FZD5 homology model

PROTEIN CLASS

Class F (Frizzled)

RECEPTOR

SPECIES

Homo sapiens

STATE

Active

VERSION

2021-01-08

MODEL

PDB file contains GPCRdb generic numbers in the B-factor field of CA atoms

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MAIN TEMPLATE

SMO (sequence similarity: 42%) PDB: 6D32

TEMPLATES

6D32 (SMO)
6BD4 (FZD4)
6WW2 (FZD5)
4JKV (SMO)
None
Main template (%) Additional templates (%) No template - freely modelled (%)
Backbone 72.9 15.0 12.1
Side-chains 25.2 56.4 18.4

Number of backbone templates: 4
Number of rotamer templates: 6

Segment Seq.num. AA GPCRdb# Backbone PDB Rotamer PDB
N-term 223 Y SMO 6D32 SMO 6D32
N-term 224 Q SMO 6D32 SMO 6D32
N-term 225 P SMO 6D32 SMO 6D32
N-term 226 S SMO 6D32 SMO 6D32
N-term 227 F SMO 6D32 SMO 6D32
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TM7 517 S 7.52x52 SMO 6D32 FZD5 6WW2
TM7 518 G 7.53x53 SMO 6D32 FZD5 6WW2
TM7 519 V 7.54x54 SMO 6D32 FZD5 6WW2
TM7 520 W 7.55x55 SMO 6D32 SMO 6D32
TM7 521 I 7.56x56 SMO 6D32 FZD5 6WW2
TM7 522 W 7.57x57 SMO 6D32 SMO 6D32
H8 523 S 8.47x47 SMO 6D32 FZD5 6WW2
H8 524 G 8.48x48 SMO 6D32 FZD5 6WW2
H8 525 K 8.49x49 SMO 6D32 FZD5 6WW2
H8 526 T 8.50x50 SMO 6D32 SMO 6D32
H8 527 V 8.51x51 SMO 6D32 FZD5 6WW2
H8 528 E 8.52x52 SMO 6D32 FZD5 6WW2
H8 529 S 8.53x53 SMO 6D32 FZD5 6WW2
H8 530 W 8.54x54 SMO 6D32 SMO 6D32
H8 531 R 8.55x55 SMO 6D32 SMO 6O3C
H8 532 R 8.56x56 SMO 6D32 SMO 6D32
H8 533 F 8.57x57 FZD4 6BD4 FZD4 6BD4
H8 534 T 8.58x58 FZD4 6BD4 FZD5 6WW2
H8 535 S 8.59x59 FZD4 6BD4 FZD5 6WW2
H8 536 R 8.60x60 FZD4 6BD4 FZD4 6BD4
H8 537 C 8.61x61 FZD4 6BD4 - -
H8 538 C 8.62x62 FZD4 6BD4 - -
C-term 539 C - - - -
C-term 540 R - - - -
C-term 541 P - - - -
C-term 542 R - - - -
C-term 543 R - - - -