GPR21 homology model

PROTEIN CLASS

Class A (Rhodopsin)

RECEPTOR

GPR21

SPECIES

Homo sapiens

STATE

Inactive

VERSION

2020-09-02

MODEL

Download

PDB file contains GPCRdb generic numbers in the B-factor field of CA atoms

NGL is a WebGL based 3D viewer powered by MMTF.

MAIN TEMPLATE

GPR52 (sequence similarity: 85%) PDB: 6LI1
Align

TEMPLATES

6LI1 (GPR52)
6LI3 (GPR52)
4PXZ (P2Y12 receptor)
4BUO (NTS1 receptor)
6BQH (5-HT2C receptor)
None
Main template (%) Additional templates (%) No template - freely modelled (%)
Backbone 82.6 3.9 13.5
Side-chains 59.4 21.6 19.0

Number of backbone templates: 5
Number of rotamer templates: 29

Segment Seq.num. AA GPCRdb# Backbone PDB Rotamer PDB
N-term 23 E GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
N-term 24 T GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
N-term 25 V GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
N-term 26 N GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
N-term 27 F GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM1 28 C 1.32x32 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM1 29 L 1.33x33 GPR52 6LI1 CB1 receptor 5U09
TM1 30 L 1.34x34 GPR52 6LI1 5-HT1B receptor 4IAQ
TM1 31 E 1.35x35 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM1 32 V 1.36x36 GPR52 6LI1 α2A-adrenoceptor 6KUX
TM1 33 L 1.37x37 GPR52 6LI1 5-HT2A receptor 6A94
TM1 34 I 1.38x38 GPR52 6LI1 A1 receptor 5UEN
TM1 35 I 1.39x39 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM1 36 V 1.40x40 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM1 37 F 1.41x41 GPR52 6LI1 MT1 receptor 6ME2
TM1 38 L 1.42x42 GPR52 6LI1 GPR52 6LI0
TM1 39 T 1.43x43 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM1 40 V 1.44x44 GPR52 6LI1 MT1 receptor 6ME2
TM1 41 L 1.45x45 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM1 42 I 1.46x46 GPR52 6LI1 GPR52 6LI0
TM1 43 I 1.47x47 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM1 44 S 1.48x48 GPR52 6LI1 Y1 receptor 5ZBH
TM1 45 G 1.49x49 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM1 46 N 1.50x50 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM1 47 I 1.51x51 GPR52 6LI1 5-HT2C receptor 6BQH
TM1 48 I 1.52x52 GPR52 6LI1 - -
TM1 49 V 1.53x53 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM1 50 I 1.54x54 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM1 51 F 1.55x55 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM1 52 V 1.56x56 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM1 53 F 1.57x57 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM1 54 H 1.58x58 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM1 55 C 1.59x59 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM1 56 A 1.60x60 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
ICL1 57 P 12.48x48 - - - -
ICL1 58 L 12.49x49 - - - -
ICL1 59 L 12.50x50 - - - -
ICL1 60 N 12.51x51 - - - -
TM2 61 H 2.36x36 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM2 62 H 2.37x37 GPR52 6LI1 - -
TM2 63 T 2.38x38 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM2 64 T 2.39x39 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM2 65 S 2.40x40 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM2 66 Y 2.41x41 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM2 67 F 2.42x42 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM2 68 I 2.43x43 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM2 69 Q 2.44x44 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM2 70 T 2.45x45 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM2 71 M 2.46x46 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM2 72 A 2.47x47 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM2 73 Y 2.48x48 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM2 74 A 2.49x49 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM2 75 D 2.50x50 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM2 76 L 2.51x51 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM2 77 F 2.52x52 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM2 78 V 2.53x53 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM2 79 G 2.54x54 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM2 80 V 2.55x55 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM2 81 S 2.56x56 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM2 82 C 2.57x57 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM2 83 V 2.58x58 GPR52 6LI1 CB1 receptor 5TGZ
TM2 84 V 2.59x59 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM2 85 P 2.60x60 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM2 86 S 2.61x61 GPR52 6LI1 μ receptor 4DKL
