FZD9 homology model

PROTEIN CLASS

Class F (Frizzled)

RECEPTOR

SPECIES

Homo sapiens

STATE

Active

VERSION

2020-10-08

MODEL

PDB file contains GPCRdb generic numbers in the B-factor field of CA atoms

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MAIN TEMPLATE

SMO (sequence similarity: 41%) PDB: 6XBM

TEMPLATES

6XBM (SMO)
4JKV (SMO)
6BD4 (FZD4)
None
Main template (%) Additional templates (%) No template - freely modelled (%)
Backbone 71.4 11.7 16.9
Side-chains 21.7 35.5 42.8

Number of backbone templates: 3
Number of rotamer templates: 4

Segment Seq.num. AA GPCRdb# Backbone PDB Rotamer PDB
N-term 219 V SMO 6XBM SMO 6XBM
N-term 220 E SMO 6XBM SMO 6XBM
N-term 221 V SMO 6XBM SMO 6XBM
N-term 222 F SMO 6XBM SMO 6XBM
N-term 223 W SMO 6XBM SMO 6XBM
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ECL1 290 Q - - - -
ECL1 291 S - - - -
ECL1 292 V - - - -
ECL1 293 A - - - -
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ECL1 296 Q - - - -
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ECL1 298 A - - - -
ECL1 299 G - - - -
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ECL1 301 L - - - -
ECL1 302 Y - - - -
ECL1 303 V - - - -
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ECL1 305 Q - - - -
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ECL1 307 G - - - -
ECL1 308 L - - - -
ECL1 309 E - - - -
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ICL3 435 G - - - -
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ICL3 438 T - - - -
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TM6 474 D 6.59x59 SMO 6XBM - -
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TM6 478 L 6.63x63 SMO 6XBM - -
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TM6 480 A 6.65x65 SMO 6XBM - -
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TM6 482 E 6.67x67 SMO 6XBM SMO 6D32
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TM6 484 P 6.69x69 SMO 6XBM - -
TM6 485 C 6.70x70 SMO 6XBM - -
TM6 486 A 6.71x71 SMO 6XBM - -
TM6 487 A 6.72x72 SMO 6XBM - -
TM6 488 A 6.73x73 SMO 6XBM SMO 6XBM
TM6 489 A 6.74x74 SMO 6XBM - -
ECL3 490 G - - - -
ECL3 491 P - - - -
ECL3 492 G - - - -
ECL3 493 G - - - -
ECL3 494 R - - - -
ECL3 495 R - - - -
ECL3 496 D - - - -
ECL3 497 C - - - -
ECL3 498 S - - - -
ECL3 499 L - - - -
ECL3 500 P - - - -
ECL3 501 G - - - -
ECL3 502 G - - - -
ECL3 503 S - - - -
ECL3 504 V - - - -
ECL3 505 P - - - -
TM7 506 T 7.34x34 FZD4 6BD4 - -
TM7 507 V 7.35x35 SMO 6XBM - -
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TM7 509 V 7.37x37 SMO 6XBM SMO 6XBM
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TM7 511 M 7.39x39 SMO 6XBM FZD4 6BD4
TM7 512 L 7.40x40 SMO 6XBM FZD4 6BD4
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TM7 514 I 7.42x42 SMO 6XBM FZD4 6BD4
TM7 515 F 7.43x43 SMO 6XBM SMO 6XBM
TM7 516 M 7.44x44 SMO 6XBM FZD4 6BD4
TM7 517 S 7.45x45 SMO 6XBM FZD4 6BD4
TM7 518 L 7.46x46 SMO 6XBM FZD4 6BD4
TM7 519 V 7.47x47 SMO 6XBM - -
TM7 520 V 7.48x48 SMO 6XBM FZD4 6BD4
TM7 521 G 7.49x49 SMO 6XBM SMO 6XBM
TM7 522 I 7.50x50 SMO 6XBM SMO 6XBM
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TM7 526 V 7.54x54 SMO 6XBM - -
TM7 527 W 7.55x55 FZD4 6BD4 FZD4 6BD4
TM7 528 V 7.56x56 FZD4 6BD4 SMO 6O3C
TM7 529 W 7.57x57 FZD4 6BD4 FZD4 6BD4
H8 530 S 8.47x47 FZD4 6BD4 FZD4 6BD4
H8 531 S 8.48x48 FZD4 6BD4 - -
H8 532 K 8.49x49 FZD4 6BD4 FZD4 6BD4
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H8 541 C 8.58x58 FZD4 6BD4 - -
H8 542 Y 8.59x59 FZD4 6BD4 - -
H8 543 R 8.60x60 FZD4 6BD4 FZD4 6BD4
H8 544 K 8.61x61 FZD4 6BD4 - -
H8 545 I 8.62x62 FZD4 6BD4 - -
C-term 546 A - - - -
C-term 547 A - - - -
C-term 548 G - - - -
C-term 549 R - - - -
C-term 550 A - - - -