CCR10 homology model

PROTEIN CLASS

Class A (Rhodopsin)

RECEPTOR

SPECIES

Homo sapiens

STATE

Active

VERSION

2020-09-02

MODEL

PDB file contains GPCRdb generic numbers in the B-factor field of CA atoms

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MAIN TEMPLATE

CCR6 (sequence similarity: 53%) PDB: 6WWZ

TEMPLATES

6WWZ (CCR6)
5ZKQ (PAF receptor)
6QZH (CCR7)
5LWE (CCR9)
5UIW (CCR5)
6J21 (NK1 receptor)
None
Main template (%) Additional templates (%) No template - freely modelled (%)
Backbone 87.0 6.7 6.4
Side-chains 33.8 48.8 17.4

Number of backbone templates: 6
Number of rotamer templates: 42

Segment Seq.num. AA GPCRdb# Backbone PDB Rotamer PDB
N-term 33 K CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
N-term 34 A CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
N-term 35 D CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
N-term 36 V CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
N-term 37 Q CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM1 38 A 1.29x29 CCR6 6WWZ NK1 receptor 6HLP
TM1 39 F 1.30x30 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM1 40 S 1.31x31 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM1 41 R 1.32x32 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM1 42 A 1.33x33 CCR6 6WWZ M1 receptor 6OIJ
TM1 43 F 1.34x34 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM1 44 Q 1.35x35 CCR6 6WWZ - -
TM1 45 P 1.36x36 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM1 46 S 1.37x37 CCR6 6WWZ PAR1 3VW7
TM1 47 V 1.38x38 CCR6 6WWZ κ receptor 6B73
TM1 48 S 1.39x39 CCR6 6WWZ CB1 receptor 5XRA
TM1 49 L 1.40x40 CCR6 6WWZ NTS1 receptor 4XES
TM1 50 T 1.41x41 CCR6 6WWZ CB1 receptor 6N4B
TM1 51 V 1.42x42 CCR6 6WWZ US28 5WB1
TM1 52 A 1.43x43 CCR6 6WWZ A2A receptor 4UHR
TM1 53 A 1.44x44 CCR6 6WWZ δ receptor 6PT2
TM1 54 L 1.45x45 CCR6 6WWZ FPR2/ALX 6LW5
TM1 55 G 1.46x46 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM1 56 L 1.47x47 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM1 57 A 1.48x48 CCR6 6WWZ GPR52 6LI3
TM1 58 G 1.49x49 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM1 59 N 1.50x50 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM1 60 G 1.51x51 CCR6 6WWZ FPR2/ALX 6LW5
TM1 61 L 1.52x52 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM1 62 V 1.53x53 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM1 63 L 1.54x54 CCR6 6WWZ M1 receptor 6OIJ
TM1 64 A 1.55x55 CCR6 6WWZ 5-HT1B receptor 6G79
TM1 65 T 1.56x56 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM1 66 H 1.57x57 CCR6 6WWZ - -
TM1 67 L 1.58x58 CCR6 6WWZ α2B-adrenoceptor 6K41
TM1 68 A 1.59x59 CCR6 6WWZ NK1 receptor 6HLP
TM1 69 A 1.60x60 CCR6 6WWZ GPR52 6LI3
ICL1 70 R 12.48x48 CCR6 6WWZ α2B-adrenoceptor 6K41
ICL1 71 R 12.49x49 CCR6 6WWZ apelin receptor 5VBL
ICL1 72 A 12.50x50 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
ICL1 73 A 12.51x51 CCR6 6WWZ - -
TM2 74 R 2.36x36 PAF receptor 5ZKQ CB2 receptor 6PT0
TM2 75 S 2.37x37 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM2 76 P 2.38x38 CCR6 6WWZ Rhodopsin 4ZWJ