TM2 87 L 2.62x62 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM2 88 S 2.63x63 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM2 89 L 2.64x64 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM2 90 L 2.65x65 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM2 91 H 2.66x66 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
ECL1 92 H - - - -
ECL1 93 P P2Y12 receptor 4PXZ - -
ECL1 94 L - - - -
TM3 95 P 3.18x18 P2Y12 receptor 4PXZ - -
TM3 96 V 3.19x19 P2Y12 receptor 4PXZ GPR52 6LI3
TM3 97 E 3.20x20 P2Y12 receptor 4PXZ - -
TM3 98 E 3.21x21 GPR52 6LI1 GPR52 6LI2
TM3 99 S 3.22x22 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM3 100 L 3.23x23 GPR52 6LI1 GPR52 6LI0
TM3 101 T 3.24x24 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM3 102 C 3.25x25 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM3 103 Q 3.26x26 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM3 104 I 3.27x27 GPR52 6LI1 D2 receptor 6CM4
TM3 105 F 3.28x28 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM3 106 G 3.29x29 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM3 107 F 3.30x30 GPR52 6LI1 MT1 receptor 6ME2
TM3 108 V 3.31x31 GPR52 6LI1 ghrelin receptor 6KO5
TM3 109 V 3.32x32 GPR52 6LI1 A1 receptor 5UEN
TM3 110 S 3.33x33 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM3 111 V 3.34x34 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM3 112 L 3.35x35 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM3 113 K 3.36x36 GPR52 6LI1 GPR52 6LI0
TM3 114 S 3.37x37 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM3 115 V 3.38x38 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM3 116 S 3.39x39 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM3 117 M 3.40x40 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM3 118 A 3.41x41 GPR52 6LI1 LPA1 receptor 4Z35
TM3 119 S 3.42x42 GPR52 6LI1 H1 receptor 3RZE
TM3 120 L 3.43x43 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM3 121 A 3.44x44 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM3 122 C 3.45x45 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM3 123 I 3.46x46 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM3 124 S 3.47x47 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM3 125 I 3.48x48 GPR52 6LI1 MT1 receptor 6ME2
TM3 126 D 3.49x49 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM3 127 R 3.50x50 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM3 128 Y 3.51x51 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM3 129 I 3.52x52 GPR52 6LI1 A2A receptor 3VG9
TM3 130 A 3.53x53 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM3 131 I 3.54x54 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM3 132 T 3.55x55 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM3 133 K 3.56x56 GPR52 6LI1 GPR52 6LI0
ICL2 134 P 34.50x50 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
ICL2 135 L 34.51x51 GPR52 6LI1 GPR52 6LI0
ICL2 136 T 34.52x52 GPR52 6LI1 M3 receptor 5ZHP
ICL2 137 Y 34.53x53 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
ICL2 138 N 34.54x54 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
ICL2 139 T 34.55x55 GPR52 6LI1 CCR9 5LWE
ICL2 140 L 34.56x56 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
ICL2 141 V 34.57x57 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM4 142 T 4.38x38 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM4 143 P 4.39x39 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM4 144 W 4.40x40 GPR52 6LI1 MT2 receptor 6ME6
TM4 145 R 4.41x41 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM4 146 L 4.42x42 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM4 147 R 4.43x43 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM4 148 L 4.44x44 GPR52 6LI1 5-HT2A receptor 6A94
TM4 149 C 4.45x45 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM4 150 I 4.46x46 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM4 151 F 4.47x47 GPR52 6LI1 ghrelin receptor 6KO5
TM4 152 L 4.48x48 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM4 153 I 4.49x49 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM4 154 W 4.50x50 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM4 155 L 4.51x51 GPR52 6LI1 MT1 receptor 6ME2
TM4 156 Y 4.52x52 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM4 157 S 4.53x53 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM4 158 T 4.54x54 GPR52 6LI1 CCR7 6QZH
TM4 159 L 4.55x55 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM4 160 V 4.56x56 GPR52 6LI1 5-HT2C receptor 6BQH
