FZD6 homology model

PROTEIN CLASS

Class F (Frizzled)

RECEPTOR

SPECIES

Homo sapiens

STATE

Active

VERSION

2020-10-08

MODEL

PDB file contains GPCRdb generic numbers in the B-factor field of CA atoms

NGL is a WebGL based 3D viewer powered by MMTF.

MAIN TEMPLATE

SMO (sequence similarity: 42%) PDB: 6XBM

TEMPLATES

6XBM (SMO)
4JKV (SMO)
6BD4 (FZD4)
None
Main template (%) Additional templates (%) No template - freely modelled (%)
Backbone 71.6 11.8 16.6
Side-chains 23.6 21.5 55.0

Number of backbone templates: 3
Number of rotamer templates: 5

Segment Seq.num. AA GPCRdb# Backbone PDB Rotamer PDB
N-term 186 P SMO 6XBM SMO 6XBM
N-term 187 N SMO 6XBM SMO 6XBM
N-term 188 M SMO 6XBM SMO 6XBM
N-term 189 Y SMO 6XBM SMO 6XBM
N-term 190 F SMO 6XBM SMO 6XBM
TM1 191 K 1.25x25 SMO 6XBM - -
TM1 192 S 1.26x26 SMO 6XBM - -
TM1 193 D 1.27x27 SMO 6XBM - -
TM1 194 E 1.28x28 SMO 6XBM SMO 6XBM
TM1 195 L 1.29x29 SMO 6XBM - -
TM1 196 E 1.30x30 SMO 6XBM FZD4 6BD4
TM1 197 F 1.31x31 SMO 6XBM FZD4 6BD4
TM1 198 A 1.32x32 SMO 6XBM - -
TM1 199 K 1.33x33 SMO 6XBM - -
TM1 200 S 1.34x34 SMO 6XBM SMO 6XBM
TM1 201 F 1.35x35 SMO 6XBM - -
TM1 202 I 1.36x36 SMO 6XBM SMO 6XBM
TM1 203 G 1.37x37 SMO 6XBM - -
TM1 204 T 1.38x38 SMO 6XBM - -
TM1 205 V 1.39x39 SMO 6XBM - -
TM1 206 S 1.40x40 SMO 6XBM SMO 6D32
TM1 207 I 1.41x41 SMO 6XBM - -
TM1 208 F 1.42x42 SMO 6XBM - -
TM1 209 C 1.43x43 SMO 6XBM FZD4 6BD4
TM1 210 L 1.44x44 SMO 6XBM - -
TM1 211 C 1.45x45 SMO 6XBM - -
TM1 212 A 1.46x46 SMO 6XBM - -
TM1 213 T 1.47x47 SMO 6XBM SMO 6XBM
TM1 214 L 1.48x48 SMO 6XBM SMO 6XBM
TM1 215 F 1.49x49 SMO 6XBM SMO 6XBM
TM1 216 T 1.50x50 SMO 6XBM SMO 6XBM
TM1 217 F 1.51x51 SMO 6XBM - -
TM1 218 L 1.52x52 SMO 6XBM FZD4 6BD4
TM1 219 T 1.53x53 SMO 6XBM SMO 6XBM
TM1 220 F 1.54x54 SMO 6XBM SMO 6XBM
TM1 221 L 1.55x55 SMO 6XBM FZD4 6BD4
TM1 222 I 1.56x56 SMO 6XBM FZD4 6BD4
TM1 223 D 1.57x57 SMO 6XBM SMO 6XBM
ICL1 224 V 12.47x47 - - - -
ICL1 225 R 12.48x48 FZD4 6BD4 SMO 6XBM
ICL1 226 R 12.49x49 FZD4 6BD4 FZD4 6BD4
ICL1 227 F 12.50x50 FZD4 6BD4 FZD4 6BD4
ICL1 228 R 12.51x51 - - - -
TM2 229 Y 2.39x39 SMO 6XBM SMO 6XBM
TM2 230 P 2.40x40 SMO 6XBM SMO 6XBM
TM2 231 E 2.41x41 SMO 6XBM FZD4 6BD4
TM2 232 R 2.42x42 SMO 6XBM FZD4 6BD4