TM2 77 T 2.39x39 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM2 78 S 2.40x40 CCR6 6WWZ AT1 receptor 6OS2
TM2 79 A 2.41x41 CCR6 6WWZ - -
TM2 80 H 2.42x42 CCR6 6WWZ NTS1 receptor 4XES
TM2 81 L 2.43x43 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM2 82 L 2.44x44 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM2 83 Q 2.45x45 CCR6 6WWZ - -
TM2 84 L 2.46x46 CCR6 6WWZ US28 5WB1
TM2 85 A 2.47x47 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM2 86 L 2.48x48 CCR6 6WWZ AT1 receptor 6OS2
TM2 87 A 2.49x49 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM2 88 D 2.50x50 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM2 89 L 2.51x51 CCR6 6WWZ US28 5WB1
TM2 90 L 2.52x52 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM2 91 L 2.53x53 CCR6 6WWZ AT2 receptor 6JOD
TM2 92 A 2.54x54 CCR6 6WWZ D2 receptor 6VMS
TM2 93 L 2.55x55 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM2 94 T 2.56x56 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM2 95 L 2.57x57 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM2 96 P 2.58x58 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM2 97 F 2.59x59 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM2 98 A 2.60x60 CCR6 6WWZ 5-HT2B receptor 5TUD
TM2 99 A 2.61x61 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM2 100 A 2.62x62 CCR6 6WWZ δ receptor 6PT2
TM2 101 G 2.63x63 CCR6 6WWZ - -
TM2 102 A 2.64x64 CCR6 6WWZ CCR7 6QZH
TM2 103 L 2.65x65 CCR6 6WWZ US28 5WB1
TM2 104 Q 2.66x66 CCR6 6WWZ C5a1 receptor 5O9H
ECL1 105 G 23.49x49 - - - -
ECL1 106 W 23.50x50 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
ECL1 107 S 23.51x51 CCR7 6QZH BLT1 receptor 5X33
ECL1 108 L 23.52x52 - - - -
TM3 109 G 3.21x21 CCR6 6WWZ AT1 receptor 6OS2
TM3 110 S 3.22x22 CCR6 6WWZ US28 5WB1
TM3 111 A 3.23x23 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM3 112 T 3.24x24 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM3 113 C 3.25x25 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM3 114 R 3.26x26 CCR6 6WWZ NTS1 receptor 4XES
TM3 115 T 3.27x27 CCR6 6WWZ NOP receptor 5DHG
TM3 116 I 3.28x28 CCR6 6WWZ FPR2/ALX 6LW5
TM3 117 S 3.29x29 CCR6 6WWZ AT1 receptor 6OS2
TM3 118 G 3.30x30 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM3 119 L 3.31x31 CCR6 6WWZ M1 receptor 6OIJ
TM3 120 Y 3.32x32 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM3 121 S 3.33x33 CCR6 6WWZ AT1 receptor 6OS2
TM3 122 A 3.34x34 CCR6 6WWZ NTS1 receptor 4XES
TM3 123 S 3.35x35 CCR6 6WWZ δ receptor 6PT2
TM3 124 F 3.36x36 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM3 125 H 3.37x37 CCR6 6WWZ - -
TM3 126 A 3.38x38 CCR6 6WWZ US28 5WB1
TM3 127 G 3.39x39 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM3 128 F 3.40x40 CCR6 6WWZ - -
TM3 129 L 3.41x41 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM3 130 F 3.42x42 CCR6 6WWZ US28 5WB1
TM3 131 L 3.43x43 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM3 132 A 3.44x44 CCR6 6WWZ NTS1 receptor 4XES
TM3 133 C 3.45x45 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM3 134 I 3.46x46 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM3 135 S 3.47x47 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM3 136 A 3.48x48 CCR6 6WWZ C5a1 receptor 5O9H