TM4 161 F 4.57x57 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM4 162 L 4.58x59 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM4 163 P 4.59x60 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM4 164 S 4.60x61 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM4 165 F 4.61x62 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM4 166 F 4.62x63 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
ECL2 167 H GPR52 6LI1 - -
ECL2 168 W GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
ECL2 169 G GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
ECL2 170 K GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
ECL2 171 P GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
ECL2 172 G GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
ECL2 173 Y GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
ECL2 174 H GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
ECL2 175 G GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
ECL2 176 D GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
ECL2 177 V GPR52 6LI1 - -
ECL2 178 F GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
ECL2 179 Q GPR52 6LI1 - -
ECL2 180 W GPR52 6LI1 - -
ECL2 181 C 45.50x50 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
ECL2 182 A 45.51x51 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
ECL2 183 E 45.52x52 GPR52 6LI1 PAF receptor 5ZKQ
ECL2 184 S - - - -
ECL2 185 W NTS1 receptor 4BUO - -
ECL2 186 H - - - -
TM5 187 T 5.35x36 5-HT2C receptor 6BQH - -
TM5 188 D 5.36x37 GPR52 6LI1 - -
TM5 189 S 5.37x38 GPR52 6LI1 LPA1 receptor 4Z35
TM5 190 Y 5.38x39 GPR52 6LI1 GPR52 6LI0
TM5 191 F 5.39x40 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM5 192 T 5.40x41 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM5 193 L 5.41x42 GPR52 6LI1 Y1 receptor 5ZBH
TM5 194 F 5.42x43 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM5 195 I 5.43x44 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM5 196 V 5.44x45 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM5 197 M 5.45x46 GPR52 6LI1 NTS1 receptor 4BUO
TM5 198 M 5.46x461 GPR52 6LI1 P2Y1 receptor 4XNW
TM5 199 L 5.47x47 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM5 200 Y 5.48x48 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM5 201 A 5.49x49 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM5 202 P 5.50x50 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM5 203 A 5.51x51 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM5 204 A 5.52x52 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM5 205 L 5.53x53 GPR52 6LI1 H1 receptor 3RZE
TM5 206 I 5.54x54 GPR52 6LI1 CB1 receptor 5TGZ
TM5 207 V 5.55x55 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM5 208 C 5.56x56 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM5 209 F 5.57x57 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM5 210 T 5.58x58 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM5 211 Y 5.59x59 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM5 212 F 5.60x60 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM5 213 N 5.61x61 GPR52 6LI1 - -
TM5 214 I 5.62x62 GPR52 6LI1 GPR52 6LI0
TM5 215 F 5.63x63 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM5 216 R 5.64x64 GPR52 6LI1 Y1 receptor 5ZBH
TM5 217 I 5.65x65 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM5 218 C 5.66x66 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM5 219 Q 5.67x67 GPR52 6LI1 MT1 receptor 6ME2
TM5 220 Q 5.68x68 GPR52 6LI1 5-HT2C receptor 6BQH
TM5 221 H 5.69x69 GPR52 6LI3 GPR52 6LI3
TM5 222 T 5.70x70 GPR52 6LI3 GPR52 6LI3
TM5 223 K 5.71x71 GPR52 6LI3 GPR52 6LI3
TM5 224 D 5.72x72 GPR52 6LI3 - -
TM5 225 I 5.73x73 GPR52 6LI3 GPR52 6LI3
TM5 226 S 5.74x74 GPR52 6LI3 A2A receptor 3VG9
ICL3 227 E - - - -
ICL3 228 R - - - -
ICL3 229 Q - - - -
ICL3 230 A - - - -
ICL3 231 R - - - -
ICL3 233 S - - - -
ICL3 234 S - - - -
ICL3 235 Q - - - -
ICL3 236 S - - - -
ICL3 237 G - - - -
TM6 238 E 6.21x21 - - - -
TM6 239 T 6.22x22 - - - -
TM6 240 G 6.23x23 - - - -
TM6 241 E 6.24x24 - - - -
TM6 242 V 6.25x25 - - - -
TM6 243 Q 6.26x26 - - - -
TM6 244 A 6.27x27 - - - -
TM6 245 C 6.28x28 - - - -
TM6 246 P 6.29x29 - - - -
TM6 247 D 6.30x30 - - - -
TM6 248 K 6.31x31 - - - -
TM6 249 R 6.32x32 - - - -
TM6 250 Y 6.33x33 - - - -
TM6 251 A 6.34x34 - - - -