TM2 233 P 2.43x43 SMO 6XBM FZD4 6BD4
TM2 234 I 2.44x44 SMO 6XBM FZD4 6BD4
TM2 235 I 2.45x45 SMO 6XBM FZD4 6BD4
TM2 236 Y 2.46x46 SMO 6XBM SMO 6XBM
TM2 237 Y 2.47x47 SMO 6XBM - -
TM2 238 S 2.48x48 SMO 6XBM FZD4 6BD4
TM2 239 V 2.49x49 SMO 6XBM - -
TM2 240 C 2.50x50 SMO 6XBM SMO 6XBM
TM2 241 Y 2.51x51 SMO 6XBM FZD4 6BD4
TM2 242 S 2.52x52 SMO 6XBM - -
TM2 243 I 2.53x53 SMO 6XBM FZD4 6BD4
TM2 244 V 2.54x54 SMO 6XBM - -
TM2 245 S 2.55x55 SMO 6XBM SMO 6XBM
TM2 246 L 2.56x56 SMO 6XBM - -
TM2 247 M 2.57x57 SMO 6XBM - -
TM2 248 Y 2.58x58 SMO 6XBM FZD4 6BD4
TM2 249 F 2.59x59 SMO 6XBM - -
TM2 250 I 2.60x60 SMO 6XBM - -
TM2 251 G 2.61x61 SMO 6XBM - -
TM2 252 F 2.62x62 SMO 6XBM SMO 6XBM
TM2 253 L 2.63x63 FZD4 6BD4 - -
TM2 254 L 2.64x64 FZD4 6BD4 - -
TM2 255 G 2.65x65 FZD4 6BD4 FZD4 6BD4
ECL1 256 D - - - -
ECL1 257 S - - - -
ECL1 258 T - - - -
ECL1 259 A - - - -
ECL1 260 C - - - -
ECL1 261 N - - - -
ECL1 262 K - - - -
ECL1 263 A - - - -
ECL1 264 D - - - -
ECL1 265 E - - - -
ECL1 266 K - - - -
ECL1 267 L - - - -
ECL1 268 E - - - -
ECL1 269 L - - - -
ECL1 270 G - - - -
ECL1 271 D - - - -
ECL1 272 T - - - -
ECL1 273 V - - - -
ECL1 274 V - - - -
ECL1 275 L - - - -
ECL1 276 G - - - -
ECL1 277 S - - - -
ECL1 278 Q - - - -
TM3 279 N 3.22x22 FZD4 6BD4 FZD4 6BD4
TM3 280 K 3.23x23 SMO 6XBM - -
TM3 281 A 3.24x24 SMO 6XBM - -
TM3 282 C 3.25x25 SMO 6XBM SMO 6XBM
TM3 283 T 3.26x26 SMO 6XBM - -
TM3 284 V 3.27x27 SMO 6XBM - -
TM3 285 L 3.28x28 SMO 6XBM - -
TM3 286 F 3.29x29 SMO 6XBM SMO 6XBM
TM3 287 M 3.30x30 SMO 6XBM - -
TM3 288 L 3.31x31 SMO 6XBM FZD4 6BD4
TM3 289 L 3.32x32 SMO 6XBM FZD4 6BD4
TM3 290 Y 3.33x33 SMO 6XBM SMO 6XBM
TM3 291 F 3.34x34 SMO 6XBM FZD4 6BD4
TM3 292 F 3.35x35 SMO 6XBM FZD4 6BD4
TM3 293 T 3.36x36 SMO 6XBM - -
TM3 294 M 3.37x37 SMO 6XBM SMO 6XBM
TM3 295 A 3.38x38 SMO 6XBM SMO 6XBM
TM3 296 G 3.39x39 SMO 6XBM SMO 6XBM
TM3 297 T 3.40x40 SMO 6XBM - -
TM3 298 V 3.41x41 SMO 6XBM SMO 6XBM
TM3 299 W 3.42x42 SMO 6XBM SMO 6XBM
TM3 300 W 3.43x43 SMO 6XBM FZD4 6BD4
TM3 301 V 3.44x44 SMO 6XBM SMO 6XBM
TM3 302 I 3.45x45 SMO 6XBM FZD4 6BD4
TM3 303 L 3.46x46 SMO 6XBM SMO 6XBM
TM3 304 T 3.47x47 SMO 6XBM SMO 6XBM
TM3 305 I 3.48x48 SMO 6XBM - -