TM3 137 D 3.49x49 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM3 138 R 3.50x50 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM3 139 Y 3.51x51 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM3 140 V 3.52x52 CCR6 6WWZ 5-HT2C receptor 6BQG
TM3 141 A 3.53x53 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM3 142 I 3.54x54 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM3 143 A 3.55x55 CCR6 6WWZ D2 receptor 6VMS
TM3 144 R 3.56x56 CCR9 5LWE M1 receptor 6OIJ
ICL2 145 A - - - -
ICL2 146 L - - - -
ICL2 147 P - - - -
ICL2 148 A - - - -
ICL2 149 G - - - -
ICL2 150 P - - - -
ICL2 151 R - - - -
ICL2 152 P - - - -
ICL2 153 S - - - -
TM4 154 T 4.38x38 CCR7 6QZH AT1 receptor 4YAY
TM4 155 P 4.39x39 CCR6 6WWZ δ receptor 6PT2
TM4 156 G 4.40x40 CCR6 6WWZ CB2 receptor 6PT0
TM4 157 R 4.41x41 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM4 158 A 4.42x42 CCR6 6WWZ US28 5WB1
TM4 159 H 4.43x43 CCR6 6WWZ DP2 receptor 6D27
TM4 160 L 4.44x44 CCR6 6WWZ US28 5WB1
TM4 161 V 4.45x45 CCR6 6WWZ μ receptor 5C1M
TM4 162 S 4.46x46 CCR6 6WWZ US28 5WB1
TM4 163 V 4.47x47 CCR6 6WWZ μ receptor 5C1M
TM4 164 I 4.48x48 CCR6 6WWZ AT1 receptor 6OS2
TM4 165 V 4.49x49 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM4 166 W 4.50x50 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM4 167 L 4.51x51 CCR6 6WWZ AT1 receptor 6OS2
TM4 168 L 4.52x52 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM4 169 S 4.53x53 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM4 170 L 4.54x54 CCR6 6WWZ FPR2/ALX 6LW5
TM4 171 L 4.55x55 CCR6 6WWZ AT1 receptor 6OS2
TM4 172 L 4.56x56 CCR6 6WWZ FPR2/ALX 6LW5
TM4 173 A 4.57x57 CCR7 6QZH US28 5WB1
TM4 174 L 4.58x59 CCR7 6QZH AT1 receptor 6OS2
TM4 175 P 4.59x60 CCR6 6WWZ US28 5WB1
TM4 176 A 4.60x61 CCR6 6WWZ AT1 receptor 6OS2
TM4 177 L 4.61x62 CCR6 6WWZ M1 receptor 6OIJ
TM4 178 L 4.62x63 CCR6 6WWZ κ receptor 6B73
TM4 179 F 4.63x64 CCR6 6WWZ - -
TM4 180 S 4.64x65 CCR5 5UIW NK1 receptor 6HLP
ECL2 181 Q CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
ECL2 182 D CCR6 6WWZ - -
ECL2 183 G CCR6 6WWZ - -
ECL2 184 Q CCR6 6WWZ - -
ECL2 185 R CCR6 6WWZ - -
ECL2 186 E CCR6 6WWZ - -
ECL2 187 G CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
ECL2 188 Q CCR6 6WWZ - -
ECL2 189 R CCR6 6WWZ - -
ECL2 190 R CCR6 6WWZ - -
ECL2 191 C 45.50x50 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
ECL2 192 R 45.51x51 CCR6 6WWZ ghrelin receptor 6KO5
ECL2 193 L 45.52x52 CCR6 6WWZ δ receptor 6PT2
ECL2 194 I - - - -
ECL2 195 F NK1 receptor 6J21 - -
ECL2 196 P NK1 receptor 6J21 NK1 receptor 6J21
ECL2 197 E NK1 receptor 6J21 - -
ECL2 198 G NK1 receptor 6J21 - -
ECL2 199 L NK1 receptor 6J21 - -
ECL2 200 T NK1 receptor 6J21 - -
ECL2 201 Q - - - -
TM5 202 T 5.33x34 CCR6 6WWZ FPR2/ALX 6LW5
TM5 203 V 5.34x35 CCR6 6WWZ - -
TM5 204 K 5.35x36 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM5 205 G 5.36x37 CCR6 6WWZ 5-HT2B receptor 5TUD
TM5 206 A 5.37x38 CCR6 6WWZ FPR2/ALX 6LW5
TM5 207 S 5.38x39 CCR6 6WWZ - -
TM5 208 A 5.39x40 CCR6 6WWZ AT2 receptor 6JOD
