FPR1 homology model

PROTEIN CLASS

Class A (Rhodopsin)

RECEPTOR

FPR1

SPECIES

Homo sapiens

STATE

Inactive

VERSION

2022-06-19

MODEL

PDB file contains GPCRdb generic numbers in the B-factor field of CA atoms

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MAIN TEMPLATE

DP2 receptor (sequence similarity: 42%) PDB: 7M8W
Align

TEMPLATES

7WVX (FPR2/ALX)
7M8W (DP2 receptor)
7WVU (FPR1)
7T6T (FPR1)
None
Main template (%) Additional templates (%) No template - freely modelled (%)
Backbone 82.1 12.3 5.5
Side-chains 28.2 63.3 8.4

Number of backbone templates: 4
Number of rotamer templates: 6

Segment Seq.num. AA GPCRdb# Backbone PDB Rotamer PDB
N-term 14 G - - - - -
N-term 15 T - - - - -
N-term 16 P - - - - -
N-term 17 A - - - - -
N-term 18 V - - - - -
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ECL2 184 T - FPR1 7T6T FPR1 7T6T
ECL2 185 N - - - - -
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TM5 231 Q 5.68x68 DP2 receptor 7M8W FPR1 7WVU
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ICL3 235 K - FPR1 7T6T FPR1 7T6T
ICL3 236 S - - - - -
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TM6 238 R 6.32x32 FPR1 7WVU FPR1 7WVU
TM6 239 P 6.33x33 DP2 receptor 7M8W FPR1 7WVU
TM6 240 L 6.34x34 DP2 receptor 7M8W FPR1 7WVU
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TM6 245 F 6.39x39 DP2 receptor 7M8W FPR1 7WVU
TM6 246 V 6.40x40 DP2 receptor 7M8W DP2 receptor 7M8W
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TM6 250 F 6.44x44 DP2 receptor 7M8W DP2 receptor 7M8W
TM6 251 F 6.45x45 DP2 receptor 7M8W FPR1 7WVU
TM6 252 L 6.46x46 DP2 receptor 7M8W DP2 receptor 7M8W
TM6 253 C 6.47x47 DP2 receptor 7M8W DP2 receptor 7M8W
TM6 254 W 6.48x48 DP2 receptor 7M8W DP2 receptor 7M8W
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ECL3 268 I - - - - -
ECL3 269 R - FPR1 7WVU FPR1 7WVU
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ECL3 271 L - FPR1 7WVU FPR1 7WVU
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ECL3 274 G - FPR1 7WVU FPR1 7WVU
ECL3 275 M - - - - -
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TM7 279 I 7.31x30 DP2 receptor 7M8W FPR1 7WVU
TM7 280 G 7.32x31 DP2 receptor 7M8W FPR1 7WVU
TM7 281 I 7.33x32 DP2 receptor 7M8W FPR1 7WVU
TM7 282 A 7.34x33 DP2 receptor 7M8W FPR1 7WVU
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C-term 317 P - DP2 receptor 7M8W DP2 receptor 7M8W
C-term 318 A - DP2 receptor 7M8W DP2 receptor 7M8W
C-term 319 S - DP2 receptor 7M8W DP2 receptor 7M8W
C-term 320 L - DP2 receptor 7M8W DP2 receptor 7M8W
C-term 321 E - DP2 receptor 7M8W DP2 receptor 7M8W