TM3 306 T 3.49x49 SMO 6XBM FZD4 6BD4
TM3 307 W 3.50x50 SMO 6XBM SMO 6XBM
TM3 308 F 3.51x51 SMO 6XBM FZD4 6BD4
TM3 309 L 3.52x52 SMO 6XBM FZD4 6BD4
TM3 310 A 3.53x53 SMO 6XBM FZD4 6BD4
TM3 311 A 3.54x54 SMO 6XBM FZD4 6BD4
TM3 312 G 3.55x55 SMO 6XBM FZD4 6BD4
ICL2 313 R - - - -
ICL2 314 K FZD4 6BD4 FZD4 6BD4
ICL2 315 W FZD4 6BD4 FZD4 6BD4
ICL2 316 S FZD4 6BD4 - -
ICL2 317 C FZD4 6BD4 - -
ICL2 318 E FZD4 6BD4 FZD4 6BD4
ICL2 319 A FZD4 6BD4 FZD4 6BD4
ICL2 320 I FZD4 6BD4 FZD4 6BD4
ICL2 321 E FZD4 6BD4 FZD4 6BD4
ICL2 322 Q - - - -
TM4 323 K 4.41x41 SMO 6XBM SMO 6XBM
TM4 324 A 4.42x42 SMO 6XBM - -
TM4 325 V 4.43x43 SMO 6XBM - -
TM4 326 W 4.44x44 SMO 6XBM - -
TM4 327 F 4.45x45 SMO 6XBM SMO 6XBM
TM4 328 H 4.46x46 SMO 6XBM SMO 6XBM
TM4 329 A 4.47x47 SMO 6XBM - -
TM4 330 V 4.48x48 SMO 6XBM - -
TM4 331 A 4.49x49 SMO 6XBM FZD4 6BD4
TM4 332 W 4.50x50 SMO 6XBM SMO 6XBM
TM4 333 G 4.51x51 SMO 6XBM - -
TM4 334 T 4.52x52 SMO 6XBM - -
TM4 335 P 4.53x53 SMO 6XBM SMO 6XBM
TM4 336 G 4.54x54 SMO 6XBM - -
TM4 337 F 4.55x55 SMO 6XBM - -
TM4 338 L 4.56x56 SMO 6XBM SMO 6XBM
TM4 339 T 4.57x57 SMO 6XBM SMO 6XBM
TM4 340 V 4.58x58 SMO 6XBM SMO 6XBM
TM4 341 M 4.59x59 SMO 6XBM - -
TM4 342 L 4.60x60 SMO 6XBM - -
TM4 343 L 4.61x61 SMO 6XBM SMO 6XBM
TM4 344 A 4.62x62 SMO 6XBM SMO 6XBM
TM4 345 M 4.63x63 SMO 6XBM FZD4 6BD4
TM4 346 N 4.64x64 SMO 6XBM - -
ECL2 347 K SMO 6XBM - -
ECL2 348 V SMO 6XBM SMO 6XBM
ECL2 349 E SMO 6XBM - -
ECL2 350 G SMO 6XBM SMO 6XBM
ECL2 351 D SMO 6XBM SMO 6XBM
ECL2 352 N SMO 6XBM - -
ECL2 353 I SMO 6XBM - -
ECL2 354 S SMO 6XBM SMO 6XBM
ECL2 355 G SMO 6XBM SMO 6XBM
ECL2 356 V SMO 6XBM - -
ECL2 357 C 45.50x50 SMO 6XBM SMO 6XBM
ECL2 358 F 45.51x51 SMO 6XBM SMO 6XBM
ECL2 359 V 45.52x52 SMO 6XBM SMO 6XBM
ECL2 360 G SMO 6XBM SMO 6XBM
ECL2 361 L SMO 6XBM - -
ECL2 362 Y SMO 6XBM - -
TM5 363 D 5.39x40 SMO 6XBM - -
TM5 364 L 5.40x41 SMO 6XBM FZD4 6BD4
TM5 365 D 5.41x42 SMO 6XBM FZD4 6BD4
TM5 366 A 5.42x43 SMO 6XBM FZD4 6BD4
TM5 367 S 5.43x44 SMO 6XBM - -
TM5 368 R 5.44x45 SMO 6XBM - -
TM5 369 Y 5.45x46 SMO 6XBM - -
TM5 370 F 5.46x461 SMO 6XBM SMO 6XBM
TM5 371 V 5.47x47 SMO 6XBM SMO 6XBM
TM5 372 L 5.48x48 SMO 6XBM SMO 6XBM
TM5 373 L 5.49x49 SMO 6XBM - -
TM5 374 P 5.50x50 SMO 6XBM SMO 6XBM
