TAS1R3 homology model

PROTEIN CLASS

Class C (Glutamate)

RECEPTOR

SPECIES

Homo sapiens

STATE

Active

VERSION

2021-05-12

MODEL

PDB file contains GPCRdb generic numbers in the B-factor field of CA atoms

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MAIN TEMPLATE

GABAB2 (sequence similarity: 16%) PDB: 7C7Q

TEMPLATES

7C7Q (GABAB2)
6FFI (mGlu5 receptor)
4OO9 (mGlu5 receptor)
7DTW (CaS receptor)
7DTU (CaS receptor)
None
Main template (%) Additional templates (%) No template - freely modelled (%)
Backbone 88.5 5.2 6.3
Side-chains 63.5 7.4 29.1

Number of backbone templates: 5
Number of rotamer templates: 6

Segment Seq.num. AA GPCRdb# Backbone PDB Rotamer PDB
N-term 54 R - GABAB2 7C7Q GABAB2 7C7Q
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N-term 355 G - GABAB2 7C7Q GABAB2 7C7Q
N-term 356 E - GABAB2 7C7Q GABAB2 7C7Q
N-term 357 R - GABAB2 7C7Q GABAB2 7C7Q
N-term 358 E - GABAB2 7C7Q GABAB2 7C7Q
N-term 359 Q - GABAB2 7C7Q GABAB2 7C7Q
N-term 360 G - GABAB2 7C7Q GABAB2 7C7Q
N-term 361 L - GABAB2 7C7Q GABAB2 7C7Q
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N-term 363 E - GABAB2 7C7Q GABAB2 7C7Q
N-term 364 D - GABAB2 7C7Q GABAB2 7C7Q
N-term 365 V - GABAB2 7C7Q GABAB2 7C7Q
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N-term 477 S - GABAB2 7C7Q GABAB2 7C7Q
N-term 561 F - - - - -
N-term 562 L - - - - -
N-term 563 A - - - - -
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N-term 565 G - - - - -
TM1 566 E 1.37x37 GABAB2 7C7Q - -
TM1 567 P 1.38x38 GABAB2 7C7Q GABAB2 7C7Q
TM1 568 A 1.39x39 GABAB2 7C7Q mGlu5 receptor 6FFI
TM1 569 V 1.40x40 GABAB2 7C7Q - -
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ICL1 594 R - - - - -
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ICL1 602 S 12.53x53 - - - -
TM2 603 G 2.35x35 GABAB2 7C7Q - -
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ECL1 626 G - - - - -
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ECL1 628 P - - - - -
TM3 629 S 3.26x25 GABAB2 7C7Q - -
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TM3 637 Q 3.34x34 GABAB2 7C7Q - -
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TM3 660 V 3.57x57 GABAB2 7C7Q - -
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ICL2 663 E - - - - -
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ICL2 673 S - - - - -
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ICL2 676 L - - - - -
TM4 677 R 4.28x28 mGlu5 receptor 6FFI - -
