 7KNU
TM7 1072 F 7.45x44 CRF1 receptor 4K5Y PTH1 receptor 6FJ3
TM7 1073 N 7.46x45 CRF1 receptor 4K5Y PTH1 receptor 6FJ3
TM7 1074 A 7.47x46 CRF1 receptor 4K5Y - -
TM7 1075 F 7.48x47 CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
TM7 1076 Q 7.49x49 CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
TM7 1077 G 7.50x50 CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
TM7 1078 V 7.51x51 CRF1 receptor 4K5Y ADGRG3 7D77
TM7 1079 F 7.52x52 CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
TM7 1080 I 7.53x53 CRF1 receptor 4K5Y ADGRG3 7D77
TM7 1081 F 7.54x54 CRF1 receptor 4K5Y - -
TM7 1082 I 7.55x55 CRF1 receptor 4K5Y PTH1 receptor 6FJ3
TM7 1083 F 7.56x56 CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
TM7 1084 H 7.57x57 CRF1 receptor 4K5Y - -
TM7 1085 C 7.58x58 CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
TM7 1086 A 7.59x59 CRF1 receptor 4K5Y - -
TM7 1087 L 7.60x60 CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
TM7 1088 Q 7.61x61 ADGRG3 7D77 - -
H8 1089 K 8.48x48 secretin receptor 6WZG glucagon receptor 5YQZ
H8 1090 K 8.49x49 secretin receptor 6WZG - -
H8 1091 V 8.50x50 secretin receptor 6WZG secretin receptor 6WZG
H8 1092 R 8.51x51 secretin receptor 6WZG CRF2 receptor 6PB1
H8 1093 K 8.52x52 secretin receptor 6WZG - -
H8 1094 E 8.53x53 secretin receptor 6WZG secretin receptor 6WZG
H8 1095 Y 8.54x54 secretin receptor 6WZG - -
H8 1096 G 8.55x55 secretin receptor 6WZG - -
H8 1097 K 8.56x56 secretin receptor 6WZG PTH1 receptor 6FJ3
H8 1098 C 8.57x57 secretin receptor 6WZG - -
H8 1099 F 8.58x58 secretin receptor 6WZG - -
H8 1100 R 8.59x59 secretin receptor 6WZG PAC1 receptor 6P9Y
H8 1101 H 8.60x60 secretin receptor 6WZG - -
H8 1102 S 8.61x61 secretin receptor 6WZG - -
H8 1103 Y 8.62x62 secretin receptor 6WZG - -
H8 1104 C 8.63x63 secretin receptor 6WZG - -
C-term 1105 C - - - - -
C-term 1106 G - - - - -
C-term 1107 G - - - - -
C-term 1108 L - - - - -
C-term 1109 P - - - - -