TAS1R1 homology model

PROTEIN CLASS

Class C (Glutamate)

RECEPTOR

SPECIES

Homo sapiens

STATE

Inactive

VERSION

2021-11-02

MODEL

PDB file contains GPCRdb generic numbers in the B-factor field of CA atoms

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MAIN TEMPLATE

CaS receptor (sequence similarity: 23%) PDB: 7DD5

TEMPLATES

7DD5 (CaS receptor)
7DD6 (CaS receptor)
7M3J (CaS receptor)
7E6U (CaS receptor)
7DTW (CaS receptor)
7M3F (CaS receptor)
4OR2 (mGlu1 receptor)
4OO9 (mGlu5 receptor)
None
Main template (%) Additional templates (%) No template - freely modelled (%)
Backbone 91.7 3.8 4.6
Side-chains 72.2 6.2 21.6

Number of backbone templates: 8
Number of rotamer templates: 13

Segment Seq.num. AA GPCRdb# Backbone PDB Rotamer PDB
N-term 20 A - CaS receptor 7DD5 CaS receptor 7DD5
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TM4 699 V 4.52x52 CaS receptor 7DD5 mGlu2 receptor 7EPE
TM4 700 V 4.53x53 CaS receptor 7DD6 mGlu2 receptor 7EPE
TM4 701 W 4.54x54 CaS receptor 7DD6 - -
ECL2 702 T - CaS receptor 7DD5 - -
ECL2 703 P - CaS receptor 7DD5 CaS receptor 7DD5
ECL2 704 L - CaS receptor 7DD5 - -
ECL2 705 P - CaS receptor 7DD5 - -
ECL2 706 A - CaS receptor 7DD5 - -
ECL2 707 R - CaS receptor 7DD5 CaS receptor 7DD5
ECL2 708 E - CaS receptor 7DD5 - -
ECL2 709 Y - CaS receptor 7DD5 - -
ECL2 710 Q - CaS receptor 7DD5 - -
ECL2 711 R - CaS receptor 7DD5 - -
ECL2 712 F - CaS receptor 7DD5 - -
ECL2 713 P - CaS receptor 7DD5 - -
ECL2 714 H - CaS receptor 7DD5 - -
ECL2 715 L - CaS receptor 7DD5 - -
ECL2 716 V - CaS receptor 7DD5 - -
ECL2 717 M - CaS receptor 7DD5 - -
ECL2 718 L - CaS receptor 7DD5 - -
ECL2 719 E - CaS receptor 7DD5 - -
ECL2 720 C 45.50x50 CaS receptor 7DD5 CaS receptor 7DD5
ECL2 721 T 45.51x51 CaS receptor 7DD5 - -
ECL2 722 E 45.52x52 CaS receptor 7DD5 CaS receptor 7E6T
ECL2 723 T - - - - -
ECL2 724 N - CaS receptor 7DD5 CaS receptor 7DD5
TM5 725 S 5.37x37 CaS receptor 7DD5 - -
TM5 726 L 5.38x38 CaS receptor 7DD5 mGlu1 receptor 4OR2
TM5 727 G 5.39x39 CaS receptor 7DD5 mGlu1 receptor 4OR2
TM5 728 F 5.40x40 CaS receptor 7DD5 - -
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TM5 733 L 5.45x45 CaS receptor 7DD5 - -
TM5 734 Y 5.46x46 CaS receptor 7DD5 CaS receptor 7DD5
TM5 735 N 5.47x47 CaS receptor 7DD5 mGlu1 receptor 4OR2
TM5 736 G 5.48x48 CaS receptor 7DD5 mGlu1 receptor 4OR2
TM5 737 L 5.49x49 CaS receptor 7DD5 CaS receptor 7DD5
TM5 738 L 5.50x50 CaS receptor 7DD5 CaS receptor 7DD5
TM5 739 S 5.51x51 CaS receptor 7DD5 - -
TM5 740 I 5.52x52 CaS receptor 7DD5 - -
TM5 741 S 5.53x53 CaS receptor 7DD5 mGlu1 receptor 4OR2
TM5 742 A 5.54x54 CaS receptor 7DD5 - -
TM5 743 F 5.55x55 CaS receptor 7DD5 CaS receptor 7DD5
TM5 744 A 5.56x56 CaS receptor 7DD5 - -
TM5 745 C 5.57x57 CaS receptor 7DD5 - -
TM5 746 S 5.58x58 CaS receptor 7DD5 - -
TM5 747 Y 5.59x59 CaS receptor 7DD5 - -
TM5 748 L 5.60x60 CaS receptor 7DD5 - -
TM5 749 G 5.61x61 CaS receptor 7DD5 - -