TM4 678 G 4.29x29 mGlu5 receptor 6FFI - -
TM4 679 P 4.30x30 mGlu5 receptor 6FFI - -
TM4 680 W 4.31x31 GABAB2 7C7Q - -
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TM4 689 M 4.40x40 GABAB2 7C7Q - -
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TM4 692 E 4.43x43 GABAB2 7C7Q - -
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TM4 699 Y 4.50x50 GABAB2 7C7Q - -
TM4 700 L 4.51x51 GABAB2 7C7Q - -
TM4 701 V 4.52x52 GABAB2 7C7Q - -
TM4 702 A 4.53x53 GABAB2 7C7Q - -
TM4 703 F 4.54x54 GABAB2 7C7Q - -
ECL2 704 P - - - - -
ECL2 705 P - CaS receptor 7DTU - -
ECL2 706 E - CaS receptor 7DTU - -
ECL2 707 V - CaS receptor 7DTU - -
ECL2 708 V - CaS receptor 7DTU - -
ECL2 709 T - CaS receptor 7DTU - -
ECL2 710 D - CaS receptor 7DTU - -
ECL2 711 W - CaS receptor 7DTU - -
ECL2 712 H - CaS receptor 7DTU - -
ECL2 713 M - CaS receptor 7DTU - -
ECL2 714 L - CaS receptor 7DTU - -
ECL2 715 P - CaS receptor 7DTU - -
ECL2 716 T - CaS receptor 7DTU - -
ECL2 717 E - CaS receptor 7DTU - -
ECL2 718 A - CaS receptor 7DTU - -
ECL2 719 L - CaS receptor 7DTU - -
ECL2 720 V - CaS receptor 7DTU - -
ECL2 721 H - - - - -
ECL2 722 C 45.50x50 GABAB2 7C7Q GABAB2 7C7Q
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ECL2 725 R - - - - -
ECL2 726 S - - - - -
TM5 727 W 5.37x37 GABAB2 7C7Q - -
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TM5 734 H 5.44x44 GABAB2 7C7Q - -
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TM5 737 N 5.47x47 GABAB2 7C7Q mGlu5 receptor 6FFI
TM5 738 A 5.48x48 GABAB2 7C7Q - -
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TM5 747 G 5.57x57 GABAB2 7C7Q - -
TM5 748 T 5.58x58 GABAB2 7C7Q - -
TM5 749 F 5.59x59 GABAB2 7C7Q mGlu5 receptor 6FFI
TM5 750 L 5.60x60 GABAB2 7C7Q - -
TM5 751 V 5.61x61 GABAB2 7C7Q - -
TM5 752 R 5.62x62 GABAB2 7C7Q GABAB2 7C7Q
TM5 753 S 5.63x63 GABAB2 7C7Q - -
TM5 754 Q 5.64x64 GABAB2 7C7Q - -
ICL3 755 P - - - - -
ICL3 756 G - CaS receptor 7DTW - -
ICL3 757 C - CaS receptor 7DTW - -
ICL3 758 Y - - - - -
TM6 759 N 6.34x34 CaS receptor 7DTU mGlu5 receptor 6FFI
TM6 760 R 6.35x35 GABAB2 7C7Q - -
TM6 761 A 6.36x36 GABAB2 7C7Q CaS receptor 7DTU
TM6 762 R 6.37x37 GABAB2 7C7Q - -
TM6 763 G 6.38x38 GABAB2 7C7Q - -
TM6 764 L 6.39x39 GABAB2 7C7Q - -
TM6 765 T 6.40x40 GABAB2 7C7Q - -
TM6 766 F 6.41x41 GABAB2 7C7Q mGlu5 receptor 6FFI
TM6 767 A 6.42x42 GABAB2 7C7Q GABAB1 6W2Y
TM6 768 M 6.43x43 GABAB2 7C7Q mGlu5 receptor 6FFI
TM6 769 L 6.44x44 GABAB2 7C7Q - -
TM6 770 A 6.45x45 GABAB2 7C7Q - -