TM6 252 M 6.35x35 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM6 253 V 6.36x36 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM6 254 L 6.37x37 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM6 255 F 6.38x38 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM6 256 R 6.39x39 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM6 257 I 6.40x40 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM6 258 T 6.41x41 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM6 259 S 6.42x42 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM6 260 V 6.43x43 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM6 261 F 6.44x44 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM6 262 Y 6.45x45 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM6 263 I 6.46x46 GPR52 6LI1 5-HT2C receptor 6BQH
TM6 264 L 6.47x47 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM6 265 W 6.48x48 GPR52 6LI1 5-HT2C receptor 6BQH
TM6 266 L 6.49x49 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM6 267 P 6.50x50 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM6 268 Y 6.51x51 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM6 269 I 6.52x52 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM6 270 I 6.53x53 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM6 271 Y 6.54x54 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM6 272 F 6.55x55 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM6 273 L 6.56x56 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM6 274 L 6.57x57 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM6 275 E 6.58x58 GPR52 6LI1 GPR52 6LI0
TM6 276 S 6.59x59 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM6 277 S 6.60x60 GPR52 6LI1 GPR52 6LI0
TM6 278 T 6.61x61 - - - -
ECL3 279 G - - - -
ECL3 280 H - - - -
ECL3 281 S - - - -
ECL3 282 N - - - -
TM7 283 R 7.32x31 GPR52 6LI1 BLT1 receptor 5X33
TM7 284 F 7.33x32 GPR52 6LI1 S1P1 receptor 3V2Y
TM7 285 A 7.34x33 GPR52 6LI1 OX1 receptor 6TO7
TM7 286 S 7.35x34 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM7 287 F 7.36x35 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM7 288 L 7.37x36 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM7 289 T 7.38x37 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM7 290 T 7.39x38 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM7 291 W 7.40x39 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM7 292 L 7.41x40 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM7 293 A 7.42x41 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM7 294 I 7.43x42 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM7 295 S 7.44x43 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM7 296 N 7.45x45 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM7 297 S 7.46x46 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM7 298 F 7.47x47 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM7 299 C 7.48x48 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM7 300 N 7.49x49 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM7 301 C 7.50x50 GPR52 6LI1 - -
TM7 302 V 7.51x51 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM7 303 I 7.52x52 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM7 304 Y 7.53x53 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM7 305 S 7.54x54 GPR52 6LI1 LPA1 receptor 4Z35
TM7 306 L 7.55x55 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM7 307 S 7.56x56 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
H8 308 N 8.47x47 GPR52 6LI1 5-HT2C receptor 6BQH
H8 309 S 8.48x48 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
H8 310 V 8.49x49 GPR52 6LI1 GPR52 6LI3
H8 311 F 8.50x50 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
H8 312 Q 8.51x51 GPR52 6LI1 Y1 receptor 5ZBH
H8 313 R 8.52x52 GPR52 6LI1 5-HT2C receptor 6BQH
H8 314 G 8.53x53 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
H8 315 L 8.54x54 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
H8 316 K 8.55x55 GPR52 6LI1 H1 receptor 3RZE
H8 317 R 8.56x56 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
H8 318 L 8.57x57 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
H8 319 S 8.58x58 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
H8 320 G 8.59x59 GPR52 6LI1 ghrelin receptor 6KO5
H8 321 A 8.60x60 GPR52 6LI1 MT2 receptor 6ME6
H8 322 M 8.61x61 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
H8 323 C 8.62x62 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
H8 324 T 8.63x63 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
H8 325 S 8.64x64 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
H8 326 C 8.65x65 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
H8 327 A 8.66x66 GPR52 6LI1 - -
H8 328 S 8.67x67 GPR52 6LI1 - -
C-term 329 Q - - - -
C-term 330 T - - - -
C-term 331 T - - - -
C-term 332 A - - - -
C-term 333 N - - - -