FZD2 homology model

PROTEIN CLASS

Class F (Frizzled)

RECEPTOR

SPECIES

Homo sapiens

STATE

Active

VERSION

2020-10-08

MODEL

PDB file contains GPCRdb generic numbers in the B-factor field of CA atoms

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MAIN TEMPLATE

SMO (sequence similarity: 45%) PDB: 6XBM

TEMPLATES

6XBM (SMO)
4JKV (SMO)
6BD4 (FZD4)
None
Main template (%) Additional templates (%) No template - freely modelled (%)
Backbone 71.8 17.9 10.3
Side-chains 24.2 33.9 41.8

Number of backbone templates: 3
Number of rotamer templates: 4

Segment Seq.num. AA GPCRdb# Backbone PDB Rotamer PDB
N-term 232 G SMO 6XBM SMO 6XBM
N-term 233 S SMO 6XBM SMO 6XBM
N-term 234 M SMO 6XBM SMO 6XBM
N-term 235 F SMO 6XBM SMO 6XBM
N-term 236 F SMO 6XBM SMO 6XBM
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TM6 485 A 6.56x56 SMO 6XBM - -
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TM6 494 W 6.65x65 SMO 6XBM - -
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TM6 496 S 6.67x67 SMO 6XBM - -
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TM6 498 H 6.69x69 SMO 6XBM - -
TM6 499 C 6.70x70 SMO 6XBM - -
TM6 500 K 6.71x71 SMO 6XBM - -
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TM6 503 A 6.74x74 SMO 6XBM - -
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ECL3 505 P - - - -
ECL3 506 C - - - -
ECL3 507 P - - - -
ECL3 508 A - - - -
ECL3 509 H - - - -
ECL3 510 Y - - - -
ECL3 511 T - - - -
ECL3 512 P - - - -
ECL3 513 R - - - -
ECL3 514 M - - - -
ECL3 515 S - - - -
ECL3 516 P - - - -
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TM7 521 Y 7.38x38 SMO 6XBM - -
TM7 522 M 7.39x39 SMO 6XBM FZD4 6BD4
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H8 541 S 8.47x47 FZD4 6BD4 FZD4 6BD4
H8 542 G 8.48x48 FZD4 6BD4 - -
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H8 549 R 8.55x55 FZD4 6BD4 SMO 6O3C
H8 550 K 8.56x56 FZD4 6BD4 - -
H8 551 F 8.57x57 FZD4 6BD4 FZD4 6BD4
H8 552 Y 8.58x58 FZD4 6BD4 FZD4 6BD4
H8 553 T 8.59x59 FZD4 6BD4 - -
H8 554 R 8.60x60 FZD4 6BD4 FZD4 6BD4
H8 555 L 8.61x61 FZD4 6BD4 FZD4 6BD4
H8 556 T 8.62x62 FZD4 6BD4 FZD4 6BD4
C-term 557 N - - - -
C-term 558 S - - - -
C-term 559 R - - - -
C-term 560 H - - - -
C-term 561 G - - - -