FZD9 homology model

PROTEIN CLASS

Class F (Frizzled)

RECEPTOR

FZD9

SPECIES

Homo sapiens

STATE

Inactive

VERSION

2021-02-08

MODEL

PDB file contains GPCRdb generic numbers in the B-factor field of CA atoms

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MAIN TEMPLATE

FZD4 (sequence similarity: 76%) PDB: 6BD4
Align

TEMPLATES

6BD4 (FZD4)
4JKV (SMO)
6XBM (SMO)
None
Main template (%) Additional templates (%) No template - freely modelled (%)
Backbone 79.8 5.7 14.5
Side-chains 55.1 7.5 37.3

Number of backbone templates: 3
Number of rotamer templates: 5

Segment Seq.num. AA GPCRdb# Backbone PDB Rotamer PDB
N-term 219 V FZD4 6BD4 FZD4 6BD4
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TM7 519 V 7.47x47 FZD4 6BD4 FZD5 6WW2
TM7 520 V 7.48x48 FZD4 6BD4 FZD4 6BD4
TM7 521 G 7.49x49 FZD4 6BD4 FZD4 6BD4
TM7 522 I 7.50x50 FZD4 6BD4 FZD4 6BD4
TM7 523 T 7.51x51 FZD4 6BD4 FZD4 6BD4
TM7 524 S 7.52x52 FZD4 6BD4 FZD4 6BD4
TM7 525 G 7.53x53 FZD4 6BD4 FZD4 6BD4
TM7 526 V 7.54x54 FZD4 6BD4 FZD5 6WW2
TM7 527 W 7.55x55 FZD4 6BD4 FZD4 6BD4
TM7 528 V 7.56x56 FZD4 6BD4 SMO 5L7D
TM7 529 W 7.57x57 FZD4 6BD4 FZD4 6BD4
H8 530 S 8.47x47 FZD4 6BD4 FZD4 6BD4
H8 531 S 8.48x48 FZD4 6BD4 - -
H8 532 K 8.49x49 FZD4 6BD4 FZD4 6BD4
H8 533 T 8.50x50 FZD4 6BD4 FZD4 6BD4
H8 534 F 8.51x51 FZD4 6BD4 - -
H8 535 Q 8.52x52 FZD4 6BD4 - -
H8 536 T 8.53x53 FZD4 6BD4 FZD4 6BD4
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H8 538 Q 8.55x55 FZD4 6BD4 FZD4 6BD4
H8 539 S 8.56x56 FZD4 6BD4 - -
H8 540 L 8.57x57 FZD4 6BD4 - -
H8 541 C 8.58x58 FZD4 6BD4 - -
H8 542 Y 8.59x59 FZD4 6BD4 - -
H8 543 R 8.60x60 FZD4 6BD4 FZD4 6BD4
H8 544 K 8.61x61 FZD4 6BD4 - -
H8 545 I 8.62x62 FZD4 6BD4 - -
C-term 546 A FZD4 6BD4 FZD4 6BD4
C-term 547 A - - - -
C-term 548 G - - - -
C-term 549 R - - - -
C-term 550 A - - - -