FZD6 homology model

PROTEIN CLASS

Class F (Frizzled)

RECEPTOR

FZD6

SPECIES

Homo sapiens

STATE

Inactive

VERSION

2021-06-10

MODEL

PDB file contains GPCRdb generic numbers in the B-factor field of CA atoms

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MAIN TEMPLATE

FZD5 (sequence similarity: 31%) PDB: 6WW2
Align

TEMPLATES

6WW2 (FZD5)
6BD4 (FZD4)
4N4W (SMO)
6O3C (SMO)
None
Main template (%) Additional templates (%) No template - freely modelled (%)
Backbone 75.8 8.5 15.7
Side-chains 36.6 11.8 51.7

Number of backbone templates: 4
Number of rotamer templates: 6

Segment Seq.num. AA GPCRdb# Backbone PDB Rotamer PDB
N-term 186 P - FZD5 6WW2 FZD5 6WW2
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TM7 488 I 7.50x50 FZD5 6WW2 FZD5 6WW2
TM7 489 S 7.51x51 FZD5 6WW2 SMO 6D32
TM7 490 A 7.52x52 FZD5 6WW2 - -
TM7 491 V 7.53x53 FZD5 6WW2 - -
TM7 492 F 7.54x54 FZD5 6WW2 - -
TM7 493 W 7.55x55 FZD5 6WW2 FZD5 6WW2
TM7 494 V 7.56x56 FZD5 6WW2 SMO 4N4W
TM7 495 G 7.57x57 FZD5 6WW2 - -
H8 496 S 8.47x47 FZD5 6WW2 FZD5 6WW2
H8 497 K 8.48x48 FZD5 6WW2 SMO 5V56
H8 498 K 8.49x49 FZD5 6WW2 FZD5 6WW2
H8 499 T 8.50x50 FZD5 6WW2 FZD5 6WW2
H8 500 C 8.51x51 FZD5 6WW2 - -
H8 501 T 8.52x52 FZD5 6WW2 - -
H8 502 E 8.53x53 FZD5 6WW2 - -
H8 503 W 8.54x54 FZD5 6WW2 FZD5 6WW2
H8 504 A 8.55x55 FZD5 6WW2 - -
H8 505 G 8.56x56 FZD5 6WW2 - -
H8 506 F 8.57x57 FZD5 6WW2 FZD5 6WW2
H8 507 F 8.58x58 FZD5 6WW2 - -
H8 508 K 8.59x59 FZD5 6WW2 - -
H8 509 R 8.60x60 FZD4 6BD4 FZD4 6BD4
H8 510 N 8.61x61 FZD4 6BD4 - -
H8 511 R 8.62x62 FZD4 6BD4 - -
C-term 512 K - - - - -
C-term 513 R - - - - -
C-term 514 D - - - - -
C-term 515 P - - - - -
C-term 516 I - - - - -