TM5 209 V 5.40x41 CCR6 6WWZ US28 5WB1
TM5 210 A 5.41x42 CCR6 6WWZ β2-adrenoceptor 3SN6
TM5 211 Q 5.42x43 CCR6 6WWZ CCR7 6QZH
TM5 212 V 5.43x44 CCR6 6WWZ CCR5 5UIW
TM5 213 A 5.44x45 CCR6 6WWZ - -
TM5 214 L 5.45x46 CCR6 6WWZ AT1 receptor 6OS2
TM5 215 G 5.46x461 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM5 216 F 5.47x47 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM5 217 A 5.48x48 CCR6 6WWZ CB2 receptor 6PT0
TM5 218 L 5.49x49 CCR6 6WWZ FPR2/ALX 6LW5
TM5 219 P 5.50x50 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM5 220 L 5.51x51 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM5 221 G 5.52x52 CCR6 6WWZ D3 receptor 3PBL
TM5 222 V 5.53x53 CCR6 6WWZ US28 5WB1
TM5 223 M 5.54x54 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM5 224 V 5.55x55 CCR6 6WWZ β2-adrenoceptor 3SN6
TM5 225 A 5.56x56 CCR6 6WWZ 5-HT1B receptor 6G79
TM5 226 C 5.57x57 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM5 227 Y 5.58x58 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM5 228 A 5.59x59 CCR6 6WWZ BLT1 receptor 5X33
TM5 229 L 5.60x60 CCR6 6WWZ AT1 receptor 6OS2
TM5 230 L 5.61x61 CCR6 6WWZ Rhodopsin 4ZWJ
TM5 231 G 5.62x62 CCR6 6WWZ NK1 receptor 6HLP
TM5 232 R 5.63x63 CCR6 6WWZ US28 5WB1
TM5 233 T 5.64x64 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM5 234 L 5.65x65 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM5 235 L 5.66x66 CCR6 6WWZ AT2 receptor 6JOD
TM5 236 A 5.67x67 CCR6 6WWZ BLT1 receptor 5X33
TM5 237 A 5.68x68 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
ICL3 238 R CCR6 6WWZ - -
ICL3 239 G CCR6 6WWZ - -
ICL3 240 P CCR6 6WWZ - -
ICL3 241 E CCR6 6WWZ - -
TM6 242 R 6.30x30 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM6 243 R 6.31x31 CCR6 6WWZ δ receptor 6PT2
TM6 244 R 6.32x32 CCR6 6WWZ US28 5WB1
TM6 245 A 6.33x33 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM6 246 L 6.34x34 CCR6 6WWZ AT2 receptor 6JOD
TM6 247 R 6.35x35 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM6 248 V 6.36x36 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM6 249 V 6.37x37 CCR6 6WWZ δ receptor 6PT2
TM6 250 V 6.38x38 CCR6 6WWZ CB1 receptor 6N4B
TM6 251 A 6.39x39 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM6 252 L 6.40x40 CCR6 6WWZ CXCR4 3ODU
TM6 253 V 6.41x41 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM6 254 A 6.42x42 CCR6 6WWZ κ receptor 6B73
TM6 255 A 6.43x43 CCR6 6WWZ δ receptor 6PT2
TM6 256 F 6.44x44 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM6 257 V 6.45x45 CCR6 6WWZ δ receptor 6PT2
TM6 258 V 6.46x46 CCR6 6WWZ δ receptor 6PT2
TM6 259 L 6.47x47 CCR6 6WWZ GPR52 6LI3
TM6 260 Q 6.48x48 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM6 261 L 6.49x49 CCR6 6WWZ US28 5WB1
TM6 262 P 6.50x50 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM6 263 Y 6.51x51 CCR6 6WWZ US28 5WB1
TM6 264 S 6.52x52 CCR6 6WWZ OX2 receptor 5WS3
TM6 265 L 6.53x53 CCR6 6WWZ US28 5WB1
TM6 266 A 6.54x54 CCR6 6WWZ ETB receptor 5X93
TM6 267 L 6.55x55 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM6 268 L 6.56x56 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM6 269 L 6.57x57 CCR6 6WWZ AT1 receptor 6OS2