TM6 771 Y 6.46x46 GABAB2 7C7Q - -
TM6 772 F 6.47x47 GABAB2 7C7Q - -
TM6 773 I 6.48x48 GABAB2 7C7Q GABAB2 7C7Q
TM6 774 T 6.49x49 GABAB2 7C7Q - -
TM6 775 W 6.50x50 GABAB2 7C7Q CaS receptor 7DTV
TM6 776 V 6.51x51 GABAB2 7C7Q - -
TM6 777 S 6.52x52 GABAB2 7C7Q - -
TM6 778 F 6.53x53 GABAB2 7C7Q CaS receptor 7DTV
TM6 779 V 6.54x54 GABAB2 7C7Q mGlu5 receptor 6FFI
TM6 780 P 6.55x55 GABAB2 7C7Q GABAB1 6W2Y
TM6 781 L 6.56x56 GABAB2 7C7Q - -
TM6 782 L 6.57x57 GABAB2 7C7Q - -
TM6 783 A 6.58x58 GABAB2 7C7Q CaS receptor 7DTU
TM6 784 N 6.59x59 GABAB2 7C7Q - -
TM6 785 V 6.60x60 GABAB2 7C7Q - -
ECL3 786 Q - - - - -
TM7 787 V 7.25x26 GABAB2 7C7Q - -
TM7 788 V 7.26x27 GABAB2 7C7Q - -
TM7 789 L 7.27x28 GABAB2 7C7Q - -
TM7 790 R 7.28x29 GABAB2 7C7Q - -
TM7 791 P 7.29x30 GABAB2 7C7Q - -
TM7 792 A 7.30x31 GABAB2 7C7Q GABAB1 6W2Y
TM7 793 V 7.31x32 GABAB2 7C7Q CaS receptor 7DTV
TM7 794 Q 7.32x33 GABAB2 7C7Q - -
TM7 795 M 7.33x34 GABAB2 7C7Q - -
TM7 796 G 7.34x35 GABAB2 7C7Q - -
TM7 797 A 7.35x36 GABAB2 7C7Q GABAB1 6W2Y
TM7 798 L 7.36x37 GABAB2 7C7Q - -
TM7 799 L 7.37x38 GABAB2 7C7Q CaS receptor 7DTV
TM7 800 L 7.38x39 GABAB2 7C7Q mGlu5 receptor 6FFI
TM7 801 C 7.39x40 GABAB2 7C7Q GABAB2 7C7Q
TM7 802 V 7.40x41 GABAB2 7C7Q mGlu1 receptor 4OR2
TM7 803 L 7.41x42 GABAB2 7C7Q - -
TM7 804 G 7.42x43 GABAB2 7C7Q CaS receptor 7DTU
TM7 805 I 7.43x44 GABAB2 7C7Q - -
TM7 806 L 7.44x45 GABAB2 7C7Q GABAB2 7C7Q
TM7 807 A 7.45x46 GABAB2 7C7Q CaS receptor 7DTU
TM7 808 A 7.46x47 GABAB2 7C7Q - -
TM7 809 F 7.47x471 GABAB2 7C7Q - -
TM7 810 H 7.48x48 GABAB2 7C7Q - -
TM7 811 L 7.49x49 GABAB2 7C7Q - -
TM7 812 P 7.50x50 GABAB2 7C7Q GABAB2 7C7Q
TM7 813 R 7.51x51 GABAB2 7C7Q - -
TM7 814 C 7.52x52 GABAB2 7C7Q - -
TM7 815 Y 7.53x53 GABAB2 7C7Q mGlu5 receptor 6FFI
TM7 816 L 7.54x54 GABAB2 7C7Q - -
TM7 817 L 7.55x55 GABAB2 7C7Q GABAB2 7C7Q
TM7 818 M 7.56x56 GABAB2 7C7Q - -
TM7 819 R 7.57x57 mGlu5 receptor 4OO9 - -
TM7 820 Q 7.58x58 mGlu5 receptor 4OO9 - -
H8 821 P 8.46x46 mGlu5 receptor 4OO9 mGlu5 receptor 6FFI
H8 822 G 8.47x47 mGlu5 receptor 4OO9 - -
H8 823 L 8.48x48 mGlu5 receptor 4OO9 - -
H8 824 N 8.49x49 mGlu5 receptor 4OO9 mGlu5 receptor 6FFI
H8 825 T 8.50x50 - - - -
H8 826 P 8.51x51 - - - -
H8 827 E 8.52x52 - - - -
H8 828 F 8.53x53 - - - -
H8 829 F 8.54x54 - - - -
H8 830 L 8.55x55 - - - -
H8 831 G 8.56x56 - - - -
H8 832 G 8.57x57 - - - -
C-term 833 G - - - - -
C-term 834 P - - - - -
C-term 835 G - - - - -
C-term 836 D - - - - -
C-term 837 A - - - - -