TM5 750 K 5.62x62 CaS receptor 7DD5 - -
TM5 751 D 5.63x63 CaS receptor 7DTW - -
TM5 752 L 5.64x64 CaS receptor 7DTW - -
ICL3 753 P - - - - -
ICL3 754 E - CaS receptor 7DTW - -
ICL3 755 N - CaS receptor 7DTW - -
ICL3 756 Y - - - - -
TM6 757 N 6.34x34 CaS receptor 7DD5 CaS receptor 7DD5
TM6 758 E 6.35x35 CaS receptor 7DD5 CaS receptor 7DD5
TM6 759 A 6.36x36 CaS receptor 7DD5 CaS receptor 7DD5
TM6 760 K 6.37x37 CaS receptor 7DD5 CaS receptor 7DD5
TM6 761 C 6.38x38 CaS receptor 7DD5 - -
TM6 762 V 6.39x39 CaS receptor 7DD5 - -
TM6 763 T 6.40x40 CaS receptor 7DD5 CaS receptor 7DD5
TM6 764 F 6.41x41 CaS receptor 7DD5 CaS receptor 7DD5
TM6 765 S 6.42x42 CaS receptor 7DD5 CaS receptor 7DD5
TM6 766 L 6.43x43 CaS receptor 7DD5 - -
TM6 767 L 6.44x44 CaS receptor 7DD5 CaS receptor 7DD5
TM6 768 F 6.45x45 CaS receptor 7DD5 - -
TM6 769 N 6.46x46 CaS receptor 7DD5 - -
TM6 770 F 6.47x47 CaS receptor 7DD5 CaS receptor 7DD5
TM6 771 V 6.48x48 CaS receptor 7DD5 GABAB1 6W2Y
TM6 772 S 6.49x49 CaS receptor 7DD5 - -
TM6 773 W 6.50x50 CaS receptor 7DD5 CaS receptor 7DD5
TM6 774 I 6.51x51 CaS receptor 7DD5 CaS receptor 7DD5
TM6 775 A 6.52x52 CaS receptor 7DD5 mGlu1 receptor 4OR2
TM6 776 F 6.53x53 CaS receptor 7DD5 CaS receptor 7DD5
TM6 777 F 6.54x54 CaS receptor 7DD5 - -
TM6 778 T 6.55x55 CaS receptor 7DD5 - -
TM6 779 T 6.56x56 CaS receptor 7DD5 - -
TM6 780 A 6.57x57 CaS receptor 7DD5 - -
TM6 781 S 6.58x58 CaS receptor 7DD5 - -
TM6 782 V 6.59x59 CaS receptor 7DD5 mGlu2 receptor 7EPE
TM6 783 Y 6.60x60 CaS receptor 7M3F - -
ECL3 784 D - - - - -
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TM7 786 K 7.26x27 CaS receptor 7DD5 CaS receptor 7DD5
TM7 787 Y 7.27x28 CaS receptor 7DD5 mGlu1 receptor 4OR2
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TM7 791 A 7.31x32 CaS receptor 7DD5 - -
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TM7 795 A 7.35x36 CaS receptor 7DD5 CaS receptor 7DD5
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TM7 797 L 7.37x38 CaS receptor 7DD5 CaS receptor 7DD5
TM7 798 S 7.38x39 CaS receptor 7DD5 - -
TM7 799 S 7.39x40 CaS receptor 7DD5 mGlu1 receptor 4OR2
TM7 800 L 7.40x41 CaS receptor 7DD5 - -
TM7 801 S 7.41x42 CaS receptor 7DD5 mGlu2 receptor 7EPE
TM7 802 S 7.42x43 CaS receptor 7DD5 - -
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TM7 804 F 7.44x45 CaS receptor 7DD5 - -
TM7 805 G 7.45x46 CaS receptor 7DD5 mGlu1 receptor 4OR2
TM7 806 G 7.46x47 CaS receptor 7DD5 - -
TM7 807 Y 7.47x471 CaS receptor 7DD5 - -
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TM7 810 P 7.50x50 CaS receptor 7DD5 mGlu1 receptor 4OR2
TM7 811 K 7.51x51 CaS receptor 7DD5 CaS receptor 7DD5
TM7 812 C 7.52x52 CaS receptor 7DD5 - -
TM7 813 Y 7.53x53 CaS receptor 7DD5 CaS receptor 7DD5
TM7 814 V 7.54x54 CaS receptor 7DD5 - -
TM7 815 I 7.55x55 CaS receptor 7DD5 CaS receptor 7DD5
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C-term 831 I - - - - -
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