FZD8 homology model

PROTEIN CLASS

Class F (Frizzled)

RECEPTOR

SPECIES

Homo sapiens

STATE

Inactive

VERSION

2020-09-02

MODEL

PDB file contains GPCRdb generic numbers in the B-factor field of CA atoms

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MAIN TEMPLATE

FZD4 (sequence similarity: 61%) PDB: 6BD4

TEMPLATES

6BD4 (FZD4)
4JKV (SMO)
6OT0 (SMO)
None
Main template (%) Additional templates (%) No template - freely modelled (%)
Backbone 72.8 5.3 21.9
Side-chains 44.7 5.6 49.7

Number of backbone templates: 3
Number of rotamer templates: 4

Segment Seq.num. AA GPCRdb# Backbone PDB Rotamer PDB
N-term 265 H FZD4 6BD4 FZD4 6BD4
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TM7 588 L 7.40x40 FZD4 6BD4 FZD4 6BD4
TM7 589 K 7.41x41 FZD4 6BD4 FZD4 6BD4
TM7 590 Y 7.42x42 FZD4 6BD4 - -
TM7 591 F 7.43x43 FZD4 6BD4 FZD4 6BD4
TM7 592 M 7.44x44 FZD4 6BD4 FZD4 6BD4
TM7 593 C 7.45x45 FZD4 6BD4 - -
TM7 594 L 7.46x46 FZD4 6BD4 FZD4 6BD4
TM7 595 V 7.47x47 FZD4 6BD4 - -
TM7 596 V 7.48x48 FZD4 6BD4 FZD4 6BD4
TM7 597 G 7.49x49 FZD4 6BD4 FZD4 6BD4
TM7 598 I 7.50x50 FZD4 6BD4 FZD4 6BD4
TM7 599 T 7.51x51 FZD4 6BD4 FZD4 6BD4
TM7 600 S 7.52x52 FZD4 6BD4 FZD4 6BD4
TM7 601 G 7.53x53 FZD4 6BD4 FZD4 6BD4
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TM7 605 W 7.57x57 FZD4 6BD4 FZD4 6BD4
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C-term 622 W FZD4 6BD4 FZD4 6BD4
C-term 623 A - - - -
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C-term 626 G - - - -