TM6 270 D 6.58x58 CCR6 6WWZ US28 5WB1
TM6 271 T 6.59x59 CCR6 6WWZ US28 5WB1
TM6 272 A 6.60x60 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM6 273 D 6.61x61 CCR9 5LWE CCR9 5LWE
TM6 274 L 6.62x62 CCR9 5LWE US28 5WB1
TM6 275 L 6.63x63 CCR9 5LWE US28 5WB1
TM6 276 A 6.64x64 CCR9 5LWE CCR9 5LWE
TM6 277 A 6.65x65 CCR9 5LWE - -
ECL3 278 R - - - -
ECL3 279 E CCR9 5LWE - -
ECL3 280 R - - - -
TM7 281 S 7.24x23 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM7 282 C 7.25x24 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM7 283 P 7.26x25 CCR6 6WWZ C5a1 receptor 5O9H
TM7 284 A 7.27x26 CCR6 6WWZ LPA6 receptor 5XSZ
TM7 285 S 7.28x27 CCR6 6WWZ CCR7 6QZH
TM7 286 K 7.29x28 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM7 287 R 7.30x29 CCR6 6WWZ CCR5 5UIW
TM7 288 K 7.31x30 CCR6 6WWZ - -
TM7 289 D 7.32x31 CCR6 6WWZ AT1 receptor 6OS2
TM7 290 V 7.33x32 CCR6 6WWZ μ receptor 5C1M
TM7 291 A 7.34x33 CCR6 6WWZ US28 5WB1
TM7 292 L 7.35x34 CCR6 6WWZ US28 5WB1
TM7 293 L 7.36x35 CCR6 6WWZ EP3 receptor 6M9T
TM7 294 V 7.37x36 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM7 295 T 7.38x37 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM7 296 S 7.39x38 CCR6 6WWZ FPR2/ALX 6LW5
TM7 297 G 7.40x39 CCR6 6WWZ P2Y1 receptor 4XNW
TM7 298 L 7.41x40 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM7 299 A 7.42x41 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM7 300 L 7.43x42 CCR6 6WWZ CB1 receptor 5XRA
TM7 301 A 7.44x43 CCR6 6WWZ NTS1 receptor 4XES
TM7 302 R 7.45x45 CCR6 6WWZ CCR7 6QZH
TM7 303 C 7.46x46 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM7 304 G 7.47x47 CCR6 6WWZ β2-adrenoceptor 3SN6
TM7 305 L 7.48x48 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM7 306 N 7.49x49 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM7 307 P 7.50x50 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM7 308 V 7.51x51 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM7 309 L 7.52x52 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM7 310 Y 7.53x53 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM7 311 A 7.54x54 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM7 312 F 7.55x55 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM7 313 L 7.56x56 CCR6 6WWZ AT1 receptor 6OS2
H8 314 G 8.47x47 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
H8 315 L 8.48x48 CCR6 6WWZ - -
H8 316 R 8.49x49 CCR6 6WWZ AT2 receptor 6JOD
H8 317 F 8.50x50 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
H8 318 R 8.51x51 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
H8 319 Q 8.52x52 CCR6 6WWZ US28 5WB1
H8 320 D 8.53x53 CCR6 6WWZ CCR7 6QZH
H8 321 L 8.54x54 CCR6 6WWZ US28 5WB1
H8 322 R 8.55x55 CCR6 6WWZ AT2 receptor 6JOD
H8 323 R 8.56x56 CCR6 6WWZ 5-HT2B receptor 5TUD
H8 324 L 8.57x57 CCR6 6WWZ US28 5WB1
H8 325 L 8.58x58 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
H8 326 R 8.59x59 CCR6 6WWZ AT2 receptor 6JOD
C-term 327 G CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
C-term 328 G - - - -
C-term 329 S - - - -
C-term 330 C - - - -
C-term 331 P - - - -