TM5 375 L 5.51x51 SMO 6XBM FZD4 6BD4
TM5 376 C 5.52x52 SMO 6XBM - -
TM5 377 L 5.53x53 SMO 6XBM SMO 6XBM
TM5 378 C 5.54x54 SMO 6XBM - -
TM5 379 V 5.55x55 SMO 6XBM - -
TM5 380 F 5.56x56 SMO 6XBM - -
TM5 381 V 5.57x57 SMO 6XBM SMO 6XBM
TM5 382 G 5.58x58 SMO 6XBM SMO 6XBM
TM5 383 L 5.59x59 SMO 6XBM - -
TM5 384 S 5.60x60 SMO 6XBM - -
TM5 385 L 5.61x61 SMO 6XBM - -
TM5 386 L 5.62x62 SMO 6XBM SMO 6XBM
TM5 387 L 5.63x63 SMO 6XBM - -
TM5 388 A 5.64x64 SMO 6XBM FZD4 6BD4
TM5 389 G 5.65x65 SMO 6XBM SMO 6XBM
TM5 390 I 5.66x66 SMO 6XBM - -
TM5 391 I 5.67x67 SMO 6XBM - -
TM5 392 S 5.68x68 SMO 6XBM - -
TM5 393 L 5.69x69 SMO 6XBM SMO 6XBM
TM5 394 N 5.70x70 SMO 6XBM - -
TM5 395 H 5.71x71 SMO 6XBM - -
TM5 396 V 5.72x72 SMO 6XBM - -
TM5 397 R 5.73x73 SMO 4JKV FZD4 6BD4
TM5 398 Q 5.74x74 SMO 4JKV - -
TM5 399 V 5.75x75 SMO 4JKV - -
TM5 400 I 5.76x76 SMO 4JKV - -
ICL3 401 Q - - - -
ICL3 402 H - - - -
ICL3 403 D - - - -
ICL3 404 G - - - -
ICL3 405 R - - - -
ICL3 406 N - - - -
ICL3 407 Q - - - -
ICL3 408 E - - - -
ICL3 409 K - - - -
ICL3 410 L - - - -
TM6 411 K 6.27x27 SMO 6XBM - -
TM6 412 K 6.28x28 SMO 6XBM - -
TM6 413 F 6.29x29 SMO 6XBM - -
TM6 414 M 6.30x30 SMO 6XBM SMO 6XBM
TM6 415 I 6.31x31 SMO 6XBM - -
TM6 416 R 6.32x32 SMO 6XBM SMO 6XBM
TM6 417 I 6.33x33 SMO 6XBM FZD4 6BD4
TM6 418 G 6.34x34 SMO 6XBM SMO 6XBM
TM6 419 V 6.35x35 SMO 6XBM FZD4 6BD4
TM6 420 F 6.36x36 SMO 6XBM SMO 6XBM
TM6 421 S 6.37x37 SMO 6XBM FZD4 6BD4
TM6 422 G 6.38x38 SMO 6XBM - -
TM6 423 L 6.39x39 SMO 6XBM SMO 6XBM
TM6 424 Y 6.40x40 SMO 6XBM FZD4 6BD4
TM6 425 L 6.41x41 SMO 6XBM - -
TM6 426 V 6.42x42 SMO 6XBM FZD4 6BD4
TM6 427 P 6.43x43 SMO 6XBM FZD4 6BD4
TM6 428 L 6.44x44 SMO 6XBM - -
TM6 429 V 6.45x45 SMO 6XBM - -
TM6 430 T 6.46x46 SMO 6XBM - -
TM6 431 L 6.47x47 SMO 6XBM - -
TM6 432 L 6.48x48 SMO 6XBM - -
TM6 433 G 6.49x49 SMO 6XBM SMO 6D32
TM6 434 C 6.50x50 SMO 6XBM SMO 6XBM
TM6 435 Y 6.51x51 SMO 6XBM FZD4 6BD4
TM6 436 V 6.52x52 SMO 6XBM - -
TM6 437 Y 6.53x53 SMO 6XBM SMO 6XBM
TM6 438 E 6.54x54 SMO 6XBM FZD4 6BD4
TM6 439 Q 6.55x55 SMO 6XBM - -
TM6 440 V 6.56x56 SMO 6XBM - -
TM6 441 N 6.57x57 SMO 6XBM SMO 6XBM
TM6 442 R 6.58x58 SMO 6XBM - -
TM6 443 I 6.59x59 SMO 6XBM - -
