mGlu7 receptor homology model

PROTEIN CLASS

Class C (Glutamate)

RECEPTOR

SPECIES

Homo sapiens

STATE

Active

VERSION

2021-06-10

MODEL

PDB file contains GPCRdb generic numbers in the B-factor field of CA atoms

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MAIN TEMPLATE

GABAB2 (sequence similarity: 18%) PDB: 7C7Q

TEMPLATES

7C7Q (GABAB2)
6FFI (mGlu5 receptor)
5CGD (mGlu5 receptor)
4OO9 (mGlu5 receptor)
None
Main template (%) Additional templates (%) No template - freely modelled (%)
Backbone 86.8 3.3 9.9
Side-chains 65.6 12.7 21.7

Number of backbone templates: 4
Number of rotamer templates: 7

Segment Seq.num. AA GPCRdb# Backbone PDB Rotamer PDB
N-term 54 L - GABAB2 7C7Q GABAB2 7C7Q
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TM5 771 T 5.55x55 GABAB2 7C7Q mGlu5 receptor 6FFI
TM5 772 V 5.56x56 GABAB2 7C7Q - -
TM5 773 Y 5.57x57 GABAB2 7C7Q mGlu5 receptor 6FFI
TM5 774 A 5.58x58 GABAB2 7C7Q GABAB2 7C7Q
TM5 775 I 5.59x59 GABAB2 7C7Q - -
TM5 776 K 5.60x60 GABAB2 7C7Q mGlu5 receptor 6FFI
TM5 777 T 5.61x61 GABAB2 7C7Q GABAB2 7C7Q
ICL3 778 R - - - - -
ICL3 779 G - mGlu5 receptor 5CGD - -
ICL3 780 V - mGlu5 receptor 5CGD mGlu5 receptor 5CGD
ICL3 781 P - mGlu5 receptor 5CGD mGlu5 receptor 5CGD
ICL3 782 E - mGlu5 receptor 5CGD - -
ICL3 783 N - mGlu5 receptor 5CGD mGlu5 receptor 5CGD
ICL3 784 F - mGlu5 receptor 5CGD mGlu5 receptor 5CGD
ICL3 785 N - - - - -
TM6 786 E 6.35x35 GABAB2 7C7Q mGlu5 receptor 6FFI
TM6 787 A 6.36x36 GABAB2 7C7Q mGlu5 receptor 6FFI
TM6 788 K 6.37x37 GABAB2 7C7Q GABAB2 7C7Q
TM6 789 P 6.38x38 GABAB2 7C7Q - -
TM6 790 I 6.39x39 GABAB2 7C7Q GABAB2 7C7Q
TM6 791 G 6.40x40 GABAB2 7C7Q GABAB2 7C7Q
TM6 792 F 6.41x41 GABAB2 7C7Q mGlu5 receptor 6FFI
TM6 793 T 6.42x42 GABAB2 7C7Q mGlu5 receptor 6FFI
TM6 794 M 6.43x43 GABAB2 7C7Q mGlu5 receptor 6FFI
TM6 795 Y 6.44x44 GABAB2 7C7Q GABAB2 7C7Q
TM6 796 T 6.45x45 GABAB2 7C7Q mGlu5 receptor 6FFI
TM6 797 T 6.46x46 GABAB2 7C7Q mGlu5 receptor 6FFI
TM6 798 C 6.47x47 GABAB2 7C7Q mGlu5 receptor 6FFI
TM6 799 I 6.48x48 GABAB2 7C7Q GABAB2 7C7Q
TM6 800 V 6.49x49 GABAB2 7C7Q - -
TM6 801 W 6.50x50 GABAB2 7C7Q mGlu5 receptor 6FFI
TM6 802 L 6.51x51 GABAB2 7C7Q GABAB1 6W2Y
TM6 803 A 6.52x52 GABAB2 7C7Q mGlu5 receptor 6FFI
TM6 804 F 6.53x53 GABAB2 7C7Q mGlu5 receptor 6FFI
TM6 805 I 6.54x54 GABAB2 7C7Q - -
TM6 806 P 6.55x55 GABAB2 7C7Q GABAB1 6W2Y
TM6 807 I 6.56x56 GABAB2 7C7Q mGlu5 receptor 6FFI
TM6 808 F 6.57x57 GABAB2 7C7Q - -
TM6 809 F 6.58x58 GABAB2 7C7Q GABAB2 7C7Q
TM6 810 G 6.59x59 GABAB2 7C7Q mGlu5 receptor 6FFI
TM6 811 T 6.60x60 GABAB2 7C7Q GABAB2 7C7Q
ECL3 812 A - - - - -
ECL3 813 Q - - - - -
ECL3 814 S - - - - -
ECL3 815 A - - - - -
ECL3 816 E - - - - -
ECL3 817 K - - - - -
ECL3 818 L - - - - -
ECL3 819 Y - - - - -
TM7 820 I 7.27x28 GABAB2 7C7Q - -
TM7 821 Q 7.28x29 GABAB2 7C7Q GABAB2 7C7Q
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TM7 824 T 7.31x32 GABAB2 7C7Q mGlu5 receptor 6FFI
TM7 825 L 7.32x33 GABAB2 7C7Q - -
TM7 826 T 7.33x34 GABAB2 7C7Q - -
TM7 827 I 7.34x35 GABAB2 7C7Q - -
TM7 828 S 7.35x36 GABAB2 7C7Q mGlu5 receptor 6FFI
TM7 829 M 7.36x37 GABAB2 7C7Q - -
TM7 830 N 7.37x38 GABAB2 7C7Q - -
TM7 831 L 7.38x39 GABAB2 7C7Q mGlu5 receptor 6FFI
TM7 832 S 7.39x40 GABAB2 7C7Q mGlu5 receptor 6FFI
TM7 833 A 7.40x41 GABAB2 7C7Q mGlu5 receptor 6FFI
TM7 834 S 7.41x42 GABAB2 7C7Q - -
TM7 835 V 7.42x43 GABAB2 7C7Q mGlu5 receptor 6FFI
TM7 836 A 7.43x44 GABAB2 7C7Q mGlu5 receptor 6FFI
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TM7 838 G 7.45x46 GABAB2 7C7Q mGlu5 receptor 6FFI
TM7 839 M 7.46x47 GABAB2 7C7Q - -
TM7 840 L 7.47x471 GABAB2 7C7Q GABAB1 6W2Y
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TM7 843 P 7.50x50 GABAB2 7C7Q GABAB2 7C7Q
TM7 844 K 7.51x51 GABAB2 7C7Q GABAB2 7C7Q
TM7 845 V 7.52x52 GABAB2 7C7Q mGlu5 receptor 6FFI
TM7 846 Y 7.53x53 GABAB2 7C7Q mGlu5 receptor 6FFI
TM7 847 I 7.54x54 GABAB2 7C7Q mGlu5 receptor 6FFI
TM7 848 I 7.55x55 GABAB2 7C7Q mGlu5 receptor 6FFI
TM7 849 I 7.56x56 GABAB2 7C7Q - -
TM7 850 F 7.57x57 mGlu5 receptor 4OO9 - -
TM7 851 H 7.58x58 mGlu5 receptor 4OO9 - -
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H8 856 V 8.50x50 - - - -
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C-term 864 K - - - - -
C-term 865 A - - - - -
C-term 866 V - - - - -
C-term 867 V - - - - -
C-term 868 T - - - - -