FZD6 homology model

PROTEIN CLASS

Class F (Frizzled)

RECEPTOR

FZD6

SPECIES

Homo sapiens

STATE

Inactive

VERSION

2021-02-08

MODEL

PDB file contains GPCRdb generic numbers in the B-factor field of CA atoms

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MAIN TEMPLATE

FZD5 (sequence similarity: 59%) PDB: 6WW2
Align

TEMPLATES

6WW2 (FZD5)
6BD4 (FZD4)
4JKV (SMO)
6XBM (SMO)
None
Main template (%) Additional templates (%) No template - freely modelled (%)
Backbone 75.8 8.5 15.7
Side-chains 36.6 11.8 51.7

Number of backbone templates: 4
Number of rotamer templates: 5

Segment Seq.num. AA GPCRdb# Backbone PDB Rotamer PDB
N-term 186 P FZD5 6WW2 FZD5 6WW2
N-term 187 N FZD5 6WW2 FZD5 6WW2
N-term 188 M FZD5 6WW2 FZD5 6WW2
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ECL3 469 A - - - -
ECL3 470 R - - - -
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TM7 491 V 7.53x53 FZD5 6WW2 - -
TM7 492 F 7.54x54 FZD5 6WW2 - -
TM7 493 W 7.55x55 FZD5 6WW2 FZD5 6WW2
TM7 494 V 7.56x56 FZD5 6WW2 SMO 5L7D
TM7 495 G 7.57x57 FZD5 6WW2 - -
H8 496 S 8.47x47 FZD5 6WW2 FZD5 6WW2
H8 497 K 8.48x48 FZD5 6WW2 SMO 5L7D
H8 498 K 8.49x49 FZD5 6WW2 FZD5 6WW2
H8 499 T 8.50x50 FZD5 6WW2 FZD5 6WW2
H8 500 C 8.51x51 FZD5 6WW2 - -
H8 501 T 8.52x52 FZD5 6WW2 - -
H8 502 E 8.53x53 FZD5 6WW2 - -
H8 503 W 8.54x54 FZD5 6WW2 FZD5 6WW2
H8 504 A 8.55x55 FZD5 6WW2 - -
H8 505 G 8.56x56 FZD5 6WW2 - -
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H8 507 F 8.58x58 FZD5 6WW2 - -
H8 508 K 8.59x59 FZD5 6WW2 - -
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H8 510 N 8.61x61 FZD4 6BD4 - -
H8 511 R 8.62x62 FZD4 6BD4 - -
C-term 512 K - - - -
C-term 513 R - - - -
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C-term 515 P - - - -
C-term 516 I - - - -