TM6 444 T 6.60x60 SMO 6XBM - -
TM6 445 W 6.61x61 SMO 6XBM SMO 6XBM
TM6 446 E 6.62x62 SMO 6XBM SMO 6XBM
TM6 447 I 6.63x63 SMO 6XBM - -
TM6 448 T 6.64x64 SMO 6XBM - -
TM6 449 W 6.65x65 SMO 6XBM - -
TM6 450 V 6.66x66 SMO 6XBM - -
TM6 451 S 6.67x67 SMO 6XBM - -
TM6 452 D 6.68x68 SMO 6XBM - -
TM6 453 H 6.69x69 SMO 6XBM - -
TM6 454 C 6.70x70 SMO 6XBM - -
TM6 455 R 6.71x71 SMO 6XBM - -
TM6 456 Q 6.72x72 SMO 6XBM SMO 6XBM
TM6 457 Y 6.73x73 SMO 6XBM - -
TM6 458 H 6.74x74 SMO 6XBM - -
ECL3 459 I - - - -
ECL3 460 P - - - -
ECL3 461 C - - - -
ECL3 462 P - - - -
ECL3 463 Y - - - -
ECL3 464 Q - - - -
ECL3 465 A - - - -
ECL3 466 K - - - -
ECL3 467 A - - - -
ECL3 468 K - - - -
ECL3 469 A - - - -
ECL3 470 R - - - -
ECL3 471 P - - - -
TM7 472 E 7.34x34 FZD4 6BD4 - -
TM7 473 L 7.35x35 SMO 6XBM SMO 6XBM
TM7 474 A 7.36x36 SMO 6XBM FZD4 6BD4
TM7 475 L 7.37x37 SMO 6XBM - -
TM7 476 F 7.38x38 SMO 6XBM - -
TM7 477 M 7.39x39 SMO 6XBM FZD4 6BD4
TM7 478 I 7.40x40 SMO 6XBM SMO 6XBM
TM7 479 K 7.41x41 SMO 6XBM FZD4 6BD4
TM7 480 Y 7.42x42 SMO 6XBM - -
TM7 481 L 7.43x43 SMO 6XBM - -
TM7 482 M 7.44x44 SMO 6XBM FZD4 6BD4
TM7 483 T 7.45x45 SMO 6XBM - -
TM7 484 L 7.46x46 SMO 6XBM FZD4 6BD4
TM7 485 I 7.47x47 SMO 6XBM - -
TM7 486 V 7.48x48 SMO 6XBM FZD4 6BD4
TM7 487 G 7.49x49 SMO 6XBM SMO 6XBM
TM7 488 I 7.50x50 SMO 6XBM SMO 6XBM
TM7 489 S 7.51x51 SMO 6XBM SMO 6D32
TM7 490 A 7.52x52 SMO 6XBM - -
TM7 491 V 7.53x53 SMO 6XBM - -
TM7 492 F 7.54x54 SMO 6XBM - -
TM7 493 W 7.55x55 FZD4 6BD4 FZD4 6BD4
TM7 494 V 7.56x56 FZD4 6BD4 SMO 6O3C
TM7 495 G 7.57x57 FZD4 6BD4 - -
H8 496 S 8.47x47 FZD4 6BD4 FZD4 6BD4
H8 497 K 8.48x48 FZD4 6BD4 SMO 5L7D
H8 498 K 8.49x49 FZD4 6BD4 FZD4 6BD4
H8 499 T 8.50x50 FZD4 6BD4 FZD4 6BD4
H8 500 C 8.51x51 FZD4 6BD4 - -
H8 501 T 8.52x52 FZD4 6BD4 - -
H8 502 E 8.53x53 FZD4 6BD4 - -
H8 503 W 8.54x54 FZD4 6BD4 FZD4 6BD4
H8 504 A 8.55x55 FZD4 6BD4 - -
H8 505 G 8.56x56 FZD4 6BD4 - -
H8 506 F 8.57x57 FZD4 6BD4 FZD4 6BD4
H8 507 F 8.58x58 FZD4 6BD4 - -
H8 508 K 8.59x59 FZD4 6BD4 - -
H8 509 R 8.60x60 FZD4 6BD4 FZD4 6BD4
H8 510 N 8.61x61 FZD4 6BD4 - -
H8 511 R 8.62x62 FZD4 6BD4 - -
C-term 512 K - - - -
C-term 513 R - - - -
C-term 514 D - - - -
C-term 515 P - - - -
C-term 516 I - - - -