CRF2 receptor homology model

PROTEIN CLASS

Class B1 (Secretin)

RECEPTOR

CRF2 receptor

SPECIES

Homo sapiens

STATE

Inactive

VERSION

2021-04-08

MODEL

PDB file contains GPCRdb generic numbers in the B-factor field of CA atoms

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MAIN TEMPLATE

CRF1 receptor (sequence similarity: 67%) PDB: 4K5Y
Align

TEMPLATES

4K5Y (CRF1 receptor)
6PB1 (CRF2 receptor)
4L6R (glucagon receptor)
None
Main template (%) Additional templates (%) No template - freely modelled (%)
Backbone 75.3 12.0 12.7
Side-chains 55.2 28.4 16.4

Number of backbone templates: 3
Number of rotamer templates: 9

Segment Seq.num. AA GPCRdb# Backbone PDB Rotamer PDB
N-term 95 Y - - - - -
N-term 96 S - - - - -
N-term 97 Q - - - - -
N-term 98 C - - - - -
N-term 99 E - - - - -
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TM1 105 K 1.28x28 - - - -
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ECL1 177 H - - - - -
ECL1 178 E - - - - -
ECL1 179 S - - - - -
ECL1 180 N - - - - -
TM3 181 E 3.26x26 CRF1 receptor 4K5Y - -
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TM3 211 T 3.56x56 CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
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TM3 213 I 3.58x58 CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
TM3 214 V 3.59x59 CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
TM3 215 M 3.60x60 CRF1 receptor 4K5Y - -
ICL2 216 T - - - - -
ICL2 217 Y - CRF2 receptor 6PB1 CRF2 receptor 6PB1
ICL2 218 S - CRF2 receptor 6PB1 CRF2 receptor 6PB1
ICL2 219 T - CRF2 receptor 6PB1 CRF2 receptor 6PB1
ICL2 220 E - CRF2 receptor 6PB1 CRF2 receptor 6PB1
ICL2 221 R - CRF2 receptor 6PB1 CRF2 receptor 6PB1
ICL2 222 L - - - - -
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TM4 227 F 4.45x46 CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
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TM4 243 A 4.61x61 CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
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TM4 249 Y 4.67x67 CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
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ECL2 252 E - CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
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ECL2 261 G - CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
ECL2 262 D - CRF1 receptor 4K5Y - -
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TM5 270 G 5.41x41 CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
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TM5 285 N 5.56x56 CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
TM5 286 I 5.57x57 CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
TM5 287 V 5.58x58 CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
TM5 288 R 5.59x59 CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
TM5 289 I 5.60x60 CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
TM5 290 L 5.61x61 CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
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TM5 294 L 5.65x65 CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
TM5 295 R 5.66x66 CRF2 receptor 6PB1 CRF2 receptor 6PB1
TM5 296 A 5.67x67 CRF2 receptor 6PB1 CRF2 receptor 6PB1
ICL3 297 S - - - - -
ICL3 298 T - CRF2 receptor 6PB1 CRF2 receptor 6PB1
ICL3 299 T - - - - -
TM6 300 S 6.30x30 CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
TM6 301 E 6.31x31 CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
TM6 302 T 6.32x32 CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
TM6 303 I 6.33x33 CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
TM6 304 Q 6.34x34 CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
TM6 305 Y 6.35x35 CRF1 receptor 4K5Y calcitonin receptor-like receptor 7KNU
TM6 306 R 6.36x36 CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
TM6 307 K 6.37x37 CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
TM6 308 A 6.38x38 CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
TM6 309 V 6.39x39 CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
TM6 310 K 6.40x40 CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
TM6 311 A 6.41x41 CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
TM6 312 T 6.42x42 CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
TM6 313 L 6.43x43 CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
TM6 314 V 6.44x44 CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
