GPR158 homology model

PROTEIN CLASS

Class C (Glutamate)

RECEPTOR

SPECIES

Homo sapiens

STATE

Active

VERSION

2021-04-08

MODEL

PDB file contains GPCRdb generic numbers in the B-factor field of CA atoms

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MAIN TEMPLATE

GABAB2 (sequence similarity: 14%) PDB: 7C7Q

TEMPLATES

7C7Q (GABAB2)
4OR2 (mGlu1 receptor)
4OO9 (mGlu5 receptor)
None
Main template (%) Additional templates (%) No template - freely modelled (%)
Backbone 86.4 3.9 9.8
Side-chains 61.5 7.5 31.0

Number of backbone templates: 3
Number of rotamer templates: 4

Segment Seq.num. AA GPCRdb# Backbone PDB Rotamer PDB
N-term 54 A - GABAB2 7C7Q GABAB2 7C7Q
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ECL2 547 S - - - - -
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TM7 668 S 7.53x53 GABAB2 7C7Q - -
TM7 669 H 7.54x54 GABAB2 7C7Q - -
TM7 670 S 7.55x55 GABAB2 7C7Q - -
TM7 671 S 7.56x56 GABAB2 7C7Q - -
TM7 672 N 7.57x57 mGlu1 receptor 4OR2 - -
TM7 673 N 7.58x58 mGlu1 receptor 4OR2 - -
H8 674 P 8.46x46 mGlu5 receptor 4OO9 mGlu5 receptor 6FFI
H8 675 R 8.47x47 mGlu5 receptor 4OO9 - -
H8 676 D 8.48x48 mGlu5 receptor 4OO9 - -
H8 677 D 8.49x49 mGlu5 receptor 4OO9 - -
H8 678 I 8.50x50 - - - -
H8 679 A 8.51x51 - - - -
H8 680 T 8.52x52 - - - -
H8 681 E 8.53x53 - - - -
H8 682 A 8.54x54 - - - -
H8 683 Y 8.55x55 - - - -
H8 684 E 8.56x56 - - - -
H8 685 D 8.57x57 - - - -
C-term 686 E - - - - -
C-term 687 L - - - - -
C-term 688 D - - - - -
C-term 689 M - - - - -
C-term 690 G - - - - -