TM6 315 L 6.45x45 CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
TM6 316 L 6.46x46 CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
TM6 317 P 6.47x47 CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
TM6 318 L 6.48x48 CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
TM6 319 L 6.49x49 CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
TM6 320 G 6.50x50 CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
TM6 321 I 6.51x51 CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
TM6 322 T 6.52x52 CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
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TM6 324 M 6.54x54 CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
TM6 325 L 6.55x55 CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
TM6 326 F 6.56x56 CRF1 receptor 4K5Y glucagon receptor 5YQZ
TM6 327 F 6.57x57 CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
TM6 328 V 6.58x58 CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
ECL3 329 N - CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
ECL3 330 P - CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
ECL3 331 G - CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
ECL3 332 E - CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
ECL3 333 D - CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
TM7 334 D 7.32x31 CRF1 receptor 4K5Y - -
TM7 335 L 7.33x32 CRF1 receptor 4K5Y CRF2 receptor 6PB1
TM7 336 S 7.34x33 CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
TM7 337 Q 7.35x34 CRF1 receptor 4K5Y CRF2 receptor 6PB1
TM7 338 I 7.36x35 CRF1 receptor 4K5Y CRF2 receptor 6PB1
TM7 339 M 7.37x36 CRF1 receptor 4K5Y CRF2 receptor 6PB1
TM7 340 F 7.38x37 CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
TM7 341 I 7.39x38 CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
TM7 342 Y 7.40x39 CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
TM7 343 F 7.41x40 CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
TM7 344 N 7.42x41 CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
TM7 345 S 7.43x42 CRF1 receptor 4K5Y CRF2 receptor 6PB1
TM7 346 F 7.44x43 CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
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TM7 348 Q 7.46x45 CRF1 receptor 4K5Y CRF2 receptor 6PB1
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TM7 355 V 7.53x53 CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
TM7 356 S 7.54x54 CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
TM7 357 V 7.55x55 CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
TM7 358 F 7.56x56 CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
TM7 359 Y 7.57x57 CRF1 receptor 4K5Y glucagon receptor 5YQZ
TM7 360 C 7.58x58 CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
TM7 361 F 7.59x59 CRF1 receptor 4K5Y CRF1 receptor 4K5Y
TM7 362 F 7.60x60 CRF1 receptor 4K5Y calcitonin receptor-like receptor 7KNU
H8 363 N 8.47x47 CRF2 receptor 6PB1 CRF2 receptor 6PB1
H8 364 G 8.48x48 CRF2 receptor 6PB1 CRF2 receptor 6PB1
H8 365 E 8.49x49 CRF2 receptor 6PB1 CRF2 receptor 6PB1
H8 366 V 8.50x50 CRF2 receptor 6PB1 CRF2 receptor 6PB1
H8 367 R 8.51x51 CRF2 receptor 6PB1 CRF2 receptor 6PB1
H8 368 S 8.52x52 CRF2 receptor 6PB1 CRF2 receptor 6PB1
H8 369 A 8.53x53 CRF2 receptor 6PB1 CRF2 receptor 6PB1
H8 370 V 8.54x54 CRF2 receptor 6PB1 CRF2 receptor 6PB1
H8 371 R 8.55x55 CRF2 receptor 6PB1 CRF2 receptor 6PB1
H8 372 K 8.56x56 CRF2 receptor 6PB1 CRF2 receptor 6PB1
H8 373 R 8.57x57 CRF2 receptor 6PB1 CRF2 receptor 6PB1
H8 374 W 8.58x58 CRF2 receptor 6PB1 CRF2 receptor 6PB1
H8 375 H 8.59x59 CRF2 receptor 6PB1 CRF2 receptor 6PB1
H8 376 R 8.60x60 CRF2 receptor 6PB1 CRF2 receptor 6PB1
H8 377 W 8.61x61 CRF2 receptor 6PB1 CRF2 receptor 6PB1
H8 378 Q 8.62x62 CRF2 receptor 6PB1 CRF2 receptor 6PB1
H8 379 D 8.63x63 CRF2 receptor 6PB1 CRF2 receptor 6PB1
H8 380 H 8.64x64 CRF2 receptor 6PB1 CRF2 receptor 6PB1
H8 381 H 8.65x65 CRF2 receptor 6PB1 CRF2 receptor 6PB1
H8 382 S 8.66x66 CRF2 receptor 6PB1 CRF2 receptor 6PB1
H8 383 L 8.67x67 glucagon receptor 4L6R glucagon receptor 4L6R
H8 384 R 8.68x68 glucagon receptor 4L6R CT receptor 5UZ7
H8 385 V 8.69x69 glucagon receptor 4L6R - -
H8 386 P 8.70x70 glucagon receptor 4L6R - -
H8 387 M 8.71x71 glucagon receptor 4L6R - -
H8 388 A 8.72x72 glucagon receptor 4L6R - -
C-term 389 R - - - - -
C-term 390 A - - - - -
C-term 391 M - - - - -
C-term 392 S - - - - -
C-term 393 I - - - - -